Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DBV1

Protein Details
Accession C5DBV1    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
152-171NGTTHSSKKRSNKHNSQIDTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024738  Hfi1/Tada1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070461  C:SAGA-type complex  
KEGG lth:KLTH0A05566g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12767  SAGA-Tad1  
Amino Acid Sequences MSVVQPQNTPVSPGSVHKQTGVTVSAHGQKPGGALTGTPTGTTVPGNQTNRLNIEKMVESLTAALGKESWSKYAQIISLFVLGKLSRKELVNELDLLFSPQQENQGQLMQGSNMSHGTLIRMHNQLLLAILTNSVRGSPLGESTEGSWGFNNGTTHSSKKRSNKHNSQIDTYKKIVMSLPAEDRSRLKTITKEAGKRGFVLCSVLQARLNNIPKIPIVTNPETLKRIKASNLKTPLEWSQEIVNGFSAPLATESYSLPDNDSLYLRMISIAREHGLVGAVDGRCVEIMTLALENYLKNVVESAIDTVRYREKYHSDYYDLNEEGFYQGVAGTDEEVACEGNELTRDLRSITNEEMAQTLSVFPNLVAPTGAYLNLSMCGLLNDDELVTMASTIDDLPEFQEDKPNFTPVDDKNVGSREELNWLIKDILTKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.33
3 0.34
4 0.33
5 0.34
6 0.31
7 0.33
8 0.31
9 0.25
10 0.21
11 0.24
12 0.3
13 0.3
14 0.3
15 0.26
16 0.24
17 0.25
18 0.24
19 0.21
20 0.13
21 0.11
22 0.14
23 0.19
24 0.18
25 0.17
26 0.16
27 0.15
28 0.16
29 0.17
30 0.17
31 0.18
32 0.27
33 0.29
34 0.34
35 0.37
36 0.4
37 0.43
38 0.43
39 0.38
40 0.31
41 0.32
42 0.28
43 0.26
44 0.24
45 0.2
46 0.17
47 0.16
48 0.15
49 0.13
50 0.12
51 0.1
52 0.08
53 0.1
54 0.15
55 0.16
56 0.18
57 0.18
58 0.19
59 0.21
60 0.24
61 0.24
62 0.2
63 0.2
64 0.18
65 0.21
66 0.2
67 0.19
68 0.17
69 0.16
70 0.18
71 0.19
72 0.2
73 0.19
74 0.2
75 0.22
76 0.26
77 0.3
78 0.28
79 0.28
80 0.26
81 0.24
82 0.22
83 0.23
84 0.17
85 0.14
86 0.13
87 0.12
88 0.16
89 0.16
90 0.18
91 0.17
92 0.19
93 0.18
94 0.18
95 0.17
96 0.13
97 0.14
98 0.12
99 0.11
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.1
105 0.12
106 0.14
107 0.18
108 0.19
109 0.19
110 0.2
111 0.2
112 0.19
113 0.15
114 0.13
115 0.09
116 0.07
117 0.08
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.09
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.16
132 0.15
133 0.15
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.14
138 0.14
139 0.1
140 0.13
141 0.15
142 0.19
143 0.24
144 0.29
145 0.34
146 0.42
147 0.51
148 0.59
149 0.67
150 0.74
151 0.78
152 0.81
153 0.78
154 0.75
155 0.73
156 0.68
157 0.62
158 0.53
159 0.45
160 0.36
161 0.33
162 0.28
163 0.24
164 0.2
165 0.18
166 0.2
167 0.21
168 0.22
169 0.22
170 0.22
171 0.22
172 0.23
173 0.21
174 0.19
175 0.19
176 0.24
177 0.31
178 0.36
179 0.37
180 0.4
181 0.44
182 0.43
183 0.41
184 0.37
185 0.29
186 0.23
187 0.22
188 0.16
189 0.15
190 0.15
191 0.14
192 0.15
193 0.14
194 0.16
195 0.2
196 0.23
197 0.2
198 0.19
199 0.19
200 0.18
201 0.2
202 0.19
203 0.15
204 0.18
205 0.2
206 0.23
207 0.24
208 0.26
209 0.26
210 0.26
211 0.25
212 0.21
213 0.2
214 0.22
215 0.28
216 0.3
217 0.36
218 0.43
219 0.42
220 0.4
221 0.42
222 0.39
223 0.36
224 0.32
225 0.25
226 0.19
227 0.2
228 0.2
229 0.18
230 0.15
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.07
265 0.1
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.03
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.08
283 0.07
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.11
293 0.13
294 0.18
295 0.2
296 0.22
297 0.24
298 0.28
299 0.32
300 0.38
301 0.4
302 0.38
303 0.39
304 0.4
305 0.41
306 0.36
307 0.31
308 0.25
309 0.21
310 0.18
311 0.15
312 0.11
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.08
330 0.09
331 0.1
332 0.11
333 0.12
334 0.14
335 0.16
336 0.19
337 0.2
338 0.23
339 0.22
340 0.22
341 0.21
342 0.19
343 0.16
344 0.13
345 0.13
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.08
350 0.12
351 0.13
352 0.13
353 0.11
354 0.1
355 0.12
356 0.13
357 0.13
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.06
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.08
384 0.12
385 0.14
386 0.14
387 0.23
388 0.23
389 0.29
390 0.32
391 0.34
392 0.3
393 0.3
394 0.37
395 0.3
396 0.4
397 0.35
398 0.34
399 0.36
400 0.39
401 0.39
402 0.34
403 0.35
404 0.26
405 0.3
406 0.33
407 0.3
408 0.28
409 0.29
410 0.28
411 0.25