Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5PSB0

Protein Details
Accession A0A5N5PSB0    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-34LSTQRKAAGRRSNRRAGGRPHydrophilic
189-215KTGAAAKNSRNKPRRARSGRPTKKTAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-60RKAAGRRSNRRAGGRPAATAAPSGGVKKNVKPARNAGGKPAP
186-212AGAKTGAAAKNSRNKPRRARSGRPTKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034357  Yra1/Mlo3_RRM  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12267  RRM_YRA1_MLO3  
Amino Acid Sequences MSSSGKLDQSLDEILSTQRKAAGRRSNRRAGGRPAATAAPSGGVKKNVKPARNAGGKPAPTRGSGLVGESKIMVSNLPKDVSEAQIKEYFQQAIGQVKRVELSYGPGGVSRGTAHITFHHADGASKAFEKLNGMLIDSRPVKVEVVIASADLIPQPKSLGQRISQPKAQPKSAATVKHGAGANAAAGAKTGAAAKNSRNKPRRARSGRPTKKTAEELDSEMADYFVAGSNENGAAAPAAAPAAATSTDAPMDDDIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.21
3 0.2
4 0.18
5 0.21
6 0.24
7 0.28
8 0.36
9 0.43
10 0.5
11 0.6
12 0.68
13 0.73
14 0.77
15 0.81
16 0.79
17 0.77
18 0.76
19 0.68
20 0.6
21 0.54
22 0.48
23 0.4
24 0.33
25 0.25
26 0.17
27 0.15
28 0.16
29 0.16
30 0.22
31 0.24
32 0.28
33 0.38
34 0.42
35 0.45
36 0.47
37 0.51
38 0.53
39 0.59
40 0.56
41 0.54
42 0.55
43 0.56
44 0.53
45 0.52
46 0.44
47 0.36
48 0.38
49 0.31
50 0.26
51 0.23
52 0.23
53 0.21
54 0.19
55 0.18
56 0.16
57 0.15
58 0.12
59 0.11
60 0.1
61 0.08
62 0.11
63 0.13
64 0.14
65 0.14
66 0.15
67 0.17
68 0.19
69 0.23
70 0.2
71 0.2
72 0.23
73 0.24
74 0.22
75 0.23
76 0.2
77 0.15
78 0.16
79 0.15
80 0.19
81 0.2
82 0.22
83 0.2
84 0.2
85 0.21
86 0.19
87 0.18
88 0.11
89 0.13
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.1
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.11
109 0.12
110 0.12
111 0.09
112 0.08
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.16
124 0.16
125 0.15
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.12
131 0.08
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.09
144 0.12
145 0.14
146 0.17
147 0.17
148 0.26
149 0.34
150 0.38
151 0.4
152 0.42
153 0.48
154 0.5
155 0.5
156 0.44
157 0.37
158 0.4
159 0.41
160 0.39
161 0.34
162 0.35
163 0.33
164 0.35
165 0.35
166 0.27
167 0.23
168 0.19
169 0.16
170 0.12
171 0.12
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.07
178 0.07
179 0.09
180 0.12
181 0.18
182 0.28
183 0.36
184 0.46
185 0.51
186 0.59
187 0.68
188 0.76
189 0.82
190 0.81
191 0.84
192 0.84
193 0.88
194 0.9
195 0.87
196 0.83
197 0.77
198 0.75
199 0.71
200 0.65
201 0.59
202 0.51
203 0.47
204 0.43
205 0.38
206 0.31
207 0.25
208 0.2
209 0.14
210 0.11
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.12