Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MAV4

Protein Details
Accession C5MAV4    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-82YVQMKDFQLKRMKRNNLEKSIANHydrophilic
160-192STIGTKRKVKDNSKSQLKKQKRKIDHTPPTADLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
166-182RKVKDNSKSQLKKQKRK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR041569  AAA_lid_3  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR003960  ATPase_AAA_CS  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
KEGG ctp:CTRG_03196  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF17862  AAA_lid_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00674  AAA  
CDD cd19518  RecA-like_NVL_r1-like  
cd19530  RecA-like_NVL_r2-like  
Amino Acid Sequences MSKKKIITGSMDQKIYNLIHDLLEEQTEENKNALEDPENADPFSYIASSNSLTISQVLAYVQMKDFQLKRMKRNNLEKSIANSLRLIRQDEAEELGKIGPGSDGGSNLENDIDEEDNDEGRLMDVKDSNELNKSVVALWNLEDNQTVDSKDGDDHQMEDSTIGTKRKVKDNSKSQLKKQKRKIDHTPPTADLSSLGGVETITTQLLEIIGLPILHPEIYTSTGVEPPRGVLLYGPPGCGKTTLANALAGELKVPFFNISAPSIVSGMSGESEKKLRDLFEEAKSVAPCLIFMDEIDAITPKRDGGAQREMERRIVAQLLTLMDELTLEKTGGKPVVVIGATNRPDSLDSALRRAGRFDREICLTVPNEEQRISILKAMTKNIKLESGENFDYRELSKLTPGYVGADLKSLVTAAGITAIKRIFETMSEAQEESSVQKDDSMDIDVTHSESNKELILQNFDKKSEVEKLSTIKKFLMKHPDPLSQQQLDPLAITYEDFVNALPTVQPSAKREGFATVPDVTWQNVGALSSIRMELHMCIVQPIKKPEIYLKVGIAAPAGVLMWGPPGCGKTLLAKAVANESRANFISIKGPELLNKYVGESERAVRQVFQRARASTPCIIFFDELDALVPRRDNSMSESSSRVVNTLLTELDGLNDRKGVFVIGATNRPDMIDPAMLRPGRLDKTLYIELPSPEERLEILKTIVRSNNSPLHSDVSLVSVSQDPRCRNFSGADLSSLVKEAGVSALKKKFFTNQKIQDLDKSGFYQESSDEDKIFITAEDFDYALSSIRPSVSDRDRVRYEKLNRKLGWNIIPEKENEEKEPQIAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.41
3 0.33
4 0.26
5 0.2
6 0.18
7 0.18
8 0.19
9 0.15
10 0.16
11 0.15
12 0.12
13 0.18
14 0.2
15 0.2
16 0.2
17 0.19
18 0.19
19 0.2
20 0.21
21 0.18
22 0.18
23 0.22
24 0.29
25 0.29
26 0.29
27 0.27
28 0.25
29 0.22
30 0.21
31 0.16
32 0.09
33 0.09
34 0.12
35 0.13
36 0.13
37 0.14
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.13
42 0.1
43 0.1
44 0.09
45 0.12
46 0.12
47 0.14
48 0.14
49 0.17
50 0.18
51 0.24
52 0.25
53 0.3
54 0.39
55 0.43
56 0.53
57 0.6
58 0.69
59 0.73
60 0.82
61 0.84
62 0.83
63 0.81
64 0.75
65 0.7
66 0.71
67 0.63
68 0.54
69 0.46
70 0.4
71 0.41
72 0.4
73 0.38
74 0.29
75 0.29
76 0.3
77 0.28
78 0.29
79 0.25
80 0.22
81 0.19
82 0.18
83 0.16
84 0.14
85 0.13
86 0.09
87 0.07
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.09
107 0.08
108 0.12
109 0.1
110 0.13
111 0.15
112 0.16
113 0.2
114 0.21
115 0.23
116 0.23
117 0.23
118 0.21
119 0.19
120 0.19
121 0.16
122 0.18
123 0.17
124 0.14
125 0.14
126 0.18
127 0.18
128 0.17
129 0.17
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.15
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.14
139 0.16
140 0.15
141 0.16
142 0.17
143 0.17
144 0.16
145 0.15
146 0.13
147 0.12
148 0.15
149 0.16
150 0.18
151 0.23
152 0.27
153 0.36
154 0.45
