Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDX4

Protein Details
Accession C5MDX4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
468-498IKKIMTGATKKGKKKGKKNNSKKRKVTVTLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
475-492ATKKGKKKGKKNNSKKRK
Subcellular Location(s) mito 14.5, mito_nucl 12.166, cyto_mito 10.333, nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG ctp:CTRG_03876  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MRMTSLIYKREREGEARKKKFTTKIIIFITSHRPLNNQISMSETKVIKSALKGSTSTTTTTTTTVTSKPIQFRIFVGSYEHNLLCLSVILDPSNNKEPVFQPIFHFQAHALSIKSMDLAKRYLVTGSNDEHIRIYDLQKRKELGTLLSHTGTITSLKFSTEVDTNKQEKEIESTTKSGKWLLSGSEDGKIIIWRTKDWETFGILKGHTDKINDLSIHPSGRVAISVSQDKTIRLWNLMTAKKAAILKIKGRDHLGQSGDFVRWSPKGNYFLVGMLNQILIYKTSTAKIVKKIKIKTTLMAMDILKFDNKEWLVAGLGNGAIELYEFKDQVLSGLGKQNDADDEEKEEEEDKVWDSKPEELEAKFTLRGHTNRIKGISFLQDKQETQGIPLLISVSSDGKIVVWNLTLKDQVAVYDAGERLNCVSTCPETIEKTETMKRRFTSLGDITGENNENDIPSESEYETDGEEIKKIMTGATKKGKKKGKKNNSKKRKVTVTLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.65
3 0.69
4 0.73
5 0.72
6 0.76
7 0.77
8 0.75
9 0.74
10 0.7
11 0.71
12 0.69
13 0.68
14 0.61
15 0.56
16 0.57
17 0.51
18 0.47
19 0.39
20 0.37
21 0.39
22 0.45
23 0.46
24 0.38
25 0.34
26 0.37
27 0.38
28 0.38
29 0.38
30 0.3
31 0.25
32 0.27
33 0.28
34 0.24
35 0.25
36 0.29
37 0.27
38 0.29
39 0.29
40 0.31
41 0.35
42 0.34
43 0.33
44 0.28
45 0.26
46 0.25
47 0.25
48 0.23
49 0.19
50 0.2
51 0.2
52 0.23
53 0.26
54 0.31
55 0.35
56 0.41
57 0.41
58 0.39
59 0.39
60 0.42
61 0.37
62 0.31
63 0.3
64 0.26
65 0.27
66 0.31
67 0.29
68 0.22
69 0.2
70 0.2
71 0.15
72 0.13
73 0.11
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.1
78 0.12
79 0.17
80 0.23
81 0.23
82 0.22
83 0.24
84 0.25
85 0.32
86 0.35
87 0.31
88 0.29
89 0.34
90 0.36
91 0.33
92 0.33
93 0.24
94 0.23
95 0.23
96 0.21
97 0.15
98 0.13
99 0.14
100 0.13
101 0.14
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.14
106 0.14
107 0.15
108 0.15
109 0.16
110 0.17
111 0.19
112 0.2
113 0.21
114 0.24
115 0.24
116 0.24
117 0.23
118 0.2
119 0.19
120 0.18
121 0.2
122 0.24
123 0.31
124 0.34
125 0.38
126 0.39
127 0.37
128 0.39
129 0.36
130 0.31
131 0.3
132 0.3
133 0.28
134 0.27
135 0.26
136 0.22
137 0.21
138 0.18
139 0.13
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.12
147 0.15
148 0.17
149 0.2
150 0.27
151 0.29
152 0.29
153 0.3
154 0.29
155 0.24
156 0.27
157 0.26
158 0.23
159 0.23
160 0.26
161 0.27
162 0.27
163 0.27
164 0.24
165 0.21
166 0.18
167 0.17
168 0.15
169 0.16
170 0.17
171 0.17
172 0.17
173 0.17
174 0.15
175 0.14
176 0.14
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.16
182 0.19
183 0.2
184 0.21
