Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M4T2

Protein Details
Accession C5M4T2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
555-582FDYKALPKVKRHHPKPSAPRESRPKSIHBasic
649-676YKSLYDIRLKRHYKKKPVIRHNIICPIVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
561-581PKVKRHHPKPSAPRESRPKSI
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 8.5, cyto 4.5, mito 3, E.R. 3, extr 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG ctp:CTRG_01072  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
Amino Acid Sequences MSVDASTSQLPNATPFLNSVCPGFAGLDDNVHYSLRTLPSQCREIPWPITTTNTILKLDQSYLNIARPPLCKNESTTYVSLPHHVTSLFDKVVKNSEKGSEGYMHIGANINPLLHDPFKIVNSNPGCMTRIITLTKSRNPFADNKTFTNPGGKSTNYFKDLQKGDFKILNDKKIIGASRLLVSSHVNILNVFALDEKSNFMNTKKNKSKLKPIIEEEGQGKTYERMIEEPVLRIQFKDDAIISAISTFVLNDEPIVILGFHSGEIIIIKLLDQKFQMFDAIKKSEDNVEVNTVTSIEAMRHPNYEYLIVAGYSNGEVVILNPAGVVENYAKATIDKDESCTYFKKFDLSPLGKIHNSFLVGHIKVSHKPITSISSTLPINKPLQSPESQPLILALASADGFVRFIDLIFTYNQNYGNKKHVIITDVISNYFNTGITAIQFSPDFKFICVVGNGDLIEVFKMSYYNVNGLLYKNTGRRSRSGTVNSANSGTEPRIKDSRNNKDLYPPMIKDIQIIGRFKGHTNVVKSIKFVKDNANSSVYKLISCGYDGKTFVWDFDYKALPKVKRHHPKPSAPRESRPKSIHDRRQILVSPSPLSRMKHNRNKSIDENPFHSPSLTNIANTYSMNMILQDEAPKTALSTDQIEVAVSLYKSLYDIRLKRHYKKKPVIRHNIICPIVSDKLVPSIEIPLATIDLSCFVGDGKIDSFYTDESTFWCFAKSGDLFRYVIT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.2
4 0.21
5 0.21
6 0.2
7 0.18
8 0.17
9 0.17
10 0.16
11 0.13
12 0.14
13 0.13
14 0.15
15 0.15
16 0.17
17 0.17
18 0.16
19 0.16
20 0.13
21 0.18
22 0.19
23 0.23
24 0.25
25 0.32
26 0.38
27 0.44
28 0.45
29 0.44
30 0.45
31 0.47
32 0.49
33 0.44
34 0.41
35 0.36
36 0.39
37 0.36
38 0.35
39 0.34
40 0.33
41 0.31
42 0.28
43 0.29
44 0.28
45 0.28
46 0.27
47 0.23
48 0.26
49 0.26
50 0.29
51 0.29
52 0.28
53 0.3
54 0.31
55 0.33
56 0.35
57 0.36
58 0.35
59 0.39
60 0.44
61 0.44
62 0.47
63 0.45
64 0.4
65 0.42
66 0.4
67 0.38
68 0.34
69 0.29
70 0.24
71 0.22
72 0.21
73 0.2
74 0.24
75 0.23
76 0.23
77 0.24
78 0.25
79 0.34
80 0.35
81 0.33
82 0.31
83 0.32
84 0.32
85 0.32
86 0.32
87 0.27
88 0.25
89 0.26
90 0.25
91 0.21
92 0.19
93 0.2
94 0.17
95 0.17
96 0.16
97 0.13
98 0.12
99 0.13
100 0.16
101 0.15
102 0.15
103 0.14
104 0.16
105 0.19
106 0.22
107 0.21
108 0.26
109 0.28
110 0.29
111 0.29
112 0.29
113 0.28
114 0.25
115 0.26
116 0.2
117 0.21
118 0.22
119 0.23
120 0.29
121 0.34
122 0.4
123 0.43
124 0.42
125 0.41
126 0.43
127 0.47
128 0.47
129 0.51
130 0.48
131 0.48
132 0.51
133 0.51
134 0.47
135 0.47
136 0.4
137 0.34
