Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DIC6

Protein Details
Accession C5DIC6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
715-740IGYHPFFKYCLKQKRKKEAAVYVRMIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, cyto 2.5, mito 1, plas 1, pero 1, E.R. 1, golg 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016534  VPS16  
IPR006925  Vps16_C  
IPR038132  Vps16_C_sf  
IPR006926  Vps16_N  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0012505  C:endomembrane system  
GO:0043231  C:intracellular membrane-bounded organelle  
GO:0032991  C:protein-containing complex  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007033  P:vacuole organization  
KEGG lth:KLTH0E11462g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04840  Vps16_C  
PF04841  Vps16_N  
Amino Acid Sequences MGVKNPSLGWEKLKDVYYRNRELCQLSLPKEDQYKLIISTTVLAIEVEESIRVFQYKGEQLGVIELNKLPSELVCYELDSFDEGSLVLALSDRIRVYHNWSPLLFQDFLLPDTIQDKIWDYKNRVLVLSSSQDLFYFDGLGLQVLLKNTENFTLLTKNHWHCNEDIVVLLDLDHVFHLNIKSLELVPMFMGETWHTVSVSPRGLVCLFNAKTNELRIYKDSKTKLMELNLETQPNDMAWCGDDTIACAFNHEEIRLYGPDSEYVTFWYPDEIIVLRGESNGLRLITSEKVELISKVQQFTSNIFLMGSTEPSAILLDSVNLLSTQAPRALENLKIINLDQGVAECLDAALEELDPYWQKKLLAAAAFGKSSLPKNTQLSKVFVETCNKLRVLNVLTEMGIILTSSNLLVITLDGLIARLIKTGNFYECIQICKFLKDRGRLASIFKSWANAKIAFSADLDDEDLFKVIIRLAEGLSVQLPLAEIGLAAFSEGRPALAKQLVLKEPLPDLELPSLLELDEHELALKEGRRRGIPGMIMSILLILQKQLTTSQFTKVIMLVMQDNQLYTYYARHDDEFLFDFYRQTDQLSNLAHHIWDQEVRNQNPAEYLRQVEELYNRDSQDILIKNDQSLLHRQSELYEFQRSISHLLQVDLENMNLDGTIELLIKMKLDKQLNSLIKKFKVTDRKIYHIKCRVLTQQDRFDDLFKFAQERKSPIGYHPFFKYCLKQKRKKEAAVYVRMISGIPYEKRIEMYLRCESYNDAINLASKEKDIPSLKNIYKTIPPNQPQLKALVNEAMSKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.42
3 0.51
4 0.54
5 0.59
6 0.59
7 0.57
8 0.58
9 0.57
10 0.53
11 0.51
12 0.5
13 0.44
14 0.48
15 0.47
16 0.47
17 0.5
18 0.49
19 0.42
20 0.38
21 0.36
22 0.3
23 0.3
24 0.25
25 0.2
26 0.2
27 0.19
28 0.15
29 0.12
30 0.1
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.09
39 0.1
40 0.09
41 0.1
42 0.18
43 0.22
44 0.24
45 0.25
46 0.24
47 0.24
48 0.28
49 0.28
50 0.21
51 0.18
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.17
56 0.13
57 0.11
58 0.15
59 0.14
60 0.16
61 0.15
62 0.17
63 0.18
64 0.18
65 0.18
66 0.15
67 0.15
68 0.11
69 0.11
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.12
82 0.14
83 0.22
84 0.28
85 0.32
86 0.34
87 0.34
88 0.35
89 0.36
90 0.39
91 0.32
92 0.25
93 0.25
94 0.22
95 0.23
96 0.23
97 0.2
98 0.15
99 0.16
100 0.17
101 0.12
102 0.12
103 0.15
104 0.18
105 0.25
106 0.32
107 0.36
108 0.41
109 0.47
110 0.48
111 0.45
112 0.41
113 0.35
114 0.33
115 0.31
116 0.26
117 0.21
118 0.19
119 0.19
120 0.19
121 0.18
122 0.13
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.12
136 0.13
137 0.14
138 0.13
139 0.15
140 0.19
141 0.18
142 0.22
143 0.29
144 0.31
145 0.38