155 0.52
156 0.58
157 0.67
158 0.74
159 0.8
160 0.83
161 0.83
162 0.84
163 0.86
164 0.87
165 0.86
166 0.87
167 0.86
168 0.87
169 0.89
170 0.89
171 0.89
172 0.86
173 0.82
174 0.73
175 0.68
176 0.59
177 0.48
178 0.37
179 0.29
180 0.21
181 0.15
182 0.12
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.15
210 0.16
211 0.16
212 0.14
213 0.13
214 0.14
215 0.13
216 0.12
217 0.08
218 0.11
219 0.18
220 0.19
221 0.19
222 0.18
223 0.19
224 0.19
225 0.19
226 0.18
227 0.12
228 0.14
229 0.16
230 0.17
231 0.16
232 0.16
233 0.16
234 0.16
235 0.13
236 0.11
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.08
241 0.07
242 0.06
243 0.07
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.08
252 0.07
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.1
259 0.1
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.15
264 0.21
265 0.24
266 0.25
267 0.27
268 0.26
269 0.28
270 0.28
271 0.25
272 0.2
273 0.15
274 0.12
275 0.1
276 0.1
277 0.07
278 0.07
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.05
288 0.06
289 0.09
290 0.1
291 0.16
292 0.24
293 0.27
294 0.32
295 0.38
296 0.39
297 0.37
298 0.36
299 0.3
300 0.23
301 0.21
302 0.15
303 0.1
304 0.11
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.08
309 0.06
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.15
327 0.16
328 0.16
329 0.16
330 0.13
331 0.14
332 0.15
333 0.16
334 0.16
335 0.15
336 0.18
337 0.21
338 0.23
339 0.22
340 0.24
341 0.24
342 0.22
343 0.25
344 0.24
345 0.24
346 0.24
347 0.25
348 0.24
349 0.23
350 0.19
351 0.18
352 0.19
353 0.17
354 0.16
355 0.15
356 0.14
357 0.13
358 0.15
359 0.14
360 0.14
361 0.13
362 0.15
363 0.16
364 0.19
365 0.22
366 0.21
367 0.22
368 0.2
369 0.22
370 0.2
371 0.2
372 0.2
373 0.21
374 0.21
375 0.19
376 0.19
377 0.17
378 0.17
379 0.16
380 0.15
381 0.11
382 0.09
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.11
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.09
392 0.09
393 0.08
394 0.08
395 0.07
396 0.06
397 0.04
398 0.04
399 0.03
400 0.03
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.07
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.06
410 0.06
411 0.12
412 0.12
413 0.13
414 0.14
415 0.14
416 0.14
417 0.14
418 0.14
419 0.09
420 0.09
421 0.08
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.09
426 0.09
427 0.1
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.08
432 0.09
433 0.09
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.07
439 0.08
440 0.09
441 0.1
442 0.15
443 0.16
444 0.21
445 0.21
446 0.22
447 0.22
448 0.2
449 0.22
450 0.24
451 0.23
452 0.2
453 0.21
454 0.25
455 0.31
456 0.32
457 0.31
458 0.26
459 0.29
460 0.3
461 0.33
462 0.4
463 0.34
464 0.4
465 0.44
466 0.48
467 0.46
468 0.48
469 0.48
470 0.38
471 0.37
472 0.31
473 0.28
474 0.22
475 0.19
476 0.15
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.06
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.06
