Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DL57

Protein Details
Accession C5DL57    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-167NRQDSRPAKKLKSEKKKVAEENLPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
149-160RPAKKLKSEKKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040107  Snu23  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG lth:KLTH0F10186g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MSNFGRRTWDRDEYAELERESRGKLATIAEKLNPQQLEKLKTRYSNHALLVAEATQNSNERVLAPTITSYKKGKQFGFYCELCDLTFKDTLQFVNHLNHKTHQIKFELTFGESLILDLRDNEDVTVQEFEEVYSNLIRDFLKENRQDSRPAKKLKSEKKKVAEENLPLSDGVNKIMGFTGFGSTKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.45
3 0.38
4 0.32
5 0.3
6 0.29
7 0.25
8 0.22
9 0.19
10 0.15
11 0.16
12 0.19
13 0.24
14 0.25
15 0.27
16 0.27
17 0.3
18 0.31
19 0.35
20 0.31
21 0.26
22 0.3
23 0.33
24 0.38
25 0.39
26 0.44
27 0.43
28 0.49
29 0.52
30 0.54
31 0.54
32 0.52
33 0.48
34 0.46
35 0.41
36 0.34
37 0.31
38 0.23
39 0.18
40 0.13
41 0.12
42 0.09
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.08
47 0.09
48 0.1
49 0.11
50 0.1
51 0.09
52 0.1
53 0.14
54 0.15
55 0.17
56 0.18
57 0.23
58 0.29
59 0.35
60 0.34
61 0.38
62 0.4
63 0.42
64 0.46
65 0.4
66 0.36
67 0.31
68 0.3
69 0.22
70 0.2
71 0.15
72 0.12
73 0.13
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.12
78 0.11
79 0.12
80 0.11
81 0.15
82 0.19
83 0.2
84 0.2
85 0.21
86 0.28
87 0.31
88 0.32
89 0.31
90 0.29
91 0.29
92 0.29
93 0.3
94 0.24
95 0.19
96 0.17
97 0.14
98 0.13
99 0.1
100 0.09
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.09
112 0.1
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.1
124 0.09
125 0.1
126 0.14
127 0.18
128 0.26
129 0.3
130 0.34
131 0.38
132 0.4
133 0.47
134 0.49
135 0.55
136 0.55
137 0.59
138 0.6
139 0.63
140 0.72
141 0.74
142 0.79
143 0.79
144 0.8
145 0.81
146 0.86
147 0.84
148 0.82
149 0.79
150 0.74
151 0.7
152 0.62
153 0.54
154 0.44
155 0.38
156 0.32
157 0.25
158 0.2
159 0.16
160 0.14
161 0.14
162 0.15
163 0.15
164 0.12
165 0.13
166 0.16