146 0.4
147 0.4
148 0.35
149 0.39
150 0.36
151 0.28
152 0.25
153 0.19
154 0.17
155 0.14
156 0.14
157 0.1
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.08
164 0.09
165 0.11
166 0.12
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.16
171 0.13
172 0.13
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.07
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.12
185 0.16
186 0.17
187 0.16
188 0.14
189 0.16
190 0.17
191 0.17
192 0.16
193 0.21
194 0.2
195 0.23
196 0.24
197 0.24
198 0.25
199 0.27
200 0.32
201 0.24
202 0.27
203 0.27
204 0.31
205 0.34
206 0.4
207 0.4
208 0.39
209 0.41
210 0.41
211 0.42
212 0.4
213 0.41
214 0.36
215 0.39
216 0.36
217 0.34
218 0.31
219 0.27
220 0.23
221 0.17
222 0.16
223 0.09
224 0.07
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.09
232 0.11
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.13
237 0.14
238 0.13
239 0.13
240 0.11
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.13
245 0.12
246 0.13
247 0.14
248 0.14
249 0.11
250 0.13
251 0.14
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.11
256 0.1
257 0.11
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.11
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.1
276 0.11
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.16
281 0.17
282 0.18
283 0.18
284 0.2
285 0.2
286 0.22
287 0.23
288 0.17
289 0.16
290 0.14
291 0.14
292 0.13
293 0.12
294 0.11
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.07
312 0.08
313 0.09
314 0.09
315 0.11
316 0.13
317 0.13
318 0.15
319 0.15
320 0.14
321 0.14
322 0.13
323 0.13
324 0.11
325 0.1
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.06
330 0.06
331 0.04
332 0.04
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.04
341 0.05
342 0.06
343 0.07
344 0.08
345 0.08
346 0.09
347 0.11
348 0.13
349 0.13
350 0.14
351 0.16
352 0.16
353 0.16
354 0.15
355 0.13
356 0.11
357 0.12
358 0.14
359 0.14
360 0.17
361 0.22
362 0.26
363 0.31
364 0.32
365 0.33
366 0.32
367 0.31
368 0.29
369 0.27
370 0.26
371 0.23
372 0.23
373 0.23
374 0.22
375 0.2
376 0.18
377 0.2
378 0.18
379 0.16
380 0.14
381 0.12
382 0.12
383 0.11
384 0.11
385 0.07
386 0.06
387 0.04
388 0.03
389 0.02
390 0.02
391 0.02
392 0.02
393 0.02
394 0.02
395 0.03
396 0.02
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.07
409 0.08
410 0.09
411 0.11
412 0.11
413 0.14
414 0.15
415 0.18
416 0.16
417 0.19
418 0.18
419 0.2
420 0.21
421 0.23
422 0.28
423 0.3
424 0.33
425 0.33
426 0.37
427 0.34
428 0.36
429 0.34
430 0.29
431 0.27
432 0.24
433 0.22
434 0.19
435 0.22
436 0.22
437 0.19
438 0.18
439 0.18
440 0.19
441 0.17
442 0.16
443 0.13
444 0.1
445 0.09
446 0.09
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.07
462 0.06
463 0.06
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.04
468 0.04
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.05
481 0.06
482 0.09
483 0.1
484 0.11
485 0.12
486 0.18
487 0.19
488 0.21
489 0.21
490 0.2
491 0.19
492 0.19
493 0.18
494 0.13
495 0.13
496 0.11
497 0.11
498 0.1
499 0.1
500 0.09
501 0.07
502 0.07
503 0.05
504 0.08
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.08
510 0.11
511 0.14
512 0.14
513 0.17
514 0.2
515 0.21
516 0.23
517 0.25
518 0.26
519 0.25
520 0.22
521 0.21
522 0.19
523 0.18
524 0.16
525 0.13
526 0.09
527 0.07
528 0.06
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.05
533 0.07
534 0.09
535 0.14
536 0.15
537 0.18
538 0.2
539 0.21
540 0.21
541 0.19
542 0.19
543 0.14
544 0.14
545 0.12
546 0.11
547 0.12
548 0.11
549 0.11
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.09
554 0.1
555 0.11
556 0.15
557 0.16
558 0.16
559 0.18
560 0.18
561 0.2
562 0.21
563 0.2
564 0.18
565 0.17
566 0.17
567 0.16
568 0.18
569 0.15
570 0.14
571 0.15
572 0.15
573 0.19
574 0.2
575 0.2
576 0.19
577 0.19
578 0.17
579 0.15
580 0.14
581 0.12
582 0.14
583 0.15
584 0.21
585 0.29
586 0.3
587 0.35
588 0.34
589 0.33
590 0.33
591 0.34
592 0.31
593 0.24
594 0.25
595 0.22
596 0.23
597 0.23
598 0.21
599 0.23
600 0.22
601 0.23
602 0.25
603 0.23
604 0.22
605 0.22
606 0.2
607 0.23
608 0.23
609 0.24
610 0.26
611 0.26
612 0.26
613 0.29
614 0.3
615 0.26
616 0.3
617 0.29
618 0.28
619 0.28
620 0.28
621 0.27
622 0.29
623 0.31
624 0.27
625 0.27
626 0.24
627 0.24
628 0.27
629 0.25
630 0.26
631 0.23
632 0.24
633 0.21
634 0.21
635 0.22
636 0.2
637 0.22
638 0.18
639 0.16
640 0.12
641 0.11
642 0.11
643 0.08
644 0.08
645 0.05
646 0.05
647 0.06
648 0.06
649 0.06
650 0.07
651 0.08
652 0.08
653 0.1
654 0.13
655 0.19
656 0.23
657 0.24
658 0.27
659 0.37
660 0.44
661 0.48
662 0.51
663 0.51
664 0.5
665 0.52
666 0.51
667 0.51
668 0.54
669 0.55
670 0.59
671 0.59
672 0.65
673 0.71
674 0.74
675 0.75
676 0.73
677 0.73
678 0.66
679 0.65
680 0.64
681 0.64
682 0.67
683 0.65
684 0.65
685 0.62
686 0.63
687 0.58
688 0.52
689 0.44
690 0.39
691 0.33
692 0.25
693 0.28
694 0.26
695 0.34
696 0.36
697 0.39
698 0.41
699 0.43
700 0.44
701 0.45
702 0.53
703 0.47
704 0.48
705 0.49
706 0.46
707 0.44
708 0.48
709 0.5
710 0.5
711 0.58
712 0.64
713 0.67
714 0.75
715 0.84
716 0.88
717 0.88
718 0.87
719 0.86
720 0.86
721 0.85
722 0.79
723 0.69
724 0.6
725 0.51
726 0.42
727 0.32
728 0.26
729 0.23
730 0.2
731 0.23
732 0.25
733 0.26
734 0.27
735 0.29
736 0.31
737 0.29
738 0.34
739 0.39
740 0.39
741 0.39
742 0.38
743 0.38
744 0.36
745 0.39
746 0.32
747 0.25
748 0.23
749 0.25
750 0.26
751 0.26
752 0.23
753 0.17
754 0.19
755 0.19
756 0.27
757 0.28
758 0.3
759 0.35
760 0.44
761 0.46
762 0.51
763 0.51
764 0.47
765 0.51
766 0.54
767 0.56
768 0.57
769 0.58
770 0.6
771 0.66
772 0.66
773 0.6
774 0.58
775 0.55
776 0.46
777 0.44
778 0.4
779 0.34