Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5Q355

Protein Details
Accession A0A5N5Q355    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-32SIPTSSDPRSKRPTKKRALSPTSLQHydrophilic
125-155REMRDEEKTRRNRERRERKKGKRGGNGKGGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
120-164RGRKEREMRDEEKTRRNRERRERKKGKRGGNGKGGEKGAEAGKVG
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MSANTPESIPTSSDPRSKRPTKKRALSPTSLQAATLSTLFSKPDQEIRLPPPLSSSSSTSGSLVAKRAVPEIVTNVQGSSAGAGSGEFHVYKASRRREYERLRVMDEEVQEEKDREEFERGRKEREMRDEEKTRRNRERRERKKGKRGGNGKGGEKGAEAGKVGKVLPRTVGEGRDEDMADGDGEGQERDGGQPAVVASGPGLVIHDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.42
3 0.5
4 0.58
5 0.66
6 0.72
7 0.78
8 0.81
9 0.87
10 0.89
11 0.91
12 0.89
13 0.84
14 0.8
15 0.77
16 0.71
17 0.61
18 0.5
19 0.4
20 0.32
21 0.27
22 0.21
23 0.13
24 0.09
25 0.1
26 0.11
27 0.11
28 0.13
29 0.13
30 0.19
31 0.21
32 0.23
33 0.28
34 0.31
35 0.39
36 0.37
37 0.35
38 0.33
39 0.32
40 0.32
41 0.3
42 0.29
43 0.23
44 0.25
45 0.26
46 0.23
47 0.22
48 0.21
49 0.19
50 0.18
51 0.16
52 0.15
53 0.15
54 0.16
55 0.14
56 0.13
57 0.12
58 0.14
59 0.14
60 0.14
61 0.14
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.11
66 0.07
67 0.05
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.05
73 0.06
74 0.05
75 0.05
76 0.07
77 0.07
78 0.12
79 0.19
80 0.26
81 0.31
82 0.35
83 0.41
84 0.49
85 0.56
86 0.61
87 0.61
88 0.56
89 0.53
90 0.5
91 0.45
92 0.38
93 0.31
94 0.25
95 0.17
96 0.16
97 0.15
98 0.14
99 0.13
100 0.11
101 0.12
102 0.1
103 0.15
104 0.16
105 0.22
106 0.33
107 0.34
108 0.37
109 0.4
110 0.44
111 0.44
112 0.5
113 0.52
114 0.45
115 0.52
116 0.56
117 0.58
118 0.63
119 0.65
120 0.65
121 0.68
122 0.73
123 0.75
124 0.78
125 0.83
126 0.85
127 0.88
128 0.91
129 0.91
130 0.94
131 0.92
132 0.91
133 0.89
134 0.87
135 0.83
136 0.82
137 0.76
138 0.68
139 0.64
140 0.54
141 0.45
142 0.36
143 0.3
144 0.21
145 0.16
146 0.14
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.14
153 0.14
154 0.17
155 0.17
156 0.21
157 0.23
158 0.25
159 0.25
160 0.25
161 0.25
162 0.24
163 0.23
164 0.18
165 0.16
166 0.14
167 0.11
168 0.1
169 0.09
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.07
176 0.08
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.07