Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DJA2

Protein Details
Accession C5DJA2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-195NEKNKQFNDKIERQTKKREENHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG lth:KLTH0F14784g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MDLNKYADRLKNLKRKGVSLSVKNKQQILQEEKQTSARAKPAVYSMKTEEAPSSETTEESKEAKLLQYSMKDFEQWQDKERRKSQKSSDVAKYQDLAKFTYDKEVQQLRKNYTNKVEKPKKVSINKKGKIVVKDDPHLVGSLADSLNKTANERYARIEKKIHRQMVSDTPGGFINEKNKQFNDKIERQTKKREEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.63
3 0.62
4 0.64
5 0.63
6 0.63
7 0.67
8 0.66
9 0.7
10 0.69
11 0.65
12 0.58
13 0.56
14 0.55
15 0.54
16 0.53
17 0.54
18 0.52
19 0.52
20 0.51
21 0.48
22 0.41
23 0.36
24 0.35
25 0.29
26 0.27
27 0.27
28 0.31
29 0.36
30 0.35
31 0.35
32 0.33
33 0.35
34 0.35
35 0.35
36 0.28
37 0.22
38 0.23
39 0.2
40 0.2
41 0.15
42 0.15
43 0.16
44 0.17
45 0.17
46 0.16
47 0.15
48 0.12
49 0.13
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.15
54 0.17
55 0.19
56 0.21
57 0.2
58 0.2
59 0.19
60 0.21
61 0.27
62 0.24
63 0.28
64 0.35
65 0.41
66 0.48
67 0.56
68 0.62
69 0.58
70 0.65
71 0.66
72 0.67
73 0.67
74 0.66
75 0.64
76 0.58
77 0.55
78 0.49
79 0.42
80 0.35
81 0.3
82 0.24
83 0.19
84 0.15
85 0.15
86 0.14
87 0.19
88 0.17
89 0.16
90 0.2
91 0.26
92 0.28
93 0.33
94 0.38
95 0.37
96 0.44
97 0.46
98 0.45
99 0.47
100 0.53
101 0.53
102 0.59
103 0.64
104 0.6
105 0.66
106 0.7
107 0.7
108 0.71
109 0.74
110 0.74
111 0.76
112 0.75
113 0.73
114 0.71
115 0.67
116 0.61
117 0.56
118 0.53
119 0.47
120 0.46
121 0.42
122 0.37
123 0.32
124 0.28
125 0.23
126 0.16
127 0.11
128 0.11
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.12
134 0.12
135 0.14
136 0.13
137 0.2
138 0.22
139 0.23
140 0.28
141 0.35
142 0.38
143 0.41
144 0.48
145 0.49
146 0.57
147 0.65
148 0.66
149 0.59
150 0.58
151 0.59
152 0.6
153 0.58
154 0.49
155 0.4
156 0.34
157 0.33
158 0.32
159 0.27
160 0.21
161 0.24
162 0.29
163 0.34
164 0.38
165 0.4
166 0.45
167 0.47
168 0.54
169 0.56
170 0.56
171 0.62
172 0.67
173 0.73
174 0.72
175 0.81