Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C5M5D9

Protein Details
Accession C5M5D9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-49NSFTDSKKKNVIRAKPRVKSTPKIMEDHydrophilic
118-138ISDSKGKMKKHPKALPPSLSFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-41KKNVIRAKPRVK
Subcellular Location(s) mito 20.5, mito_nucl 13.5, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR033443  PPR_long  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG ctp:CTRG_02117  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17177  PPR_long  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MLRHTRNKCLSIIPRRYLFVPSNSFTDSKKKNVIRAKPRVKSTPKIMEDEAHQKKPQIDKSLIAKAKKDLRELRSLAKDVSEYIEPKDIDSLTTTKKISTELPPIDIDEATEDIFQEISDSKGKMKKHPKALPPSLSFPEKINQRLGLVSDLLVSRESTSNLPEKTRNDKWNILLTQLNAAGGFKELSEVDIRSFVNKIPLRSLRNLIPFIENMYHEAGVSVHYNTYYSFIRALSLGASISDTQIQVIEGYFNEIEKQTELKMDHYETKIAVYVKNKNKKKIEEVLGVMKAKNLPLSKSIYKSILSSYVYYTKDHRRAIEVFDSMKFLSESTKPDAKVYAQIIISCMMNDDIDKGLDLLQEMRDNNVKPNQSILSALAKGCARSRQHKFQAWNHLFQIYEYGWTPTLQTFEHMLYISAKDGDVELTRALFYKMLETNSVTPSAFISLMLAYANYQSPTSRTEPFLVSLTENGRLFKQNIMANVDFSKPIHGFPFLPTSRIPDGKFILAESSAIWAYTIMHNPSFVNNPHVAAPYLNIAYELGEFNDFKDRLNESTYLNDEGIPKVREIEIIEPNEETESPDSELQVVEPNENDTGLVKSPILNKLSGHLKDNRHKAPRDSMIYQIALDAAGKFKKFDFAQEIIKERGQFRKSNMFKKLSSKEQTKQDFQFAEKLVYCYVKMNLIEDAYSVVLSSVDRFPWGWKQLVPLNTAAINLGSSELAAAVRKIAQSNQVKHHGKIKSNDYKKYVMKRGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.63
3 0.61
4 0.58
5 0.53
6 0.5
7 0.48
8 0.43
9 0.43
10 0.44
11 0.44
12 0.4
13 0.45
14 0.42
15 0.42
16 0.49
17 0.5
18 0.56
19 0.65
20 0.73
21 0.74
22 0.8
23 0.83
24 0.81
25 0.85
26 0.86
27 0.84
28 0.82
29 0.81
30 0.8
31 0.74
32 0.71
33 0.65
34 0.58
35 0.56
36 0.58
37 0.56
38 0.52
39 0.49
40 0.47
41 0.51
42 0.57
43 0.59
44 0.56
45 0.51
46 0.52
47 0.57
48 0.64
49 0.64
50 0.58
51 0.53
52 0.53
53 0.59
54 0.57
55 0.59
56 0.57
57 0.57
58 0.63
59 0.63
60 0.64
61 0.62
62 0.6
63 0.52
64 0.45
65 0.4
66 0.32
67 0.32
68 0.27
69 0.21
70 0.21
71 0.27
72 0.25
73 0.25
74 0.27
75 0.23
76 0.2
77 0.22
78 0.24
79 0.22
80 0.27
81 0.27
82 0.25
83 0.25
84 0.27
85 0.28
86 0.31
87 0.36
88 0.33
89 0.36
90 0.35
91 0.36
92 0.35
93 0.3
94 0.24
95 0.16
96 0.14
97 0.12
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.09
106 0.13
107 0.13
108 0.18
109 0.23
110 0.27
111 0.35
112 0.46
113 0.52
114 0.59
115 0.67
116 0.72
117 0.78
118 0.84
119 0.83
120 0.76
121 0.74
122 0.68
123 0.62
124 0.54
125 0.45
126 0.43
127 0.4
128 0.38
129 0.36
130 0.33
131 0.3
132 0.31
133 0.3
134 0.25
135 0.2
