FuNGI

C5E2M7

Protein Details

Accession

C5E2M7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
396-418	GQNCTNKRCKFRHARSHIMCREG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
186-208	VGKASTRGGRNERPGRGGKNGVG

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR040366 Nab2/ZC3H14 IPR043094 Nab2/ZC3H14_N_sf IPR021083 Nab2_N IPR041044 Nab2p_Zf1 IPR000571 Znf_CCCH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0046872 F:metal ion binding GO:0008143 F:poly(A) binding GO:0034641 P:cellular nitrogen compound metabolic process GO:1900364 P:negative regulation of mRNA polyadenylation GO:0043488 P:regulation of mRNA stability
KEGG	lth:KLTH0H06226g -
Pfam	View protein in Pfam PF11517 Nab2 PF18260 Nab2p_Zf1 PF14608 zf-CCCH_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50103 ZF_C3H1

Amino Acid Sequences

MSDPKEEIFNNLKVVIAENLKTLPNFNEDVNYVAEYIVLLMSNGGNLESVVQELTSLFDTVPPEAFHNVVQNAYKVLGYLQGGDSLEVAVSKLTGGSNAPAGQEQHNQQAMFSQEQQQQQQSQQQPQHQAHQQQPQQQAAVPSIFQTAPPATAAQPQSAFAGLVEFSPAPSGDISKSGGAQRGGGVGKASTRGGRNERPGRGGKNGVGKRNNYQNNNALAMALGMDDPNTNVVQKKQGRCKLFPRCPLGRQCPHAHPTQACREYPNCPNPPGTCNYLHPNEDVELMKEIEKTREEFREKRAAVAASRAKPINTGIVLCKFGNLCSNPQCPFGHPTPANEDAKVITFAWCPENLKCENPTCDRAHSSHSKIKEVAPIAARKPSRPPVEKSLEQCKFGQNCTNKRCKFRHARSHIMCREGANCTRIDCLFGHPINEDCKFGVECRNIYCLYRHPEGRQLPDKSQQAQSNSNNTWVNPNLGTGNSSSNERPFAVPENQVIEAAPAQEQDAMMN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.25
3	0.22
4	0.2
5	0.2
6	0.21
7	0.22
8	0.22
9	0.22
10	0.2
11	0.21
12	0.22
13	0.21
14	0.22
15	0.21
16	0.23
17	0.23
18	0.21
19	0.17
20	0.15
21	0.14
22	0.1
23	0.1
24	0.08
25	0.06
26	0.05
27	0.05
28	0.05
29	0.06
30	0.06
31	0.05
32	0.05
33	0.05
34	0.06
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.06
39	0.06
40	0.06
41	0.08
42	0.08
43	0.08
44	0.08
45	0.1
46	0.12
47	0.13
48	0.15
49	0.14
50	0.15
51	0.16
52	0.17
53	0.16
54	0.2
55	0.2
56	0.21
57	0.21
58	0.19
59	0.19
60	0.19
61	0.17
62	0.12
63	0.12
64	0.12
65	0.11
66	0.13
67	0.12
68	0.14
69	0.14
70	0.14
71	0.14
72	0.11
73	0.1
74	0.08
75	0.08
76	0.05
77	0.04
78	0.04
79	0.05
80	0.05
81	0.06
82	0.07
83	0.08
84	0.1
85	0.11
86	0.12
87	0.13
88	0.15
89	0.17
90	0.22
91	0.23
92	0.28
93	0.31
94	0.3
95	0.28
96	0.29
97	0.29
98	0.26
99	0.26
100	0.27
101	0.29
102	0.33
103	0.36
104	0.37
105	0.37
106	0.38
107	0.44
108	0.43
109	0.45
110	0.47
111	0.5
112	0.56
113	0.55
114	0.59
115	0.56
116	0.57
117	0.56
118	0.59
119	0.58
120	0.57
121	0.59
122	0.54
123	0.48
124	0.44
125	0.38
126	0.31
127	0.27
128	0.19
129	0.15
130	0.15
131	0.14
132	0.12
133	0.13
134	0.12
135	0.11
136	0.12
137	0.12
138	0.11
139	0.17
140	0.18
141	0.17
142	0.17
143	0.17
144	0.17
145	0.16
146	0.15
147	0.09
148	0.09
149	0.07
150	0.06
151	0.07
152	0.06
153	0.06
154	0.07
155	0.07
156	0.06
157	0.06
158	0.08
159	0.07
160	0.09
161	0.1
162	0.1
163	0.12
164	0.13
165	0.16
166	0.15
167	0.15
168	0.14
169	0.16
170	0.16
171	0.14
172	0.13
173	0.09
174	0.1
175	0.11
176	0.11
177	0.11
178	0.13
