FuNGI

C5MHT9

Protein Details

Accession

C5MHT9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-42	AYLVTSNDFKKQRKRVNRQLKNLRHELG	Hydrophilic
525-545	LDKSKERKPVAQQPQQPQQEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR026258 SRP68 IPR034652 SRP68-RBD IPR038253 SRP68_N_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0030942 F:endoplasmic reticulum signal peptide binding GO:0005047 F:signal recognition particle binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
KEGG	ctp:CTRG_05632 -
Pfam	View protein in Pfam PF16969 SRP68
CDD	cd15481 SRP68-RBD

Amino Acid Sequences

MDSPLSNTLGARMSAYLVTSNDFKKQRKRVNRQLKNLRHELGLINSNTKKYEFPKLSPEQYNSNKKSGLVYLFLAERDILYGLEIKNLMEIDEKSKKNYKNLMITKFKRSLNHAVDLLDLTKDETNSNIRIELFIYTALIVGQLSIIQKKWSKVLNSFSIAKCCLDYLYDQDQTINEGDEENQEESFSKTLYAELNETLVDPSLKLAINQLDLHSTTDLKSISRKYCHDDEITFLKPALSLIDEKYTTDISSSVEVSKEINWRNHEALIYNDEVSFKISNLNNNLHWDQTNDINKFDSIITEWLEVLNLHKVDTEKNQDDDDLEQVQNRAILLTYINYNLLFTKLKRDVLLIGQLASIDDNKDAIRLYNGVIAIVQELKDLPGVYNDDDLYYSLSNLEKYFTYKKYQIIAESYQFKSLFGESLKIYQYIDEEISIAEEFYKTKFPFDISNNEQIGIFRADIKKKILQTQISAQFESSKGTSNYTLENINKFPKDDLSIINFKKIEPIMCKPVLFDIAFNYISYDLDKSKERKPVAQQPQQPQQEATESSDSPSKKRGLFGFFGRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.15
3	0.15
4	0.13
5	0.16
6	0.19
7	0.2
8	0.27
9	0.34
10	0.41
11	0.49
12	0.59
13	0.67
14	0.74
15	0.83
16	0.86
17	0.9
18	0.93
19	0.94
20	0.94
21	0.94
22	0.91
23	0.88
24	0.79
25	0.69
26	0.61
27	0.52
28	0.47
29	0.44
30	0.36
31	0.36
32	0.36
33	0.37
34	0.36
35	0.35
36	0.34
37	0.31
38	0.4
39	0.39
40	0.4
41	0.48
42	0.54
43	0.61
44	0.62
45	0.62
46	0.61
47	0.64
48	0.71
49	0.66
50	0.63
51	0.56
52	0.5
53	0.5
54	0.46
55	0.39
56	0.31
57	0.28
58	0.25
59	0.25
60	0.24
61	0.21
62	0.16
63	0.13
64	0.11
65	0.1
66	0.08
67	0.07
68	0.11
69	0.11
70	0.13
71	0.14
72	0.12
73	0.14
74	0.14
75	0.13
76	0.13
77	0.14
78	0.19
79	0.28
80	0.29
81	0.33
82	0.41
83	0.45
84	0.5
85	0.57
86	0.57
87	0.59
88	0.67
89	0.7
90	0.73
91	0.73
92	0.73
93	0.72
94	0.68
95	0.61
96	0.6
97	0.61
98	0.55
99	0.56
100	0.48
101	0.42
102	0.39
103	0.36
104	0.3
105	0.2
106	0.14
107	0.11
108	0.11
109	0.11
110	0.11
111	0.12
112	0.15
113	0.17
114	0.18
115	0.18
116	0.17
117	0.17
118	0.17
119	0.15
120	0.12
121	0.1
122	0.1
123	0.08
124	0.08
125	0.07
126	0.06
127	0.05
128	0.04
129	0.04
130	0.05
131	0.07
132	0.08
133	0.09
134	0.13
135	0.16
136	0.18
137	0.23
138	0.26
139	0.3
140	0.34
141	0.4
142	0.41
143	0.43
144	0.47
145	0.43
146	0.42
147	0.39
148	0.33
149	0.27
150	0.22
151	0.18
152	0.13
153	0.13
154	0.16
155	0.2
156	0.21
157	0.21
158	0.22
159	0.21
160	0.22
161	0.21
162	0.16
163	0.1
164	0.08
165	0.09
166	0.1
167	0.12
168	0.11
169	0.1
170	0.1
171	0.1
172	0.11
173	0.11
174	0.1
175	0.08
176	0.07
177	0.09
178	0.1
179	0.11
180	0.11
181	0.11
182	0.11
183	0.1
184	0.11
185	0.09
186	0.09
187	0.07
188	0.06
189	0.06
190	0.08
191	0.08
192	0.07
193	0.1
194	0.1
195	0.13
196	0.13
197	0.13
198	0.12
199	0.13
200	0.14
201	0.12
202	0.12
203	0.1
204	0.12
205	0.12
206	0.11
207	0.15
208	0.19
209	0.24
210	0.28
211	0.3
212	0.33
213	0.37
214	0.39
215	0.38
216	0.32
217	0.31
218	0.31
219	0.3