138 0.34
139 0.31
140 0.29
141 0.34
142 0.39
143 0.35
144 0.38
145 0.34
146 0.39
147 0.41
148 0.43
149 0.44
150 0.4
151 0.4
152 0.41
153 0.4
154 0.43
155 0.44
156 0.44
157 0.38
158 0.36
159 0.33
160 0.34
161 0.34
162 0.25
163 0.22
164 0.19
165 0.2
166 0.2
167 0.18
168 0.15
169 0.16
170 0.15
171 0.17
172 0.16
173 0.14
174 0.13
175 0.14
176 0.13
177 0.12
178 0.1
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.11
186 0.13
187 0.14
188 0.21
189 0.26
190 0.37
191 0.45
192 0.52
193 0.6
194 0.64
195 0.74
196 0.75
197 0.79
198 0.76
199 0.71
200 0.7
201 0.62
202 0.59
203 0.5
204 0.42
205 0.33
206 0.26
207 0.22
208 0.16
209 0.16
210 0.15
211 0.14
212 0.13
213 0.14
214 0.18
215 0.19
216 0.2
217 0.21
218 0.22
219 0.21
220 0.19
221 0.19
222 0.17
223 0.16
224 0.16
225 0.13
226 0.12
227 0.13
228 0.13
229 0.11
230 0.08
231 0.08
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.04
256 0.09
257 0.09
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.16
264 0.12
265 0.14
266 0.18
267 0.2
268 0.19
269 0.19
270 0.2
271 0.2
272 0.21
273 0.21
274 0.16
275 0.17
276 0.16
277 0.16
278 0.15
279 0.12
280 0.1
281 0.09
282 0.07
283 0.05
284 0.09
285 0.12
286 0.13
287 0.14
288 0.14
289 0.15
290 0.16
291 0.16
292 0.12
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.06
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.04
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.08
321 0.1
322 0.09
323 0.12
324 0.14
325 0.16
326 0.18
327 0.19
328 0.19
329 0.19
330 0.19
331 0.19
332 0.17
333 0.2
334 0.28
335 0.28
336 0.3
337 0.31
338 0.34
339 0.31
340 0.31
341 0.27
342 0.19
343 0.18
344 0.14
345 0.14
346 0.16
347 0.15
348 0.15
349 0.17
350 0.17
351 0.18
352 0.21
353 0.22
354 0.17
355 0.18
356 0.2
357 0.2
358 0.2
359 0.19
360 0.16
361 0.16
362 0.16
363 0.19
364 0.18
365 0.18
366 0.18
367 0.19
368 0.2
369 0.18
370 0.21
371 0.19
372 0.21
373 0.22
374 0.24
375 0.21
376 0.2
377 0.18
378 0.16
379 0.14
380 0.11
381 0.07
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.04
390 0.03
391 0.03
392 0.04
393 0.04
394 0.06
395 0.07
396 0.08
397 0.09
398 0.1
399 0.14
400 0.15
401 0.18
402 0.19
403 0.24
404 0.25
405 0.24
406 0.26
407 0.24
408 0.23
409 0.22
410 0.21
411 0.2
412 0.19
413 0.19
414 0.16
415 0.15
416 0.13
417 0.12
418 0.11
419 0.06
420 0.06
421 0.05
422 0.05
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.09
429 0.12
430 0.12
431 0.1
432 0.11
433 0.11
434 0.13
435 0.12
436 0.12
