Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C5M3H0

Protein Details
Accession C5M3H0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
581-607KLVNLKIDSVKQKRRNKEGLKTNDFNFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG ctp:CTRG_00609  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MSAFAALKGNSNGGSIFSTLNNSEEEQEDDEGLIQYQANSSDEEINDDEDKEDSPDYGLLLPVQQKETSTSSTPIVQTARITISNFIPTQENLQFNENSVIVTLNDPLEYLLISGQCKIKILSGEIKLNNCHVLKAGDVSYDLIGLQSQSLPIIAYHNQQSTFELINLYNGLENIGKVCKPLKNIVKHEENQDQSFKNYSFEIVFNDNNGVCGLDINPTWIDELNSLKECYQPLKIMIIGNKNTGKSTFCKTLLNELLLEVPQSRVDYLDLDPGQSEYSHPYTLSLSKINQLQFGFNSSSTNIGKDKKYDHYFGFTSSIHSPTRYMKIIEDLYSKYDGKNHLIINTPGYIKGFGKELLNEITKLIQPDKLIILSNNLNIEYPDNVYLLQDLQYYDVKILPGIYQLSKYSAPEIRSINKLLYFHASPQAQGMFDFSKRLLDASPLKLSYNCPSQSSSTTGIVSSVTVLNFDIPKDFDICSLMEVSICGVYLTKQSLVTPQSPTNPNHPYFLNQKDFDKVFTVDSEFGGLVIIHSINPQSHYMNIYAPDSVVQKLQKGIKQGYSIMIVRGDGEVPSCEVLHPKLVNLKIDSVKQKRRNKEGLKTNDFNFPYVNFEEKRMKIGGIWKVRKNIMRRSHNHQRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.14
3 0.14
4 0.13
5 0.16
6 0.16
7 0.17
8 0.18
9 0.17
10 0.18
11 0.18
12 0.2
13 0.19
14 0.2
15 0.19
16 0.17
17 0.17
18 0.16
19 0.14
20 0.12
21 0.1
22 0.09
23 0.1
24 0.12
25 0.11
26 0.12
27 0.14
28 0.17
29 0.17
30 0.21
31 0.2
32 0.22
33 0.22
34 0.22
35 0.2
36 0.16
37 0.17
38 0.15
39 0.15
40 0.12
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.1
47 0.13
48 0.18
49 0.19
50 0.21
51 0.2
52 0.2
53 0.24
54 0.27
55 0.28
56 0.27
57 0.26
58 0.26
59 0.3
60 0.29
61 0.29
62 0.27
63 0.24
64 0.22
65 0.23
66 0.24
67 0.22
68 0.23
69 0.21
70 0.22
71 0.25
72 0.25
73 0.23
74 0.23
75 0.21
76 0.26
77 0.29
78 0.29
79 0.26
80 0.3
81 0.29
82 0.28
83 0.3
84 0.24
85 0.19
86 0.16
87 0.15
88 0.11
89 0.12
90 0.12
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.09
100 0.09
101 0.12
102 0.15
103 0.15
104 0.16
105 0.17
106 0.18
107 0.18
108 0.22
109 0.26
110 0.28
111 0.35
112 0.37
113 0.39
114 0.37
115 0.37
116 0.39
117 0.32
118 0.27
119 0.22
120 0.19
121 0.17
122 0.19
123 0.18
124 0.13
125 0.13
126 0.14
127 0.12
128 0.11
129 0.1
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.09
141 0.1
142 0.13
143 0.17
144 0.2
145 0.2
146 0.21
147 0.22
148 0.22
149 0.21
150 0.18
151 0.16
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.13
156 0.1
157 0.09
158 0.1
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.15
166 0.17
167 0.2
168 0.29
169 0.35
170 0.43
171 0.49
172 0.55
173 0.59
174 0.59
175 0.63
176 0.61
177 0.56
178 0.5
179 0.48
180 0.42
181 0.35
182 0.36
183 0.3
184 0.24
185 0.21
186 0.19
187 0.16
188 0.16
189 0.17
190 0.17
191 0.17
192 0.16
193 0.18
194 0.16
195 0.15
196 0.14
197 0.11
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.09
210 0.11
211 0.13
212 0.14
213 0.15
214 0.14
215 0.16
216 0.17
217 0.18
218 0.18
219 0.16
220 0.16
221 0.17
222 0.18
223 0.18
224 0.21
225 0.25
226 0.24
227 0.27
228 0.28
229 0.27
230 0.26
231 0.25
232 0.23
233 0.2
234 0.24
235 0.25
236 0.24
237 0.27
238 0.27
239 0.34
240 0.34
241 0.32
242 0.27
243 0.22
244 0.21
245 0.18
246 0.17
247 0.09
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.09
256 0.14
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.11
263 0.11
264 0.09