179	0.18
180	0.23
181	0.29
182	0.38
183	0.43
184	0.45
185	0.48
186	0.5
187	0.48
188	0.46
189	0.44
190	0.38
191	0.4
192	0.42
193	0.44
194	0.45
195	0.44
196	0.44
197	0.51
198	0.54
199	0.47
200	0.48
201	0.46
202	0.44
203	0.43
204	0.38
205	0.29
206	0.22
207	0.18
208	0.13
209	0.08
210	0.05
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.04
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.06
219	0.08
220	0.16
221	0.22
222	0.29
223	0.37
224	0.44
225	0.48
226	0.52
227	0.6
228	0.63
229	0.65
230	0.65
231	0.63
232	0.61
233	0.61
234	0.65
235	0.64
236	0.58
237	0.55
238	0.53
239	0.5
240	0.49
241	0.45
242	0.41
243	0.34
244	0.34
245	0.38
246	0.37
247	0.32
248	0.32
249	0.32
250	0.33
251	0.38
252	0.42
253	0.36
254	0.34
255	0.36
256	0.35
257	0.36
258	0.34
259	0.31
260	0.24
261	0.24
262	0.27
263	0.28
264	0.27
265	0.25
266	0.23
267	0.19
268	0.2
269	0.17
270	0.14
271	0.12
272	0.12
273	0.12
274	0.13
275	0.13
276	0.13
277	0.14
278	0.15
279	0.17
280	0.24
281	0.29
282	0.3
283	0.35
284	0.43
285	0.42
286	0.41
287	0.41
288	0.35
289	0.3
290	0.35
291	0.36
292	0.28
293	0.31
294	0.3
295	0.26
296	0.26
297	0.26
298	0.22
299	0.16
300	0.15
301	0.14
302	0.16
303	0.19
304	0.17
305	0.18
306	0.15
307	0.14
308	0.19
309	0.18
310	0.2
311	0.23
312	0.28
313	0.28
314	0.31
315	0.31
316	0.28
317	0.32
318	0.3
319	0.33
320	0.3
321	0.31
322	0.33
323	0.39
324	0.38
325	0.32
326	0.31
327	0.22
328	0.23
329	0.22
330	0.16
331	0.12
332	0.11
333	0.12
334	0.14
335	0.14
336	0.15
337	0.15
338	0.2
339	0.2
340	0.22
341	0.24
342	0.27
343	0.31
344	0.33
345	0.38
346	0.36
347	0.38
348	0.38
349	0.37
350	0.39
351	0.41
352	0.43
353	0.43
354	0.43
355	0.43
356	0.41
357	0.42
358	0.42
359	0.36
360	0.34
361	0.33
362	0.35
363	0.33
364	0.38
365	0.37
366	0.33
367	0.39
368	0.43
369	0.47
370	0.48
371	0.53
372	0.55
373	0.62
374	0.65
375	0.63
376	0.66
377	0.6
378	0.57
379	0.52
380	0.51
381	0.45
382	0.43
383	0.46
384	0.43
385	0.5
386	0.56
387	0.65
388	0.62
389	0.69
390	0.72
391	0.74
392	0.76
393	0.77
394	0.8
395	0.78
396	0.83
397	0.82
398	0.88
399	0.82
400	0.75
401	0.65
402	0.56
403	0.5
404	0.45
405	0.41
406	0.32
407	0.28
408	0.25
409	0.27
410	0.25
411	0.24
412	0.19
413	0.21
414	0.26
415	0.26
416	0.27
417	0.25
418	0.28
419	0.3
420	0.3
421	0.27
422	0.19
423	0.21
424	0.21
425	0.21
426	0.27
427	0.27
428	0.28
429	0.29
430	0.33
431	0.31
432	0.32
433	0.34
434	0.33
435	0.35
436	0.39
437	0.41
438	0.4
439	0.48
440	0.53
441	0.58
442	0.6
443	0.59
444	0.57
445	0.61
446	0.64
447	0.59
448	0.61
449	0.58
450	0.54
451	0.58
452	0.59
453	0.59
454	0.55
455	0.57
456	0.51
457	0.46
458	0.47
459	0.39
460	0.37
461	0.28
462	0.29
463	0.24
464	0.23
465	0.24
466	0.19
467	0.21
468	0.19
469	0.22
470	0.23
471	0.24
472	0.26
473	0.27
474	0.26
475	0.25
476	0.3
477	0.32
478	0.32
479	0.33
480	0.34
481	0.33
482	0.32
483	0.29
484	0.24
485	0.2
486	0.18
487	0.15
488	0.11
489	0.12
490	0.13

C5E2M7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer