FuNGI

C5DBG0

Protein Details

Accession

C5DBG0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
550-569	SPEASAKKVKYKNRIRFLAI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
KEGG	lth:KLTH0A02310g -
Pfam	View protein in Pfam PF13812 PPR_3
PROSITE	View protein in PROSITE PS51375 PPR

Amino Acid Sequences

MGLLATLGSGIAKNGIREPSVVAEKSFRAVPTKARCGVDLKVDRQGGVQPTKLKNEYVLRNIHVVGKGSNFERSAVQDYLSPFTSHQFARHKLPCAYNEDRARANFTALKKLKSSKNSETLLFSSSQQYVGEMIPLLVALTPQEVSTGHAKRNFRSEVFEEIPSIIDFTQNAESFANYVTLLTHSKFYYKKSSFLNGVIPKILRNILHPSNMKTMQFRDVGVFNDVIFFFSEKSDYATCRELFSQMKLEGVKPNTKTFNLMLRNALKNSHIRKSRHPLHDAVYYLRQMQHHEIKADAVTWVTCFNLLLEDMSRDVFLENMIKSNVPITPQLVLAVLSSNPLNSSQALKFLSEYSVPLNSKLFNFCIKKLLSEEKYEAAWAFVDHAHKNADFNLDHESLNAFLRRFAESGRLDLALLTFNTACKRYQISGNLHSFDMLFKALVRNGYTQNFPIVFEYLSRKRRRYARGVQIFSYWLSKAHSMVKFNMKHQVTEGDIEKAKSLLDSALWTSKGLRWKCWRESEQSQRKVFRYLGCIPTTVKAKTTHFIHDTSPEASAKKVKYKNRIRFLAIQNAMAKRIPYAHDRYRALKEELRHRGIM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.21
3	0.21
4	0.22
5	0.24
6	0.26
7	0.31
8	0.31
9	0.28
10	0.29
11	0.29
12	0.31
13	0.31
14	0.26
15	0.25
16	0.26
17	0.34
18	0.4
19	0.47
20	0.51
21	0.5
22	0.51
23	0.5
24	0.5
25	0.51
26	0.5
27	0.45
28	0.46
29	0.45
30	0.43
31	0.41
32	0.43
33	0.4
34	0.37
35	0.38
36	0.38
37	0.42
38	0.5
39	0.51
40	0.46
41	0.45
42	0.49
43	0.52
44	0.5
45	0.51
46	0.46
47	0.47
48	0.47
49	0.44
50	0.38
51	0.32
52	0.27
53	0.25
54	0.26
55	0.24
56	0.28
57	0.24
58	0.23
59	0.23
60	0.25
61	0.28
62	0.25
63	0.24
64	0.23
65	0.25
66	0.27
67	0.26
68	0.23
69	0.18
70	0.19
71	0.23
72	0.21
73	0.26
74	0.3
75	0.33
76	0.41
77	0.47
78	0.51
79	0.52
80	0.57
81	0.54
82	0.55
83	0.56
84	0.56
85	0.56
86	0.53
87	0.52
88	0.47
89	0.49
90	0.41
91	0.39
92	0.36
93	0.32
94	0.39
95	0.38
96	0.4
97	0.38
98	0.45
99	0.49
100	0.53
101	0.59
102	0.56
103	0.61
104	0.61
105	0.59
106	0.56
107	0.49
108	0.43
109	0.36
110	0.29
111	0.24
112	0.22
113	0.21
114	0.16
115	0.15
116	0.15
117	0.13
118	0.13
119	0.09
120	0.08
121	0.07
122	0.07
123	0.06
124	0.05
125	0.05
126	0.04
127	0.05
128	0.05
129	0.05
130	0.06
131	0.06
132	0.08
133	0.17
134	0.19
135	0.23
136	0.29
137	0.31
138	0.33
139	0.4
140	0.42
141	0.35
142	0.38
143	0.37
144	0.39
145	0.39
146	0.38
147	0.31
148	0.27
149	0.27
150	0.21
151	0.19
152	0.11
153	0.09
154	0.08
155	0.1
156	0.14
157	0.13
158	0.15
159	0.14
160	0.14
161	0.14
162	0.14
163	0.12
164	0.07
165	0.07
166	0.06
167	0.08
168	0.1
169	0.1
170	0.12
171	0.12
172	0.17
173	0.19
174	0.22
175	0.31
176	0.31
177	0.35
178	0.37
179	0.42
180	0.4
181	0.4
182	0.45
183	0.37
184	0.37
185	0.34
186	0.3
187	0.25
188	0.25
189	0.25
190	0.16
191	0.16
192	0.22
193	0.22
194	0.29
195	0.3
196	0.31
197	0.36
198	0.38
199	0.36
200	0.32
201	0.31
202	0.29
203	0.28
204	0.25
205	0.21
206	0.2
207	0.2
208	0.19
209	0.17
210	0.12
211	0.13
212	0.12
213	0.11
214	0.1
215	0.09
216	0.07
217	0.07
218	0.08
219	0.07
220	0.1
221	0.1
222	0.11
223	0.13
224	0.17
225	0.17
226	0.18
227	0.19
228	0.19
229	0.19
230	0.2
231	0.22
232	0.18
233	0.19
234	0.19
235	0.2
236	0.21
237	0.23
238	0.27
239	0.24
240	0.28
241	0.29
242	0.29
243	0.3