136 0.16
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.13
145 0.12
146 0.16
147 0.21
148 0.23
149 0.26
150 0.29
151 0.33
152 0.41
153 0.48
154 0.52
155 0.52
156 0.55
157 0.55
158 0.59
159 0.54
160 0.48
161 0.42
162 0.36
163 0.33
164 0.28
165 0.24
166 0.15
167 0.14
168 0.11
169 0.1
170 0.09
171 0.06
172 0.07
173 0.06
174 0.08
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.14
182 0.13
183 0.21
184 0.23
185 0.24
186 0.29
187 0.35
188 0.39
189 0.42
190 0.45
191 0.41
192 0.45
193 0.45
194 0.39
195 0.34
196 0.29
197 0.28
198 0.27
199 0.21
200 0.17
201 0.18
202 0.16
203 0.13
204 0.13
205 0.11
206 0.1
207 0.11
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.11
245 0.08
246 0.12
247 0.13
248 0.14
249 0.17
250 0.19
251 0.23
252 0.23
253 0.24
254 0.2
255 0.2
256 0.21
257 0.19
258 0.2
259 0.19
260 0.28
261 0.36
262 0.46
263 0.5
264 0.56
265 0.62
266 0.64
267 0.67
268 0.66
269 0.63
270 0.58
271 0.56
272 0.53
273 0.49
274 0.45
275 0.37
276 0.3
277 0.24
278 0.19
279 0.2
280 0.16
281 0.14
282 0.16
283 0.22
284 0.24
285 0.26
286 0.28
287 0.26
288 0.26
289 0.25
290 0.23
291 0.21
292 0.19
293 0.17
294 0.17
295 0.21
296 0.22
297 0.22
298 0.26
299 0.3
300 0.35
301 0.37
302 0.36
303 0.34
304 0.34
305 0.37
306 0.37
307 0.3
308 0.25
309 0.23
310 0.24
311 0.19
312 0.18
313 0.14
314 0.1
315 0.1
316 0.11
317 0.14
318 0.18
319 0.22
320 0.21
321 0.22
322 0.23
323 0.21
324 0.24
325 0.21
326 0.2
327 0.17
328 0.16
329 0.16
330 0.16
331 0.15
332 0.1
333 0.09
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.08
348 0.09
349 0.1
350 0.13
351 0.13
352 0.16
353 0.2
354 0.2
355 0.18
356 0.2
357 0.19
358 0.17
359 0.17
360 0.15
361 0.13
362 0.13
363 0.13
364 0.13
365 0.12
366 0.13
367 0.13
368 0.17
369 0.18
370 0.25
371 0.32
372 0.39
373 0.46
374 0.51
375 0.56
376 0.56
377 0.65
378 0.59
379 0.56
380 0.47
381 0.42
382 0.36
383 0.3
384 0.26
385 0.15
386 0.13
387 0.1
388 0.11
389 0.1
390 0.1
391 0.11
392 0.08
393 0.1
394 0.09
395 0.09
396 0.1
397 0.1
398 0.11
399 0.1
400 0.1
401 0.09
402 0.1
403 0.09
404 0.08
405 0.07
406 0.06
407 0.06
408 0.07
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.1
419 0.11
420 0.12
421 0.13
422 0.14
423 0.16
424 0.16
425 0.18
426 0.14
427 0.12
428 0.11
429 0.11
430 0.1
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.05
437 0.04
438 0.05
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.08
444 0.12
445 0.15
446 0.16
447 0.18
448 0.2
449 0.2
450 0.22
451 0.22
452 0.19
453 0.16
454 0.16
455 0.15
456 0.17
457 0.16
