Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5PTH1

Protein Details
Accession A0A5N5PTH1    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-180TSSAKKKIILKLKKPEKRKSTLHydrophilic
487-509IQEKLLEKKRGRKRKEAPSEVTVHydrophilic
536-560AETPAEPPPKKRRGRPKKSEAIVTEHydrophilic
571-601VPLPQETPKPTQKKRGRPRKCAATQPNETSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-177AKKKIILKLKKPEKRK
409-415ARRRGKE
494-501KKRGRKRK
543-553PPKKRRGRPKK
583-589KKRGRPR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Amino Acid Sequences MAPRGEILDSDEEDNDFSPAQSPGAQGDAAGADGLETPRNHRAESTDQSFFRDVYGDQHVTANAQQGSSSVAALSNDPVSTSSNPPPNLSHLNNQNEASHLSSITDPVPASRRKEKKAAMKDAVDLTQITTPGRPTPSVPADIWDFPASQDEAPTPAPTSSAKKKIILKLKKPEKRKSTLSSSITSPEHQVSSGMLPPLSVTPAEQPTSEPRQKKRRISSSGQSPVDSEEVDLLVIPRSEDKVASTSNFITPTNGGNSSSVVEDSTKVHATQILVVPPTTLTASQKEEFKFVSLESEMDNTREQAGVATPGVQLEDLQKSSGNAMIKYPTPSEFASSGRGVLSPGDYGTASSSRPRRRRNMTVAESPPSSPDIISAPVVTPRDNAAPAVRDMDVVDPYLPPSSPTPRSARRRGKEKSAPEEIPSLTPAPAVVDDEPPRTSGRIRIKARKPQVFDLTASSPPEAGNGDTTATPTGASEQVNKVTPQTIQEKLLEKKRGRKRKEAPSEVTVEEILPDTAPQQGGDEPAQVEEAVEIPAETPAEPPPKKRRGRPKKSEAIVTEDFTALPAVEEVPLPQETPKPTQKKRGRPRKCAATQPNETSVPVDDSAGTVELDEQGHDDHDDEQQVT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.17
3 0.13
4 0.11
5 0.12
6 0.12
7 0.13
8 0.13
9 0.14
10 0.14
11 0.16
12 0.15
13 0.12
14 0.13
15 0.12
16 0.1
17 0.09
18 0.07
19 0.05
20 0.07
21 0.09
22 0.12
23 0.12
24 0.17
25 0.25
26 0.27
27 0.27
28 0.27
29 0.32
30 0.36
31 0.44
32 0.45
33 0.45
34 0.44
35 0.48
36 0.48
37 0.42
38 0.34
39 0.27
40 0.22
41 0.19
42 0.26
43 0.23
44 0.22
45 0.24
46 0.23
47 0.23
48 0.24
49 0.26
50 0.19
51 0.18
52 0.17
53 0.15
54 0.18
55 0.17
56 0.15
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.11
61 0.13
62 0.11
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.14
67 0.16
68 0.21
69 0.26
70 0.32
71 0.34
72 0.35
73 0.36
74 0.39
75 0.43
76 0.42
77 0.43
78 0.45
79 0.5
80 0.51
81 0.5
82 0.45
83 0.39
84 0.37
85 0.32
86 0.24
87 0.18
88 0.16
89 0.15
90 0.16
91 0.14
92 0.14
93 0.12
94 0.13
95 0.2
96 0.24
97 0.3
98 0.38
99 0.46
100 0.5
101 0.59
102 0.64
103 0.68
104 0.74
105 0.77
106 0.74
107 0.68
108 0.66
109 0.6
110 0.53
111 0.43
112 0.33
113 0.24
114 0.19
115 0.18
116 0.15
117 0.13
118 0.13
119 0.16
120 0.19
121 0.18
122 0.18
123 0.25
124 0.28
125 0.31
126 0.29
127 0.28
128 0.3
129 0.29
130 0.3
131 0.24
132 0.2
133 0.16
134 0.19
135 0.18
136 0.14
137 0.14
138 0.12
139 0.13
140 0.14
141 0.15
142 0.13
143 0.11
144 0.13
145 0.14
146 0.21
147 0.27
148 0.34
149 0.36
150 0.41
151 0.48
152 0.54
153 0.63
154 0.66
155 0.67
156 0.7
157 0.77
158 0.79
159 0.82
160 0.84
161 0.82
162 0.8
163 0.79
164 0.75
165 0.73
166 0.75
167 0.69
168 0.62
169 0.54
170 0.52
171 0.45
172 0.39
173 0.32
174 0.24
175 0.21
176 0.18
177 0.17