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.13
270 0.14
271 0.16
272 0.14
273 0.13
274 0.15
275 0.2
276 0.19
277 0.21
278 0.2
279 0.19
280 0.17
281 0.19
282 0.18
283 0.14
284 0.14
285 0.11
286 0.14
287 0.13
288 0.15
289 0.15
290 0.17
291 0.18
292 0.19
293 0.22
294 0.27
295 0.3
296 0.31
297 0.3
298 0.31
299 0.3
300 0.29
301 0.29
302 0.21
303 0.21
304 0.19
305 0.21
306 0.16
307 0.16
308 0.17
309 0.16
310 0.2
311 0.18
312 0.18
313 0.15
314 0.19
315 0.2
316 0.2
317 0.19
318 0.16
319 0.17
320 0.19
321 0.19
322 0.15
323 0.17
324 0.18
325 0.18
326 0.22
327 0.2
328 0.2
329 0.22
330 0.22
331 0.2
332 0.2
333 0.18
334 0.14
335 0.14
336 0.13
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.11
344 0.13
345 0.14
346 0.13
347 0.12
348 0.13
349 0.13
350 0.14
351 0.13
352 0.12
353 0.11
354 0.12
355 0.13
356 0.12
357 0.12
358 0.11
359 0.13
360 0.13
361 0.14
362 0.13
363 0.13
364 0.12
365 0.11
366 0.12
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.07
387 0.08
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.11
392 0.13
393 0.14
394 0.14
395 0.16
396 0.18
397 0.19
398 0.22
399 0.25
400 0.25
401 0.27
402 0.28
403 0.26
404 0.25
405 0.24
406 0.21
407 0.22
408 0.2
409 0.19
410 0.24
411 0.22
412 0.19
413 0.21
414 0.2
415 0.16
416 0.15
417 0.16
418 0.12
419 0.12
420 0.13
421 0.12
422 0.12
423 0.12
424 0.13
425 0.11
426 0.14
427 0.19
428 0.22
429 0.25
430 0.24
431 0.25
432 0.26
433 0.28
434 0.27
435 0.3
436 0.27
437 0.25
438 0.26
439 0.28
440 0.29
441 0.31
442 0.3
443 0.24
444 0.23
445 0.21
446 0.19
447 0.17
448 0.14
449 0.12
450 0.1
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.09
455 0.1
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.11
460 0.12
461 0.12
462 0.11
463 0.12
464 0.12
465 0.11
466 0.12
467 0.1
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.07
472 0.07
473 0.06
474 0.05
475 0.06
476 0.08
477 0.1
478 0.11
479 0.11
480 0.12
481 0.17
482 0.21
483 0.23
484 0.25
485 0.26
486 0.32
487 0.37
488 0.39
489 0.42
490 0.45
491 0.44
492 0.42
493 0.4
494 0.37
495 0.39
496 0.45
497 0.45
498 0.4
499 0.4
500 0.43
501 0.43
502 0.4
503 0.36
504 0.29
505 0.23
506 0.23
507 0.24
508 0.19
509 0.18
510 0.18
511 0.14
512 0.13
513 0.12
514 0.1
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.06
519 0.07
520 0.08
521 0.09
522 0.11
523 0.14
524 0.14
525 0.15
526 0.17
527 0.18
528 0.19
529 0.2
530 0.19
531 0.17
532 0.16
533 0.16
534 0.16
535 0.16
536 0.17
537 0.17
538 0.18
539 0.23
540 0.29
541 0.3
542 0.35
543 0.39
544 0.39
545 0.41
546 0.4
547 0.37
548 0.36
549 0.34
550 0.29
551 0.25
552 0.2
553 0.18
554 0.17
555 0.15
556 0.1
557 0.11
558 0.1
559 0.11
560 0.12
561 0.11
562 0.11
563 0.14
564 0.15
565 0.2
566 0.2
567 0.21
568 0.28
569 0.31
570 0.35
571 0.34
572 0.39
573 0.37
574 0.43
575 0.51
576 0.53
577 0.61
578 0.66
579 0.73
580 0.77
581 0.83
582 0.86
583 0.86
584 0.86
585 0.86
586 0.87
587 0.87
588 0.82
589 0.75
590 0.73
591 0.65
592 0.55
593 0.47
594 0.37
595 0.33
596 0.31
597 0.35
598 0.27
599 0.31
600 0.39
601 0.38
602 0.42
603 0.37
604 0.35
605 0.32
606 0.39
607 0.43
608 0.45
609 0.53
610 0.54
611 0.6
612 0.66
613 0.69
614 0.69
615 0.7
616 0.69
617 0.72
618 0.72
619 0.74