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.09
441 0.09
442 0.07
443 0.06
444 0.05
445 0.05
446 0.04
447 0.04
448 0.05
449 0.07
450 0.08
451 0.09
452 0.1
453 0.11
454 0.12
455 0.13
456 0.14
457 0.13
458 0.15
459 0.18
460 0.23
461 0.28
462 0.29
463 0.32
464 0.38
465 0.41
466 0.46
467 0.47
468 0.46
469 0.46
470 0.46
471 0.44
472 0.37
473 0.32
474 0.25
475 0.22
476 0.18
477 0.19
478 0.17
479 0.2
480 0.25
481 0.27
482 0.34
483 0.43
484 0.52
485 0.53
486 0.54
487 0.51
488 0.53
489 0.56
490 0.53
491 0.49
492 0.39
493 0.36
494 0.36
495 0.36
496 0.29
497 0.28
498 0.28
499 0.26
500 0.27
501 0.24
502 0.25
503 0.27
504 0.26
505 0.27
506 0.26
507 0.27
508 0.3
509 0.36
510 0.38
511 0.38
512 0.39
513 0.42
514 0.41
515 0.38
516 0.37
517 0.38
518 0.4
519 0.42
520 0.44
521 0.42
522 0.38
523 0.37
524 0.4
525 0.31
526 0.23
527 0.2
528 0.18
529 0.13
530 0.15
531 0.17
532 0.15
533 0.18
534 0.19
535 0.19
536 0.22
537 0.21
538 0.2
539 0.2
540 0.18
541 0.16
542 0.19
543 0.24
544 0.2
545 0.26
546 0.33
547 0.33
548 0.4
549 0.48
550 0.55
551 0.61
552 0.68
553 0.73
554 0.75
555 0.82
556 0.85
557 0.87
558 0.88
559 0.82
560 0.84
561 0.84
562 0.81
563 0.8
564 0.72
565 0.69
566 0.69
567 0.74
568 0.74
569 0.74
570 0.73
571 0.65
572 0.68
573 0.65
574 0.59
575 0.53
576 0.46
577 0.39
578 0.34
579 0.37
580 0.35
581 0.32
582 0.37
583 0.43
584 0.5
585 0.58
586 0.67
587 0.71
588 0.74
589 0.79
590 0.76
591 0.76
592 0.74
593 0.68
594 0.63
595 0.59
596 0.55
597 0.49
598 0.43
599 0.33
600 0.26
601 0.29
602 0.26
603 0.21
604 0.19
605 0.2
606 0.21
607 0.2
608 0.19
609 0.13
610 0.12
611 0.12
612 0.11
613 0.1
614 0.1
615 0.11
616 0.13
617 0.13
618 0.13
619 0.14
620 0.13
621 0.13
622 0.13
623 0.13
624 0.13
625 0.15
626 0.15
627 0.16
628 0.16
629 0.16
630 0.15
631 0.14
632 0.15
633 0.11
634 0.11
635 0.09
636 0.09
637 0.1
638 0.12
639 0.17
640 0.22
641 0.27
642 0.34
643 0.45
644 0.53
645 0.62
646 0.71
647 0.76
648 0.78
649 0.85
650 0.87
651 0.88
652 0.91
653 0.92
654 0.92
655 0.9
656 0.87
657 0.86
658 0.77
659 0.66
660 0.57
661 0.51
662 0.42
663 0.35
664 0.27
665 0.19
666 0.24
667 0.23
668 0.22
669 0.18
670 0.19
671 0.2
672 0.19
673 0.18
674 0.12
675 0.13
676 0.13
677 0.12
678 0.08
679 0.09
680 0.09
681 0.09
682 0.08
683 0.07
684 0.08
685 0.09
686 0.1
687 0.1
688 0.12
689 0.12
690 0.13
691 0.14
692 0.14
693 0.18
694 0.17
695 0.16
696 0.15
697 0.2
698 0.21
699 0.2
700 0.2
701 0.16
702 0.15
703 0.24
704 0.25
705 0.26
706 0.28
707 0.32