Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DFA9

Protein Details
Accession C5DFA9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-198AGPAPRAAKPRRKKQCPVCHNFYAHydrophilic
370-390EYPPGTKKKDRSSVPGRCKQCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
179-188PRAAKPRRKK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, cyto 5.5, mito 4, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
KEGG lth:KLTH0D13618g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13894  zf-C2H2_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MNVSQSVTLPPISSFDSLVRAAEHEHFVRAQHGQRQRESALGAPGVGLSVGSAAHTPSAPSVASVGNVGSLGPVLVGAWSSGSDTTAAAATHNYFIASGSGAYGRADSRGEGGAGTRVVPGTTATAGTRRDAGPSFAGTLTRHESGGRASVSAPEPRPGVAPVSPDTNGSSGTAAGPAPRAAKPRRKKQCPVCHNFYANLSTHKSSHMLPEHKPHKCPVCARGFTRNNDLLRHRKRHWKDEIIGAGPGIGAAGAGATASGARGEDDALDVSPGASSSVSSGSARLGAADGADAADRAAGESLSPQQQLRSLHRIKGTFHCPYKSALIALDMDAYPGKRRELAFETSECHQTGVFSRCDTFKNHLKALHFEYPPGTKKKDRSSVPGRCKQCGRHFANVGEWLSSHVGKDCGYVYH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.2
4 0.2
5 0.2
6 0.18
7 0.16
8 0.18
9 0.2
10 0.23
11 0.21
12 0.22
13 0.23
14 0.23
15 0.25
16 0.28
17 0.3
18 0.34
19 0.42
20 0.46
21 0.5
22 0.54
23 0.52
24 0.49
25 0.45
26 0.4
27 0.36
28 0.29
29 0.25
30 0.19
31 0.18
32 0.15
33 0.13
34 0.09
35 0.04
36 0.04
37 0.04
38 0.04
39 0.05
40 0.05
41 0.06
42 0.07
43 0.07
44 0.08
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.07
56 0.06
57 0.05
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.03
62 0.03
63 0.03
64 0.03
65 0.04
66 0.04
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.08
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.07
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.08
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.16
116 0.14
117 0.17
118 0.17
119 0.18
120 0.16
121 0.16
122 0.17
123 0.15
124 0.16
125 0.14
126 0.16
127 0.18
128 0.17
129 0.16
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.18
134 0.15
135 0.12
136 0.12
137 0.15
138 0.17
139 0.21
140 0.21
141 0.18
142 0.19
143 0.18
144 0.19
145 0.16
146 0.17
147 0.13
148 0.15
149 0.14
150 0.16
151 0.16
152 0.16
153 0.16
154 0.14
155 0.13
156 0.11
157 0.1
158 0.08
159 0.07
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.09
166 0.11
167 0.18
168 0.23
169 0.33
170 0.42
171 0.52
172 0.62
173 0.68
174 0.76
175 0.8
176 0.85
177 0.85
178 0.85
179 0.81
180 0.76
181 0.69
182 0.61
183 0.52
184 0.44
185 0.34
186 0.29
187 0.24
188 0.2
189 0.18
190 0.18
191 0.18
192 0.16
193 0.2
194 0.24
195 0.25
196 0.26
197 0.35
198 0.42
199 0.44
200 0.45
201 0.43
202 0.42
203 0.43
204 0.45
205 0.43
206 0.44
207 0.45
208 0.47
209 0.53
210 0.53
211 0.51
212 0.54
213 0.51
214 0.43
215 0.43
216 0.46
217 0.46
218 0.49
219 0.53
220 0.51
221 0.56
222 0.6
223 0.66
224 0.69
225 0.67
226 0.61
227 0.61
228 0.6
229 0.51
230 0.46
231 0.36
232 0.27
233 0.18
234 0.15
235 0.08
236 0.04
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.01
241 0.01
242 0.01
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.03
249 0.03
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.06
288 0.09
289 0.12
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.18
294 0.23
295 0.27
296 0.34
297 0.35
298 0.39
299 0.44
300 0.46
301 0.46
302 0.49
303 0.5
304 0.48
305 0.49
306 0.47
307 0.43
308 0.43
309 0.43
310 0.36
311 0.3
312 0.22
313 0.19
314 0.18
315 0.17
316 0.16
317 0.12
318 0.12
319 0.12
320 0.12
321 0.14
322 0.16
323 0.17
324 0.19
325 0.19
326 0.25
327 0.29
328 0.34
329 0.34
330 0.33
331 0.35
332 0.34
333 0.37
334 0.31
335 0.26
336 0.21
337 0.18
338 0.23
339 0.24
340 0.24
341 0.22
342 0.24
343 0.26
344 0.28
345 0.31
346 0.31
347 0.36
348 0.41
349 0.44
350 0.46
351 0.47
352 0.5
353 0.54
354 0.56
355 0.47
356 0.41
357 0.41
358 0.44
359 0.48
360 0.48
361 0.47
362 0.45
363 0.53
364 0.62
365 0.67
366 0.66
367 0.69
368 0.73
369 0.78
370 0.81
371 0.82
372 0.77
373 0.75
374 0.77
375 0.76
376 0.76
377 0.76
378 0.72
379 0.73
380 0.73
381 0.68
382 0.68
383 0.65
384 0.55
385 0.45
386 0.38
387 0.32
388 0.3
389 0.27
390 0.22
391 0.18
392 0.19
393 0.18
394 0.2