185 0.22
186 0.22
187 0.24
188 0.25
189 0.24
190 0.2
191 0.2
192 0.2
193 0.21
194 0.19
195 0.17
196 0.16
197 0.16
198 0.19
199 0.18
200 0.16
201 0.17
202 0.17
203 0.17
204 0.16
205 0.13
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.07
210 0.08
211 0.1
212 0.14
213 0.15
214 0.16
215 0.17
216 0.17
217 0.17
218 0.19
219 0.17
220 0.14
221 0.14
222 0.15
223 0.21
224 0.23
225 0.23
226 0.2
227 0.19
228 0.21
229 0.22
230 0.2
231 0.19
232 0.2
233 0.24
234 0.31
235 0.33
236 0.31
237 0.33
238 0.34
239 0.31
240 0.32
241 0.29
242 0.21
243 0.21
244 0.2
245 0.18
246 0.15
247 0.13
248 0.11
249 0.11
250 0.13
251 0.15
252 0.18
253 0.21
254 0.22
255 0.23
256 0.21
257 0.2
258 0.18
259 0.16
260 0.12
261 0.08
262 0.08
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.07
270 0.08
271 0.11
272 0.14
273 0.18
274 0.26
275 0.35
276 0.39
277 0.46
278 0.51
279 0.54
280 0.59
281 0.57
282 0.5
283 0.46
284 0.43
285 0.36
286 0.34
287 0.27
288 0.2
289 0.19
290 0.18
291 0.13
292 0.11
293 0.11
294 0.13
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.05
306 0.04
307 0.03
308 0.03
309 0.04
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.1
318 0.09
319 0.1
320 0.16
321 0.16
322 0.16
323 0.16
324 0.16
325 0.14
326 0.16
327 0.16
328 0.11
329 0.14
330 0.16
331 0.16
332 0.16
333 0.16
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.11
338 0.13
339 0.13
340 0.15
341 0.16
342 0.2
343 0.21
344 0.23
345 0.25
346 0.21
347 0.24
348 0.23
349 0.24
350 0.22
351 0.22
352 0.22
353 0.25
354 0.26
355 0.31
356 0.37
357 0.38
358 0.4
359 0.42
360 0.39
361 0.34
362 0.36
363 0.37
364 0.34
365 0.32
366 0.35
367 0.35
368 0.35
369 0.36
370 0.37
371 0.28
372 0.25
373 0.26
374 0.2
375 0.17
376 0.17
377 0.15
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.07
386 0.09
387 0.1
388 0.09
389 0.1
390 0.12
391 0.13
392 0.15
393 0.16
394 0.15
395 0.15
396 0.14
397 0.12
398 0.13
399 0.12
400 0.1
401 0.13
402 0.14
403 0.14
404 0.13
405 0.14
406 0.13
407 0.16
408 0.16
409 0.13
410 0.16
411 0.17
412 0.19
413 0.22
414 0.24
415 0.23
416 0.26
417 0.28
418 0.27
419 0.31
420 0.37
421 0.41
422 0.43
423 0.48
424 0.46
425 0.47
426 0.47
427 0.44
428 0.45
429 0.41
430 0.42
431 0.38
432 0.37
433 0.34
434 0.36
435 0.36
436 0.26
437 0.23
438 0.17
439 0.15
440 0.16
441 0.16
442 0.13
443 0.13
444 0.16
445 0.16
446 0.16
447 0.17
448 0.16
449 0.15
450 0.14
451 0.15
452 0.13
453 0.13
454 0.13
455 0.12
456 0.13
457 0.12
458 0.13
459 0.19
460 0.22
461 0.31
462 0.41
463 0.49
464 0.55
465 0.64
466 0.72
467 0.75
468 0.82
469 0.84
470 0.85
471 0.88
472 0.92
473 0.95
474 0.96
475 0.97
476 0.95
477 0.94
478 0.93