Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MEK7

Protein Details
Accession C5MEK7    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-59SAALYCHNEKERKKKKTTKRKSKTKKNRRFQEAFYNIEHydrophilic
179-212QPSETHKQEQRHKKQRQNREHGHHPRKRQRKFLYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-50KERKKKKTTKRKSKTKKNRR
189-209RHKKQRQNREHGHHPRKRQRK
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 2, cyto 1, plas 1, pero 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR009145  U2AF_small  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ctp:CTRG_04500  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MYNIISIALSLGYLVLLVALGSAALYCHNEKERKKKKTTKRKSKTKKNRRFQEAFYNIEVLHPSQLIMPMNIESQRGQQSRSDYSLRQDHFVYDDDEIPPPPPPLPPTDSQQEFETNYSQFDDEIPPPPPPPPPPPPPPQDDDIPPPPPPLPVQEDEILLDEPLADDKYTAESESSRHQPSETHKQEQRHKKQRQNREHGHHPRKRQRKFLYNSGEGLLLCSFYTKVGACRHYGRCTKRHIDPTVSNTIKISNLYPNPLAKYDFPDDEDENSEGSEVEEADAGVDVDVNGNKESASGEKTVSKPSNYEPEVQLTEEEIQEKFDLFYKDVFTHISKLGEIKNLVVCENVNNHLNGNVYVQFVRTQEASEASKQLNSEWFNERPVYSTLSPVRDFEEAYCHEYSVGACEHGERCNYMHLRYPTPDLEQKMYRSQEKSYLIKRLARLKEELPNAASFEANGSTKAEKGSEKSQQGTKVLLQQLY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.03
3 0.03
4 0.03
5 0.03
6 0.03
7 0.03
8 0.03
9 0.03
10 0.03
11 0.05
12 0.08
13 0.09
14 0.15
15 0.22
16 0.31
17 0.39
18 0.51
19 0.6
20 0.68
21 0.77
22 0.83
23 0.87
24 0.9
25 0.94
26 0.94
27 0.94
28 0.96
29 0.96
30 0.97
31 0.97
32 0.97
33 0.97
34 0.96
35 0.96
36 0.95
37 0.9
38 0.85
39 0.85
40 0.8
41 0.74
42 0.65
43 0.56
44 0.46
45 0.4
46 0.36
47 0.25
48 0.2
49 0.15
50 0.13
51 0.12
52 0.16
53 0.15
54 0.14
55 0.14
56 0.14
57 0.17
58 0.17
59 0.18
60 0.15
61 0.19
62 0.28
63 0.28
64 0.28
65 0.3
66 0.34
67 0.37
68 0.41
69 0.4
70 0.33
71 0.39
72 0.45
73 0.43
74 0.4
75 0.36
76 0.32
77 0.3
78 0.3
79 0.25
80 0.19
81 0.19
82 0.18
83 0.19
84 0.19
85 0.17
86 0.17
87 0.16
88 0.15
89 0.15
90 0.16
91 0.2
92 0.24
93 0.26
94 0.29
95 0.36
96 0.38
97 0.37
98 0.37
99 0.35
100 0.32
101 0.31
102 0.29
103 0.22
104 0.2
105 0.19
106 0.17
107 0.14
108 0.14
109 0.16
110 0.15
111 0.18
112 0.19
113 0.19
114 0.2
115 0.21
116 0.23
117 0.24
118 0.3
119 0.34
120 0.4
121 0.46
122 0.52
123 0.56
124 0.57
125 0.56
126 0.52
127 0.48
128 0.44
129 0.44
130 0.42
131 0.39
132 0.35
133 0.33
134 0.3
135 0.28
136 0.25
137 0.23
138 0.23
139 0.22
140 0.24
141 0.24
142 0.24
143 0.23
144 0.23
145 0.19
146 0.13
147 0.11
148 0.07
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.1
161 0.15
162 0.2
163 0.2
164 0.2
165 0.2
166 0.23
167 0.3
168 0.39
169 0.4
170 0.42
171 0.45
172 0.52
173 0.62
174 0.69
175 0.73
176 0.73
177 0.77
178 0.79
179 0.84
180 0.87
181 0.89
182 0.88
183 0.86
184 0.83
185 0.85
186 0.86
187 0.88
188 0.83
189 0.82
190 0.82
191 0.83
192 0.81
193 0.8
194 0.77
195 0.77
196 0.76
197 0.76
198 0.74
199 0.66
200 0.62
201 0.52
202 0.45
203 0.34
204 0.29
205 0.19
206 0.11
207 0.08
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.1
214 0.14
215 0.16
216 0.18
217 0.25
218 0.28
219 0.34
220 0.41
221 0.42
222 0.43
223 0.48
224 0.51
225 0.51
226 0.56
227 0.52
228 0.5
229 0.49
230 0.49
231 0.51
232 0.47
233 0.4
234 0.32
235 0.3
236 0.25
237 0.22
238 0.18
239 0.14
240 0.14
241 0.17
242 0.18
243 0.19
244 0.19
245 0.2
246 0.2
247 0.15
248 0.19
249 0.19
250 0.19
251 0.19
252 0.21
253 0.2
254 0.2
255 0.22
256 0.17
257 0.15
258 0.14
259 0.12
260 0.09
261 0.08
262 0.07
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.04
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.11
285 0.15
286 0.16
287 0.23
288 0.25
289 0.24
290 0.24
291 0.26
292 0.34
293 0.31
294 0.33
295 0.27
296 0.29
297 0.3
298 0.28
299 0.25
300 0.18
301 0.18
302 0.15
303 0.15
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.1
308 0.09
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.15
313 0.16
314 0.16
315 0.17
316 0.19
317 0.16
318 0.18
319 0.18
320 0.18
321 0.15
322 0.18
323 0.19
324 0.2
325 0.19
326 0.18
327 0.19
328 0.18
329 0.18
330 0.16
331 0.15
332 0.13
333 0.16
334 0.17
335 0.16
336 0.15
337 0.15
338 0.16
339 0.17
340 0.15
341 0.15
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.14
346 0.15
347 0.14
348 0.15
349 0.13
350 0.13
351 0.12
352 0.16
353 0.18
354 0.18
355 0.2
356 0.19
357 0.21
358 0.2
359 0.2
360 0.23
361 0.22
362 0.24
363 0.27
364 0.28
365 0.29
366 0.31
367 0.29
368 0.26
369 0.26
370 0.28
371 0.23
372 0.28
373 0.3
374 0.33
375 0.34
376 0.32
377 0.33
378 0.28
379 0.28
380 0.22
381 0.24
382 0.22
383 0.25
384 0.25
385 0.22
386 0.21
387 0.21
388 0.2
389 0.16
390 0.15
391 0.11
392 0.11
393 0.14
394 0.15
395 0.18
396 0.19
397 0.17
398 0.17
399 0.25
400 0.28
401 0.26
402 0.33
403 0.35
404 0.39
405 0.4
406 0.44
407 0.38
408 0.42
409 0.47
410 0.42
411 0.44
412 0.43
413 0.44
414 0.47
415 0.5
416 0.51
417 0.48
418 0.47
419 0.49
420 0.51
421 0.55
422 0.54
423 0.57
424 0.56
425 0.59
426 0.61
427 0.63
428 0.63
429 0.59
430 0.58
431 0.54
432 0.57
433 0.56
434 0.54
435 0.47
436 0.41
437 0.38
438 0.34
439 0.29
440 0.21
441 0.18
442 0.17
443 0.15
444 0.15
445 0.16
446 0.16
447 0.18
448 0.19
449 0.2
450 0.21
451 0.25
452 0.33
453 0.39
454 0.43
455 0.47
456 0.51
457 0.54
458 0.53
459 0.52
460 0.47
461 0.47