Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DH44

Protein Details
Accession C5DH44    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-124ESSNEEKSKPGNKRKKSPKTAKAAKKQKLSKKSSSSHydrophilic
389-416EKLGRVRGKDFTKNKNKMKRGSYRGGSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-120KSKPGNKRKKSPKTAKAAKKQKLSKK
394-408VRGKDFTKNKNKMKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG lth:KLTH0E01232g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MASKKSGKVAKSEAPKLSEKMKKEELSTSGSSSSSSSSSSSDSSSSRSSSSDESSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDSELSTSSGESSNEEKSKPGNKRKKSPKTAKAAKKQKLSKKSSSSESSSSSSSSGSSSSSSDSESSSSSSASSDESSSSSSSDSESSSSGSSSSSSGSSSSSSGSSSSSSDSDSSSSDSDSSSSGSDSSSSSSDSSSSDSDSSSSDSDSSSSGSDSSSSGSDSSSSGSSSSSSDSDSSSSSSGSSSSDSDSSESDASSSSSSDDEAEKSQLKSHSSPAGSSSSTKKNSKHDGETQETSQGSSSSSKTASPDAPSPAAPKDGIPAAVDELKPGQRKHFSRIDKNAIKFEDRVLTDNTYKGAAGTWGEKANEKLGRVRGKDFTKNKNKMKRGSYRGGSITLSSGSYKFTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.61
3 0.57
4 0.59
5 0.58
6 0.53
7 0.54
8 0.57
9 0.56
10 0.54
11 0.57
12 0.51
13 0.51
14 0.49
15 0.43
16 0.35
17 0.32
18 0.29
19 0.24
20 0.22
21 0.16
22 0.15
23 0.14
24 0.14
25 0.16
26 0.17
27 0.17
28 0.18
29 0.18
30 0.21
31 0.23
32 0.23
33 0.21
34 0.21
35 0.23
36 0.24
37 0.27
38 0.25
39 0.23
40 0.25
41 0.26
42 0.26
43 0.24
44 0.2
45 0.16
46 0.15
47 0.15
48 0.13
49 0.12
50 0.12
51 0.13
52 0.14
53 0.15
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.16
58 0.16
59 0.16
60 0.16
61 0.16
62 0.16
63 0.17
64 0.16
65 0.17
66 0.17
67 0.16
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.12
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.13
77 0.15
78 0.2
79 0.22
80 0.22
81 0.22
82 0.26
83 0.35
84 0.43
85 0.51
86 0.55
87 0.62
88 0.72
89 0.83
90 0.88
91 0.9
92 0.91
93 0.89
94 0.9
95 0.92
96 0.91
97 0.91
98 0.9
99 0.87
100 0.85
101 0.85
102 0.84
103 0.84
104 0.82
105 0.8
106 0.79
107 0.76
108 0.74
109 0.7
110 0.65
111 0.57
112 0.53
113 0.46
114 0.38
115 0.33
116 0.27
117 0.21
118 0.17
119 0.14
120 0.11
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.11
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.11
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.06
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.08
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.11
259 0.1
260 0.09
261 0.08
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.09
270 0.1
271 0.11
272 0.14
273 0.15
274 0.16
275 0.2
276 0.21
277 0.24
278 0.24
279 0.27
280 0.31
281 0.29
282 0.29
283 0.27
284 0.27
285 0.25
286 0.26
287 0.27
288 0.29
289 0.35
290 0.39
291 0.41
292 0.47
293 0.55
294 0.59
295 0.6
296 0.6
297 0.62
298 0.63
299 0.62
300 0.55
301 0.5
302 0.44
303 0.37
304 0.29
305 0.22
306 0.17
307 0.16
308 0.16
309 0.14
310 0.15
311 0.16
312 0.17
313 0.2
314 0.22
315 0.22
316 0.25
317 0.26
318 0.27
319 0.27
320 0.28
321 0.26
322 0.25
323 0.22
324 0.18
325 0.17
326 0.17
327 0.17
328 0.15
329 0.14
330 0.14
331 0.18
332 0.17
333 0.16
334 0.18
335 0.22
336 0.27
337 0.28
338 0.32
339 0.38
340 0.42
341 0.47
342 0.54
343 0.57
344 0.63
345 0.71
346 0.74
347 0.73
348 0.74
349 0.74
350 0.67
351 0.62
352 0.52
353 0.46
354 0.43
355 0.36
356 0.35
357 0.32
358 0.33
359 0.32
360 0.32
361 0.3
362 0.23
363 0.22
364 0.18
365 0.16
366 0.13
367 0.13
368 0.14
369 0.16
370 0.19
371 0.2
372 0.22
373 0.23
374 0.29
375 0.3
376 0.3
377 0.33
378 0.38
379 0.46
380 0.47
381 0.51
382 0.52
383 0.56
384 0.64
385 0.66
386 0.69
387 0.71
388 0.78
389 0.83
390 0.85
391 0.87
392 0.86
393 0.87
394 0.87
395 0.85
396 0.85
397 0.8
398 0.77
399 0.72
400 0.66
401 0.57
402 0.47
403 0.4
404 0.31
405 0.27
406 0.21
407 0.18