244	0.26
245	0.31
246	0.3
247	0.29
248	0.3
249	0.31
250	0.33
251	0.31
252	0.3
253	0.25
254	0.28
255	0.31
256	0.34
257	0.37
258	0.38
259	0.45
260	0.54
261	0.61
262	0.61
263	0.59
264	0.54
265	0.5
266	0.51
267	0.45
268	0.37
269	0.3
270	0.24
271	0.22
272	0.21
273	0.19
274	0.17
275	0.21
276	0.25
277	0.24
278	0.24
279	0.23
280	0.21
281	0.21
282	0.19
283	0.14
284	0.07
285	0.06
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.06
299	0.06
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.07
305	0.07
306	0.08
307	0.08
308	0.08
309	0.08
310	0.09
311	0.1
312	0.08
313	0.09
314	0.09
315	0.09
316	0.09
317	0.1
318	0.09
319	0.08
320	0.07
321	0.07
322	0.06
323	0.06
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.06
328	0.06
329	0.07
330	0.1
331	0.1
332	0.13
333	0.14
334	0.14
335	0.14
336	0.14
337	0.14
338	0.11
339	0.12
340	0.1
341	0.14
342	0.14
343	0.14
344	0.15
345	0.14
346	0.15
347	0.17
348	0.17
349	0.19
350	0.22
351	0.22
352	0.27
353	0.26
354	0.26
355	0.28
356	0.35
357	0.3
358	0.31
359	0.32
360	0.28
361	0.27
362	0.27
363	0.23
364	0.15
365	0.12
366	0.08
367	0.08
368	0.09
369	0.12
370	0.12
371	0.13
372	0.15
373	0.14
374	0.15
375	0.15
376	0.17
377	0.14
378	0.15
379	0.19
380	0.19
381	0.19
382	0.18
383	0.17
384	0.14
385	0.16
386	0.17
387	0.11
388	0.11
389	0.13
390	0.14
391	0.14
392	0.14
393	0.2
394	0.19
395	0.2
396	0.2
397	0.19
398	0.17
399	0.17
400	0.17
401	0.1
402	0.1
403	0.09
404	0.08
405	0.09
406	0.11
407	0.12
408	0.12
409	0.13
410	0.17
411	0.18
412	0.24
413	0.3
414	0.35
415	0.42
416	0.46
417	0.45
418	0.41
419	0.39
420	0.33
421	0.26
422	0.2
423	0.12
424	0.08
425	0.07
426	0.09
427	0.11
428	0.13
429	0.14
430	0.17
431	0.2
432	0.23
433	0.24
434	0.23
435	0.25
436	0.23
437	0.22
438	0.2
439	0.18
440	0.15
441	0.16
442	0.23
443	0.27
444	0.36
445	0.42
446	0.43
447	0.49
448	0.58
449	0.64
450	0.67
451	0.69
452	0.71
453	0.75
454	0.76
455	0.7
456	0.63
457	0.56
458	0.47
459	0.39
460	0.28
461	0.19
462	0.17
463	0.17
464	0.17
465	0.24
466	0.27
467	0.28
468	0.33
469	0.41
470	0.42
471	0.43
472	0.5
473	0.43
474	0.4
475	0.39
476	0.37
477	0.3
478	0.31
479	0.3
480	0.26
481	0.27
482	0.27
483	0.25
484	0.21
485	0.19
486	0.15
487	0.14
488	0.09
489	0.08
490	0.1
491	0.12
492	0.16
493	0.17
494	0.17
495	0.18
496	0.21
497	0.29
498	0.29
499	0.35
500	0.41
501	0.5
502	0.58
503	0.66
504	0.67
505	0.67
506	0.75
507	0.78
508	0.78
509	0.79
510	0.78
511	0.75
512	0.72
513	0.69
514	0.62
515	0.56
516	0.53
517	0.52
518	0.51
519	0.46
520	0.46
521	0.42
522	0.43
523	0.43
524	0.37
525	0.33
526	0.32
527	0.34
528	0.39
529	0.41
530	0.44
531	0.41
532	0.42
533	0.41
534	0.4
535	0.4
536	0.34
537	0.33
538	0.27
539	0.25
540	0.26
541	0.31
542	0.31
543	0.38
544	0.44
545	0.5
546	0.59
547	0.69
548	0.77
549	0.8
550	0.82
551	0.78
552	0.8
553	0.78
554	0.78
555	0.69
556	0.64
557	0.6
558	0.55
559	0.5
560	0.42
561	0.35
562	0.27
563	0.29
564	0.27
565	0.29
566	0.36
567	0.42
568	0.5
569	0.54
570	0.59
571	0.62
572	0.65
573	0.63
574	0.59
575	0.58
576	0.6
577	0.65

C5DBG0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer