Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5P817

Protein Details
Accession A0A5N5P817    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
301-323WTTTTNGGKRKKRKGALTNGSSYHydrophilic
387-406QYSTFNKKYVRKGWRTGTEQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
309-314KRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPRGKWIDKKTATHFTLVHRPQNDPLIHDESAPAMVFNPTHQQNGSKIKKLGDLASELGSDAASIRENEGEAANYGIYYDDTEYDYMQHMRDIGQGTGEAVFVPAEPLGDKNKNKGKGKESLEDALRQLDLDNSSKDLLDETMLPSKNLPKASYQAQQDVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDDDEDIFQELAKDPTAIDEYEFDETYDEDYPFEDDEGWESDATAKPNKEYNEEQEDVVPDLVDRSAGAGQPEQGPSEDWLEDFKKFKQDQKTEKKPAAVAARMTPSEMQSSIWTTTTNGGKRKKRKGALTNGSSYSMTSSSLVRTEQMGILDQRFEKIEEAYNAEDDDMQSVSAISSVSSVTGPTRSDFDGLLDDFLGQYSTFNKKYVRKGWRTGTEQLDEIRKEMGPARIPAKYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.55
3 0.58
4 0.58
5 0.58
6 0.5
7 0.51
8 0.5
9 0.56
10 0.5
11 0.42
12 0.42
13 0.4
14 0.38
15 0.35
16 0.31
17 0.24
18 0.24
19 0.21
20 0.15
21 0.1
22 0.11
23 0.11
24 0.12
25 0.19
26 0.19
27 0.22
28 0.23
29 0.26
30 0.32
31 0.42
32 0.47
33 0.47
34 0.48
35 0.48
36 0.52
37 0.52
38 0.48
39 0.4
40 0.37
41 0.31
42 0.29
43 0.27
44 0.22
45 0.19
46 0.15
47 0.11
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.09
54 0.1
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.13
73 0.14
74 0.13
75 0.13
76 0.12
77 0.12
78 0.16
79 0.16
80 0.14
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.12
86 0.08
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.07
95 0.13
96 0.21
97 0.22
98 0.3
99 0.38
100 0.46
101 0.53
102 0.58
103 0.58
104 0.59
105 0.64
106 0.61
107 0.58
108 0.54
109 0.5
110 0.44
111 0.4
112 0.32
113 0.26
114 0.2
115 0.16
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.12
125 0.1
126 0.08
127 0.09
128 0.1
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.17
133 0.21
134 0.24
135 0.25
136 0.24
137 0.2
138 0.23
139 0.28
140 0.33
141 0.31
142 0.32
143 0.32
144 0.33
145 0.31
146 0.28
147 0.23
148 0.17
149 0.15
150 0.1
151 0.09
152 0.07
153 0.06
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.05
189 0.07
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.09
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.1
202 0.09
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.06
209 0.05
210 0.06
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.09
216 0.11
217 0.13
218 0.15
219 0.14
220 0.14
221 0.19
222 0.2
223 0.23
224 0.23
225 0.27
226 0.31
227 0.32
228 0.31
229 0.28
230 0.27
231 0.23
232 0.21
233 0.15
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.05
238 0.04
239 0.05
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.07
244 0.09
245 0.11
246 0.12
247 0.11
248 0.1
249 0.11
250 0.11
251 0.13
252 0.12
253 0.1
254 0.13
255 0.14
256 0.16
257 0.17
258 0.17
259 0.24
260 0.26
261 0.33
262 0.4
263 0.48
264 0.56
265 0.65
266 0.74
267 0.73
268 0.75
269 0.71
270 0.61
271 0.58
272 0.54
273 0.46
274 0.37
275 0.33
276 0.32
277 0.3
278 0.3
279 0.25
280 0.19
281 0.18
282 0.17
283 0.14
284 0.12
285 0.15
286 0.15
287 0.14
288 0.14
289 0.13
290 0.17
291 0.23
292 0.27
293 0.32
294 0.4
295 0.49
296 0.58
297 0.68
298 0.73
299 0.74
300 0.79
301 0.81
302 0.83
303 0.84
304 0.81
305 0.76
306 0.68
307 0.62
308 0.52
309 0.42
310 0.33
311 0.23
312 0.17
313 0.13
314 0.12
315 0.11
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.13
320 0.14
321 0.14
322 0.14
323 0.16
324 0.16
325 0.17
326 0.19
327 0.18
328 0.18
329 0.17
330 0.18
331 0.16
332 0.16
333 0.19
334 0.18
335 0.22
336 0.22
337 0.22
338 0.21
339 0.2
340 0.18
341 0.14
342 0.13
343 0.09
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.08
357 0.11
358 0.12
359 0.13
360 0.16
361 0.16
362 0.18
363 0.17
364 0.17
365 0.19
366 0.19
367 0.18
368 0.15
369 0.14
370 0.13
371 0.13
372 0.12
373 0.07
374 0.07
375 0.11
376 0.18
377 0.2
378 0.23
379 0.3
380 0.37
381 0.47
382 0.56
383 0.63
384 0.64
385 0.72
386 0.79
387 0.81
388 0.8
389 0.78
390 0.75
391 0.67
392 0.61
393 0.56
394 0.54
395 0.45
396 0.4
397 0.35
398 0.28
399 0.27
400 0.29
401 0.32
402 0.3
403 0.34
404 0.38