458 0.16
459 0.15
460 0.17
461 0.18
462 0.17
463 0.21
464 0.19
465 0.21
466 0.26
467 0.25
468 0.23
469 0.24
470 0.23
471 0.18
472 0.17
473 0.18
474 0.13
475 0.13
476 0.13
477 0.14
478 0.14
479 0.15
480 0.24
481 0.21
482 0.22
483 0.21
484 0.25
485 0.28
486 0.31
487 0.29
488 0.24
489 0.26
490 0.26
491 0.26
492 0.2
493 0.18
494 0.14
495 0.13
496 0.09
497 0.09
498 0.08
499 0.07
500 0.07
501 0.06
502 0.07
503 0.1
504 0.13
505 0.13
506 0.13
507 0.14
508 0.14
509 0.16
510 0.19
511 0.17
512 0.19
513 0.18
514 0.19
515 0.19
516 0.2
517 0.19
518 0.15
519 0.15
520 0.13
521 0.12
522 0.11
523 0.1
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.09
528 0.07
529 0.08
530 0.08
531 0.09
532 0.17
533 0.17
534 0.16
535 0.2
536 0.21
537 0.21
538 0.25
539 0.25
540 0.19
541 0.23
542 0.25
543 0.23
544 0.21
545 0.21
546 0.19
547 0.19
548 0.23
549 0.2
550 0.18
551 0.17
552 0.17
553 0.17
554 0.18
555 0.22
556 0.23
557 0.24
558 0.25
559 0.23
560 0.24
561 0.23
562 0.21
563 0.17
564 0.12
565 0.12
566 0.14
567 0.14
568 0.14
569 0.13
570 0.13
571 0.12
572 0.16
573 0.15
574 0.14
575 0.13
576 0.15
577 0.15
578 0.15
579 0.14
580 0.09
581 0.11
582 0.11
583 0.11
584 0.1
585 0.13
586 0.17
587 0.23
588 0.23
589 0.23
590 0.22
591 0.26
592 0.34
593 0.33
594 0.34
595 0.36
596 0.43
597 0.51
598 0.6
599 0.63
600 0.63
601 0.66
602 0.66
603 0.68
604 0.68
605 0.66
606 0.59
607 0.55
608 0.51
609 0.47
610 0.42
611 0.33
612 0.24
613 0.17
614 0.15
615 0.11
616 0.1
617 0.12
618 0.13
619 0.13
620 0.14
621 0.21
622 0.2
623 0.26
624 0.29
625 0.3
626 0.38
627 0.42
628 0.46
629 0.42
630 0.44
631 0.42
632 0.38
633 0.44
634 0.4
635 0.4
636 0.42
637 0.49
638 0.55
639 0.6
640 0.66
641 0.62
642 0.62
643 0.68
644 0.69
645 0.68
646 0.69
647 0.68
648 0.67
649 0.71
650 0.75
651 0.73
652 0.69
653 0.66
654 0.6
655 0.55
656 0.54
657 0.46
658 0.43
659 0.38
660 0.36
661 0.31
662 0.3
663 0.28
664 0.24
665 0.23
666 0.23
667 0.22
668 0.22
669 0.22
670 0.21
671 0.2
672 0.17
673 0.17
674 0.12
675 0.11
676 0.1
677 0.07
678 0.07
679 0.07
680 0.1
681 0.11
682 0.11
683 0.12
684 0.13
685 0.17
686 0.25
687 0.29
688 0.29
689 0.28
690 0.34
691 0.39
692 0.42
693 0.41
694 0.34
695 0.32
696 0.3
697 0.29
698 0.23
699 0.17
700 0.13
701 0.11
702 0.1
703 0.07
704 0.06
705 0.06
706 0.06
707 0.07
708 0.07
709 0.07
710 0.08
711 0.11
712 0.13
713 0.15
714 0.17
715 0.26
716 0.35
717 0.42
718 0.48
719 0.57
720 0.59
721 0.6
722 0.66
723 0.64
724 0.62
725 0.63
726 0.66
727 0.66
728 0.71
729 0.76
730 0.73
731 0.74
732 0.75
733 0.77