Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DJZ2

Protein Details
Accession C5DJZ2    Localization Confidence High Confidence Score 24.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-251RFLPMFKKRNVARKKPKNIKPKENKVYTPFHydrophilic
268-292EYFLTKKEKEAKKLEERKREQAEKQBasic
309-332KGYEGSSKKRRHEVQESPKKKTKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-244KKRNVARKKPKNIKPKE
273-302KKEKEAKKLEERKREQAEKQVEKNKERAKD
308-332EKGYEGSSKKRRHEVQESPKKKTKV
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG lth:KLTH0F00506g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MPSTHNKDKPWDTPDIDKWKIEEFKPEDNVSGMPFAEESSFMTLFPKYREAYLKSVWNDVTRALDKHNIACVLDLVEGSMTVKTTRRTYDPAIILKARDLIKLLARSVPFPQAVKILQDDTACDVIKIGNFVSNKERFVKRRQRLVGPNGNTLKALELLTKCYILVQGNTVSAMGPFKGLKEVRRVVEDCMRNIHPIYHIKELMIKRELAKRPDLAEEDWSRFLPMFKKRNVARKKPKNIKPKENKVYTPFPPAQQPRKIDLQIESGEYFLTKKEKEAKKLEERKREQAEKQVEKNKERAKDYVAPIEKGYEGSSKKRRHEVQESPKKKTKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.65
3 0.61
4 0.55
5 0.51
6 0.52
7 0.53
8 0.46
9 0.47
10 0.43
11 0.48
12 0.52
13 0.51
14 0.44
15 0.4
16 0.39
17 0.31
18 0.27
19 0.19
20 0.13
21 0.12
22 0.11
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.13
27 0.13
28 0.13
29 0.14
30 0.15
31 0.17
32 0.19
33 0.23
34 0.19
35 0.23
36 0.3
37 0.33
38 0.37
39 0.4
40 0.45
41 0.41
42 0.45
43 0.42
44 0.38
45 0.34
46 0.3
47 0.31
48 0.26
49 0.26
50 0.24
51 0.28
52 0.28
53 0.3
54 0.32
55 0.27
56 0.24
57 0.23
58 0.21
59 0.16
60 0.14
61 0.12
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.1
70 0.13
71 0.16
72 0.2
73 0.23
74 0.28
75 0.32
76 0.38
77 0.41
78 0.41
79 0.42
80 0.41
81 0.37
82 0.33
83 0.34
84 0.26
85 0.21
86 0.19
87 0.17
88 0.2
89 0.22
90 0.22
91 0.21
92 0.2
93 0.21
94 0.22
95 0.24
96 0.21
97 0.19
98 0.19
99 0.18
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.15
104 0.15
105 0.15
106 0.14
107 0.14
108 0.16
109 0.14
110 0.12
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.08
116 0.1
117 0.1
118 0.12
119 0.19
120 0.2
121 0.22
122 0.26
123 0.32
124 0.31
125 0.42
126 0.51
127 0.51
128 0.59
129 0.61
130 0.64
131 0.66
132 0.71
133 0.7
134 0.62
135 0.63
136 0.54
137 0.5
138 0.42
139 0.34
140 0.26
141 0.18
142 0.15
143 0.11
144 0.1
145 0.12
146 0.13
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.12
151 0.1
152 0.1
153 0.08
154 0.09
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.11
166 0.12
167 0.14
168 0.21
169 0.25
170 0.25
171 0.3
172 0.31
173 0.28
174 0.35
175 0.34
176 0.28
177 0.29
178 0.29
179 0.25
180 0.25
181 0.23
182 0.2
183 0.23
184 0.26
185 0.26
186 0.25
187 0.24
188 0.31
189 0.31
190 0.31
191 0.27
192 0.25
193 0.23
194 0.32
195 0.37
196 0.33
197 0.36
198 0.33
199 0.33
200 0.36
201 0.35
202 0.28
203 0.29
204 0.29
205 0.29
206 0.28
207 0.26
208 0.22
209 0.2
210 0.21
211 0.21
212 0.27
213 0.31
214 0.33
215 0.42
216 0.46
217 0.56
218 0.64
219 0.69
220 0.71
221 0.75
222 0.83
223 0.86
224 0.9
225 0.9
226 0.9
227 0.91
228 0.9
229 0.91
230 0.89
231 0.86
232 0.82
233 0.78
234 0.75
235 0.67
236 0.64
237 0.56
238 0.48
239 0.5
240 0.53
241 0.55
242 0.55
243 0.56
244 0.52
245 0.57
246 0.57
247 0.5
248 0.44
249 0.41
250 0.35
251 0.34
252 0.3
253 0.22
254 0.21
255 0.18
256 0.16
257 0.12
258 0.16
259 0.13
260 0.18
261 0.28
262 0.36
263 0.44
264 0.53
265 0.6
266 0.66
267 0.76
268 0.81
269 0.82
270 0.81
271 0.83
272 0.84
273 0.82
274 0.76
275 0.75
276 0.76
277 0.74
278 0.77
279 0.76
280 0.74
281 0.71
282 0.76
283 0.73
284 0.7
285 0.65
286 0.59
287 0.58
288 0.58
289 0.59
290 0.6
291 0.57
292 0.51
293 0.48
294 0.46
295 0.39
296 0.31
297 0.29
298 0.25
299 0.25
300 0.33
301 0.42
302 0.48
303 0.54
304 0.63
305 0.69
306 0.71
307 0.78
308 0.79
309 0.81
310 0.84
311 0.84
312 0.84