220	0.25
221	0.21
222	0.17
223	0.15
224	0.14
225	0.11
226	0.08
227	0.07
228	0.08
229	0.11
230	0.11
231	0.11
232	0.13
233	0.12
234	0.11
235	0.1
236	0.09
237	0.07
238	0.08
239	0.09
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.09
244	0.11
245	0.16
246	0.18
247	0.22
248	0.24
249	0.27
250	0.28
251	0.28
252	0.26
253	0.21
254	0.19
255	0.17
256	0.15
257	0.12
258	0.11
259	0.11
260	0.1
261	0.11
262	0.1
263	0.08
264	0.12
265	0.13
266	0.16
267	0.19
268	0.21
269	0.2
270	0.24
271	0.24
272	0.2
273	0.19
274	0.17
275	0.15
276	0.19
277	0.24
278	0.21
279	0.21
280	0.21
281	0.2
282	0.21
283	0.19
284	0.13
285	0.08
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.08
291	0.08
292	0.07
293	0.07
294	0.09
295	0.08
296	0.08
297	0.09
298	0.1
299	0.12
300	0.16
301	0.22
302	0.21
303	0.23
304	0.23
305	0.22
306	0.22
307	0.21
308	0.19
309	0.14
310	0.12
311	0.12
312	0.12
313	0.12
314	0.11
315	0.1
316	0.08
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.06
321	0.06
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.09
328	0.1
329	0.1
330	0.17
331	0.2
332	0.21
333	0.21
334	0.22
335	0.21
336	0.22
337	0.26
338	0.18
339	0.15
340	0.14
341	0.14
342	0.13
343	0.11
344	0.1
345	0.06
346	0.05
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.08
355	0.1
356	0.1
357	0.1
358	0.1
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.08
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.07
368	0.06
369	0.08
370	0.1
371	0.11
372	0.12
373	0.12
374	0.11
375	0.11
376	0.12
377	0.11
378	0.09
379	0.09
380	0.09
381	0.09
382	0.1
383	0.1
384	0.11
385	0.09
386	0.14
387	0.2
388	0.22
389	0.27
390	0.3
391	0.33
392	0.36
393	0.38
394	0.36
395	0.36
396	0.37
397	0.36
398	0.38
399	0.36
400	0.35
401	0.33
402	0.3
403	0.27
404	0.24
405	0.21
406	0.16
407	0.17
408	0.14
409	0.17
410	0.18
411	0.17
412	0.17
413	0.14
414	0.15
415	0.14
416	0.14
417	0.1
418	0.1
419	0.09
420	0.1
421	0.09
422	0.08
423	0.06
424	0.06
425	0.07
426	0.08
427	0.15
428	0.15
429	0.16
430	0.17
431	0.19
432	0.25
433	0.29
434	0.36
435	0.35
436	0.43
437	0.42
438	0.41
439	0.39
440	0.33
441	0.32
442	0.25
443	0.2
444	0.17
445	0.22
446	0.26
447	0.29
448	0.34
449	0.36
450	0.38
451	0.45
452	0.47
453	0.45
454	0.45
455	0.52
456	0.56
457	0.53
458	0.5
459	0.43
460	0.38
461	0.34
462	0.33
463	0.25
464	0.21
465	0.19
466	0.22
467	0.24
468	0.23
469	0.25
470	0.23
471	0.28
472	0.26
473	0.29
474	0.3
475	0.35
476	0.35
477	0.34
478	0.33
479	0.31
480	0.32
481	0.31
482	0.31
483	0.32
484	0.39
485	0.39
486	0.44
487	0.41
488	0.36
489	0.4
490	0.38
491	0.36
492	0.34
493	0.39
494	0.41
495	0.44
496	0.44
497	0.38
498	0.4
499	0.39
500	0.32
501	0.26
502	0.21
503	0.23
504	0.23
505	0.22
506	0.21
507	0.16
508	0.16
509	0.17
510	0.17
511	0.13
512	0.16
513	0.24
514	0.26
515	0.33
516	0.41
517	0.44
518	0.49
519	0.57
520	0.65
521	0.68
522	0.74
523	0.76
524	0.77
525	0.83
526	0.82
527	0.74
528	0.65
529	0.57
530	0.53
531	0.47
532	0.43
533	0.37
534	0.31
535	0.31
536	0.36
537	0.34
538	0.32
539	0.36
540	0.37
541	0.34
542	0.4
543	0.44
544	0.45
545	0.5

C5MHT9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer