Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M2V0

Protein Details
Accession C5M2V0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MANRTKSNKRFKRRKPSFSEVKSDPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-15SNKRFKRRK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 10.5, cyto_nucl 8, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024061  NDT80_DNA-bd_dom  
IPR037141  NDT80_DNA-bd_dom_sf  
IPR008967  p53-like_TF_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
KEGG ctp:CTRG_00389  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05224  NDT80_PhoG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51517  NDT80  
Amino Acid Sequences MANRTKSNKRFKRRKPSFSEVKSDPVTLFSERKSRIAPRSGLQFKVGPLFQPTVQVSPLYIKEDNDQVVPRLESRIDRGFELIDGNWIGYKRNYISVVASFTFEKLGNSAKLLQQHGFYIITKNEMFDVKRFAIRLVGKSVEDGDDVSLIQNTAKRDKGPVVEPPVIPVIPGAIPEHIVIREGSNIRNQSRIKEFEQLFSQDWKSLRILQPNSVLKNYPVNENYTKVAKFERIQFTSVVRNKKSIYKNKRFILQIQLLAELDDIGTYAIIAISNTPPVFIRANGASRYESSSPMPNSNLPLDDISNTEVFDLKMKKPIISSNIPKNEYPPDLMIDKSPLAVPGCCIFNPFNGSEMTKENVLEPLFDLNIDDYNDDPESLNPRYFLEKSKVSKIHKLTSSYLNETFSSSFLRPTARGGIQIFDDNKKQNVDNNHDNTTTTNNTNCIAPYLLTNI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.94
2 0.93
3 0.93
4 0.92
5 0.88
6 0.86
7 0.78
8 0.75
9 0.66
10 0.58
11 0.48
12 0.4
13 0.36
14 0.31
15 0.32
16 0.28
17 0.34
18 0.34
19 0.37
20 0.4
21 0.45
22 0.49
23 0.54
24 0.54
25 0.51
26 0.59
27 0.61
28 0.58
29 0.53
30 0.47
31 0.4
32 0.42
33 0.38
34 0.29
35 0.27
36 0.28
37 0.25
38 0.29
39 0.29
40 0.25
41 0.25
42 0.24
43 0.21
44 0.22
45 0.24
46 0.23
47 0.23
48 0.22
49 0.24
50 0.28
51 0.28
52 0.27
53 0.26
54 0.23
55 0.24
56 0.24
57 0.23
58 0.21
59 0.22
60 0.21
61 0.25
62 0.3
63 0.28
64 0.28
65 0.28
66 0.26
67 0.24
68 0.24
69 0.18
70 0.14
71 0.12
72 0.12
73 0.13
74 0.12
75 0.14
76 0.12
77 0.16
78 0.15
79 0.2
80 0.21
81 0.2
82 0.23
83 0.23
84 0.26
85 0.23
86 0.22
87 0.18
88 0.17
89 0.18
90 0.15
91 0.13
92 0.11
93 0.15
94 0.14
95 0.15
96 0.18
97 0.18
98 0.23
99 0.25
100 0.25
101 0.22
102 0.22
103 0.22
104 0.21
105 0.19
106 0.18
107 0.16
108 0.18
109 0.17
110 0.17
111 0.17
112 0.18
113 0.19
114 0.17
115 0.22
116 0.2
117 0.22
118 0.22
119 0.21
120 0.25
121 0.27
122 0.27
123 0.26
124 0.26
125 0.24
126 0.24
127 0.24
128 0.18
129 0.15
130 0.13
131 0.09
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.07
138 0.09
139 0.11
140 0.15
141 0.16
142 0.17
143 0.19
144 0.22
145 0.25
146 0.25
147 0.29
148 0.32
149 0.35
150 0.34
151 0.33
152 0.32
153 0.28
154 0.25
155 0.18
156 0.12
157 0.08
158 0.09
159 0.08
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.11
169 0.12
170 0.13
171 0.17
172 0.21
173 0.21
174 0.27
175 0.28
176 0.28
177 0.32
178 0.36
179 0.33
180 0.37
181 0.37
182 0.33
183 0.35
184 0.33
185 0.29
186 0.28
187 0.26
188 0.21
189 0.2
190 0.2
191 0.19
192 0.22
193 0.23
194 0.28
195 0.29
196 0.29
197 0.36
198 0.38
199 0.38
200 0.33
201 0.31
202 0.24
203 0.28
204 0.26
205 0.23
206 0.2
207 0.23
208 0.24
209 0.25
210 0.25
211 0.23
212 0.22
213 0.18
214 0.19
215 0.17
216 0.18
217 0.24
218 0.29
219 0.28
220 0.29
221 0.29
222 0.3
223 0.35
224 0.38
225 0.37
226 0.31
227 0.32
228 0.32
229 0.4
230 0.47
231 0.49
232 0.55
233 0.59
234 0.66
235 0.67
236 0.71
237 0.64
238 0.58
239 0.56
240 0.49
241 0.41
242 0.34
243 0.32
244 0.26
245 0.24
246 0.21
247 0.12
248 0.07
249 0.04
250 0.04
251 0.03
252 0.03
253 0.02
254 0.02
255 0.02
256 0.03
257 0.03
258 0.04
259 0.04
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.1
265 0.11
266 0.1
267 0.12
268 0.13
269 0.16
270 0.17
271 0.19
272 0.17
273 0.18
274 0.22
275 0.2
276 0.2
277 0.18
278 0.23
279 0.23
280 0.25
281 0.26
282 0.23
283 0.24
284 0.24
285 0.22
286 0.17
287 0.17
288 0.15
289 0.14
290 0.13
291 0.13
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.14
298 0.16
299 0.16
300 0.22
301 0.23
302 0.24
303 0.25
304 0.3
305 0.31
306 0.36
307 0.42
308 0.45
309 0.52
310 0.53
311 0.52
312 0.5
313 0.49
314 0.42
315 0.38
316 0.29
317 0.24
318 0.23
319 0.23
320 0.21
321 0.19
322 0.17
323 0.15
324 0.14
325 0.13
326 0.13
327 0.13
328 0.13
329 0.13
330 0.15
331 0.14
332 0.17
333 0.15
334 0.17
335 0.21
336 0.2
337 0.19
338 0.18
339 0.19
340 0.18
341 0.21
342 0.2
343 0.17
344 0.17
345 0.16
346 0.18
347 0.17
348 0.16
349 0.14
350 0.14
351 0.13
352 0.13
353 0.12
354 0.09
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.09
359 0.12
360 0.13
361 0.13
362 0.13
363 0.13
364 0.18
365 0.2
366 0.21
367 0.18
368 0.2
369 0.25
370 0.26
371 0.29
372 0.31
373 0.36
374 0.4
375 0.49
376 0.56
377 0.56
378 0.63
379 0.64
380 0.66
381 0.64
382 0.64
383 0.58
384 0.59
385 0.6
386 0.57
387 0.53
388 0.46
389 0.41
390 0.38
391 0.35
392 0.27
393 0.25
394 0.2
395 0.2
396 0.19
397 0.23
398 0.21
399 0.24
400 0.3
401 0.27
402 0.31
403 0.3
404 0.3
405 0.29
406 0.35
407 0.34
408 0.32
409 0.36
410 0.35
411 0.37
412 0.39
413 0.38
414 0.38
415 0.44
416 0.48
417 0.52
418 0.54
419 0.55
420 0.53
421 0.52
422 0.47
423 0.44
424 0.4
425 0.34
426 0.31
427 0.28
428 0.29
429 0.3
430 0.28
431 0.25
432 0.21
433 0.18