Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C5M521

Protein Details
Accession C5M521    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-34MVSVRKRKMARSSVKKNTRRTKDRQRNINVYSNPHydrophilic
71-94VSLSEIQKKREKKNKNNSNKDIPSHydrophilic
208-227QHTAGELKRKINKWKKSNGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-22RKRKMARSSVKKNTRRTK
79-83KREKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019002  Ribosome_biogenesis_Nop16  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
KEGG ctp:CTRG_01999  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09420  Nop16  
Amino Acid Sequences MVSVRKRKMARSSVKKNTRRTKDRQRNINVYSNPIIAANWDKSLTLKQNYKKLGLRAKLGTSAGGDEKKVVSLSEIQKKREKKNKNNSNKDIPSIDEIENLDDPSKIPEGEARLIRDPETNEVVKVIYGTMKVNDDEDDEDDEDDELEKDAENPSVVEQLEEYAQKHSKIKKERHLSERESDWLKSLYEKYGDDFEKMKWDKKLNIYQHTAGELKRKINKWKKSNGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.89
3 0.9
4 0.9
5 0.9
6 0.88
7 0.88
8 0.88
9 0.89
10 0.91
11 0.91
12 0.89
13 0.88
14 0.84
15 0.84
16 0.74
17 0.69
18 0.61
19 0.51
20 0.42
21 0.33
22 0.26
23 0.19
24 0.22
25 0.17
26 0.16
27 0.16
28 0.16
29 0.17
30 0.23
31 0.27
32 0.29
33 0.36
34 0.4
35 0.48
36 0.51
37 0.56
38 0.55
39 0.56
40 0.58
41 0.54
42 0.53
43 0.49
44 0.47
45 0.45
46 0.4
47 0.33
48 0.24
49 0.22
50 0.2
51 0.18
52 0.16
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.11
58 0.09
59 0.15
60 0.21
61 0.3
62 0.34
63 0.37
64 0.44
65 0.51
66 0.59
67 0.62
68 0.66
69 0.67
70 0.74
71 0.81
72 0.86
73 0.9
74 0.87
75 0.87
76 0.79
77 0.71
78 0.6
79 0.51
80 0.43
81 0.35
82 0.29
83 0.2
84 0.18
85 0.17
86 0.16
87 0.15
88 0.12
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.11
97 0.14
98 0.16
99 0.16
100 0.18
101 0.18
102 0.19
103 0.19
104 0.17
105 0.17
106 0.18
107 0.16
108 0.14
109 0.14
110 0.13
111 0.11
112 0.1
113 0.08
114 0.05
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.08
132 0.07
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.13
151 0.15
152 0.17
153 0.23
154 0.28
155 0.35
156 0.44
157 0.52
158 0.58
159 0.67
160 0.73
161 0.77
162 0.79
163 0.76
164 0.72
165 0.67
166 0.62
167 0.55
168 0.46
169 0.4
170 0.33
171 0.28
172 0.26
173 0.25
174 0.23
175 0.22
176 0.23
177 0.23
178 0.28
179 0.29
180 0.27
181 0.27
182 0.24
183 0.32
184 0.34
185 0.37
186 0.37
187 0.42
188 0.46
189 0.54
190 0.63
191 0.61
192 0.67
193 0.67
194 0.64
195 0.6
196 0.57
197 0.5
198 0.43
199 0.43
200 0.39
201 0.41
202 0.46
203 0.5
204 0.58
205 0.65
206 0.74
207 0.74