Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C5MHI0

Protein Details
Accession C5MHI0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
435-457IDQFFGKEQKVKKKNNSNVDTVGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 12, cyto 8, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045145  PTHR15271  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0033186  C:CAF-1 complex  
GO:0000775  C:chromosome, centromeric region  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000786  C:nucleosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0006335  P:DNA replication-dependent chromatin assembly  
KEGG ctp:CTRG_05534  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MEATTLTVHWHNDNSPIYSVDFQPNDSSTTTSSQSQRLATAGGDNNIRIWTLGSSNTIDFLSTLHKHSQAVNVVRFSPNGDILASAGDDGTVLLWKKSDTIITNLETEDEEDIKESWKVVGTIRSSTSEIMDLAWSPNGNYITTGSMDNVLRVYQLISQNDKINGTLVQNLSNHTHYIQGVYWDPLDEYIVSQSADRCLNVYQITHPASSTLEVQFRHKFFKFGNVYLYYPETLQSFFRRPCFSPDGSILVTPAGLEESATNESINNVLYIYSRTSLFTSPIFKITGLTKPAIAVSFNPIKYKINDGVSMLKLPYKLVFAVATQDGIVIYSTQDNFKPLGLVSNLHYSSVTDLKWDLDGSRIIVSSTDGFCSVIKFQPGVFGEVYKEQEVSQPSSVQQNITDMKQESQEVPENNPTPKEDTSPVKEKPSGHTPSIDQFFGKEQKVKKKNNSNVDTVGMIYS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.3
3 0.29
4 0.29
5 0.28
6 0.3
7 0.31
8 0.29
9 0.27
10 0.29
11 0.29
12 0.29
13 0.27
14 0.26
15 0.2
16 0.23
17 0.24
18 0.27
19 0.29
20 0.31
21 0.34
22 0.33
23 0.32
24 0.29
25 0.28
26 0.22
27 0.26
28 0.24
29 0.23
30 0.24
31 0.22
32 0.23
33 0.22
34 0.22
35 0.15
36 0.13
37 0.11
38 0.12
39 0.13
40 0.15
41 0.17
42 0.17
43 0.18
44 0.17
45 0.15
46 0.13
47 0.12
48 0.16
49 0.16
50 0.19
51 0.22
52 0.24
53 0.25
54 0.27
55 0.33
56 0.34
57 0.39
58 0.4
59 0.39
60 0.39
61 0.39
62 0.37
63 0.33
64 0.27
65 0.21
66 0.18
67 0.16
68 0.13
69 0.12
70 0.13
71 0.1
72 0.08
73 0.06
74 0.05
75 0.05
76 0.04
77 0.04
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.1
84 0.11
85 0.15
86 0.14
87 0.18
88 0.22
89 0.23
90 0.25
91 0.23
92 0.23
93 0.19
94 0.18
95 0.15
96 0.12
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.09
104 0.1
105 0.11
106 0.13
107 0.18
108 0.19
109 0.21
110 0.23
111 0.24
112 0.24
113 0.24
114 0.22
115 0.17
116 0.15
117 0.13
118 0.11
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.09
123 0.08
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.12
130 0.13
131 0.13
132 0.1
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.11
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.11
142 0.15
143 0.18
144 0.21
145 0.23
146 0.26
147 0.27
148 0.27
149 0.22
150 0.19
151 0.17
152 0.15
153 0.17
154 0.14
155 0.16
156 0.16
157 0.18
158 0.19
159 0.19
160 0.18
161 0.14
162 0.16
163 0.13
164 0.14
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.13
169 0.12
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.1
183 0.09
184 0.1
185 0.09
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.15
191 0.17
192 0.16
193 0.15
194 0.14
195 0.14
196 0.14
197 0.14
198 0.11
199 0.13
200 0.13
201 0.18
202 0.22
203 0.23
204 0.27
205 0.25
206 0.25
207 0.23
208 0.32
209 0.31
210 0.28
211 0.31
212 0.28
213 0.28
214 0.27
215 0.28
216 0.18
217 0.15
218 0.14
219 0.1
220 0.09
221 0.1
222 0.12
223 0.16
224 0.17
225 0.21
226 0.24
227 0.24
228 0.3
229 0.34
230 0.31
231 0.29
232 0.29
233 0.28
234 0.26
235 0.24
236 0.18
237 0.13
238 0.12
239 0.09
240 0.07
241 0.04
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.05
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.11
263 0.11
264 0.12
265 0.13
266 0.16
267 0.16
268 0.17
269 0.17
270 0.16
271 0.17
272 0.17
273 0.2
274 0.19
275 0.18
276 0.16
277 0.16
278 0.17
279 0.16
280 0.14
281 0.1
282 0.13
283 0.18
284 0.19
285 0.2
286 0.21
287 0.23
288 0.23
289 0.28
290 0.27
291 0.24
292 0.24
293 0.25
294 0.28
295 0.27
296 0.27
297 0.22
298 0.19
299 0.16
300 0.16
301 0.15
302 0.12
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.09
307 0.12
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.1
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.05
316 0.05
317 0.08
318 0.08
319 0.1
320 0.11
321 0.12
322 0.13
323 0.13
324 0.13
325 0.1
326 0.14
327 0.13
328 0.14
329 0.15
330 0.22
331 0.22
332 0.21
333 0.21
334 0.17
335 0.19
336 0.21
337 0.18
338 0.12
339 0.13
340 0.13
341 0.14
342 0.14
343 0.11
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.13
348 0.12
349 0.12
350 0.11
351 0.13
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.14
359 0.16
360 0.15
361 0.16
362 0.16
363 0.15
364 0.22
365 0.23
366 0.24
367 0.22
368 0.2
369 0.21
370 0.24
371 0.27
372 0.2
373 0.2
374 0.17
375 0.21
376 0.23
377 0.25
378 0.24
379 0.23
380 0.23
381 0.29
382 0.3
383 0.26
384 0.24
385 0.25
386 0.26
387 0.26
388 0.3
389 0.25
390 0.26
391 0.27
392 0.29
393 0.24
394 0.27
395 0.32
396 0.29
397 0.32
398 0.38
399 0.39
400 0.4
401 0.41
402 0.38
403 0.37
404 0.36
405 0.37
406 0.34
407 0.38
408 0.43
409 0.49
410 0.51
411 0.53
412 0.56
413 0.53
414 0.55
415 0.56
416 0.55
417 0.49
418 0.49
419 0.45
420 0.49
421 0.51
422 0.45
423 0.35
424 0.31
425 0.35
426 0.38
427 0.39
428 0.37
429 0.41
430 0.51
431 0.61
432 0.7
433 0.74
434 0.78
435 0.83
436 0.87
437 0.85
438 0.81
439 0.74
440 0.67
441 0.57