488 0.05
489 0.05
490 0.07
491 0.08
492 0.11
493 0.13
494 0.2
495 0.21
496 0.21
497 0.22
498 0.22
499 0.22
500 0.2
501 0.21
502 0.15
503 0.14
504 0.14
505 0.14
506 0.12
507 0.12
508 0.11
509 0.08
510 0.07
511 0.07
512 0.07
513 0.06
514 0.06
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.09
522 0.1
523 0.09
524 0.1
525 0.13
526 0.16
527 0.2
528 0.24
529 0.24
530 0.24
531 0.25
532 0.29
533 0.33
534 0.33
535 0.31
536 0.27
537 0.27
538 0.27
539 0.26
540 0.2
541 0.13
542 0.09
543 0.07
544 0.06
545 0.03
546 0.03
547 0.03
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.06
552 0.07
553 0.08
554 0.09
555 0.1
556 0.12
557 0.16
558 0.17
559 0.18
560 0.18
561 0.18
562 0.25
563 0.25
564 0.22
565 0.21
566 0.2
567 0.22
568 0.22
569 0.23
570 0.16
571 0.16
572 0.2
573 0.19
574 0.2
575 0.18
576 0.18
577 0.19
578 0.23
579 0.23
580 0.2
581 0.19
582 0.18
583 0.2
584 0.2
585 0.2
586 0.17
587 0.18
588 0.2
589 0.22
590 0.21
591 0.2
592 0.23
593 0.3
594 0.32
595 0.37
596 0.38
597 0.38
598 0.42
599 0.43
600 0.45
601 0.4
602 0.38
603 0.33
604 0.29
605 0.29
606 0.25
607 0.22
608 0.2
609 0.16
610 0.13
611 0.12
612 0.12
613 0.11
614 0.11
615 0.12
616 0.1
617 0.12
618 0.13
619 0.13
620 0.18
621 0.24
622 0.25
623 0.26
624 0.28
625 0.26
626 0.28
627 0.27
628 0.22
629 0.15
630 0.14
631 0.13
632 0.12
633 0.11
634 0.09
635 0.1
636 0.09
637 0.1
638 0.13
639 0.13
640 0.12
641 0.14
642 0.14
643 0.14
644 0.14
645 0.13
646 0.09
647 0.08
648 0.13
649 0.15
650 0.19
651 0.21
652 0.21
653 0.21
654 0.21
655 0.21
656 0.17
657 0.16
658 0.16
659 0.15
660 0.17
661 0.24
662 0.23
663 0.23
664 0.23
665 0.27
666 0.26
667 0.27
668 0.27
669 0.22
670 0.29
671 0.33
672 0.31
673 0.27
674 0.27
675 0.26
676 0.29
677 0.28
678 0.23
679 0.19
680 0.19
681 0.17
682 0.17
683 0.18
684 0.15
685 0.15
686 0.17
687 0.18
688 0.23
689 0.27
690 0.27
691 0.28
692 0.32
693 0.38
694 0.37
695 0.38
696 0.35
697 0.34
698 0.31
699 0.3
700 0.24
701 0.19
702 0.18
703 0.15
704 0.14
705 0.14
706 0.16
707 0.2
708 0.27
709 0.28
710 0.32
711 0.37
712 0.37
713 0.36
714 0.36
715 0.35
716 0.37
717 0.35
718 0.32
719 0.3
720 0.29
721 0.27
722 0.25
723 0.2
724 0.12
725 0.1
726 0.08
727 0.1
728 0.13
729 0.14
730 0.21
731 0.27
732 0.3
733 0.31
734 0.33
735 0.38
736 0.45
737 0.53
738 0.57
739 0.6
740 0.67
741 0.71
742 0.71
743 0.69
744 0.64
745 0.56
746 0.49
747 0.41
748 0.34
749 0.3
750 0.28
751 0.23
752 0.18
753 0.21
754 0.24
755 0.24
756 0.22
757 0.22
758 0.22
759 0.21
760 0.2
761 0.15
762 0.1
763 0.1
764 0.11
765 0.12
766 0.12
767 0.11
768 0.12
769 0.12
770 0.11
771 0.1
772 0.09
773 0.09
774 0.1
775 0.12
776 0.14
777 0.22
778 0.28
779 0.38
780 0.41
781 0.48
782 0.54
783 0.57
784 0.6
785 0.61
786 0.65
787 0.66
788 0.71
789 0.73
790 0.68
791 0.7
792 0.71
793 0.69
794 0.66
795 0.64
796 0.61
797 0.56
798 0.57
799 0.52
800 0.52
801 0.51
802 0.47
803 0.43
804 0.43
805 0.4