178 0.13
179 0.13
180 0.15
181 0.13
182 0.11
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.09
188 0.07
189 0.1
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.15
194 0.21
195 0.3
196 0.35
197 0.38
198 0.44
199 0.54
200 0.63
201 0.7
202 0.74
203 0.75
204 0.77
205 0.77
206 0.77
207 0.77
208 0.77
209 0.69
210 0.59
211 0.5
212 0.44
213 0.37
214 0.29
215 0.18
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.1
230 0.12
231 0.12
232 0.14
233 0.13
234 0.15
235 0.16
236 0.15
237 0.14
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.11
247 0.1
248 0.08
249 0.07
250 0.08
251 0.09
252 0.11
253 0.11
254 0.1
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.14
259 0.14
260 0.13
261 0.13
262 0.12
263 0.12
264 0.11
265 0.11
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.1
270 0.14
271 0.15
272 0.2
273 0.2
274 0.21
275 0.2
276 0.2
277 0.17
278 0.13
279 0.14
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.11
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.08
303 0.07
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.11
309 0.1
310 0.09
311 0.1
312 0.11
313 0.12
314 0.13
315 0.14
316 0.12
317 0.14
318 0.14
319 0.15
320 0.15
321 0.15
322 0.16
323 0.16
324 0.15
325 0.12
326 0.12
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.12
339 0.2
340 0.28
341 0.37
342 0.44
343 0.51
344 0.59
345 0.68
346 0.72
347 0.74
348 0.71
349 0.72
350 0.67
351 0.62
352 0.54
353 0.45
354 0.37
355 0.28
356 0.22
357 0.13
358 0.11
359 0.09
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.08
364 0.11
365 0.12
366 0.12
367 0.11
368 0.11
369 0.13
370 0.13
371 0.13
372 0.11
373 0.12
374 0.13
375 0.14
376 0.13
377 0.11
378 0.11
379 0.12
380 0.11
381 0.1
382 0.1
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.11
389 0.16
390 0.19
391 0.24
392 0.3
393 0.39
394 0.47
395 0.57
396 0.64
397 0.66
398 0.73
399 0.73
400 0.77
401 0.76
402 0.76
403 0.73
404 0.7
405 0.64
406 0.56
407 0.54
408 0.45
409 0.37
410 0.3
411 0.23
412 0.16
413 0.14
414 0.12
415 0.09
416 0.09
417 0.1
418 0.09
419 0.13
420 0.15
421 0.17
422 0.18
423 0.18
424 0.18
425 0.18
426 0.18
427 0.22
428 0.3
429 0.38
430 0.45
431 0.54
432 0.62
433 0.71
434 0.8
435 0.79
436 0.74
437 0.71
438 0.71
439 0.63
440 0.55
441 0.5
442 0.44
443 0.38
444 0.35
445 0.27
446 0.21
447 0.18
448 0.17
449 0.14
450 0.11
451 0.1
452 0.09
453 0.1
454 0.1
455 0.11
456 0.1
457 0.1
458 0.09
459 0.07
460 0.09
461 0.11
462 0.12
463 0.14
464 0.16
465 0.19
466 0.22
467 0.22
468 0.21
469 0.2
470 0.2
471 0.21
472 0.24
473 0.24
474 0.24
475 0.29
476 0.34
477 0.39
478 0.46
479 0.5
480 0.5
481 0.58
482 0.66
483 0.72
484 0.72
485 0.77
486 0.78
487 0.81
488 0.87
489 0.86
490 0.82
491 0.77
492 0.75
493 0.64
494 0.56
495 0.45
496 0.33
497 0.24
498 0.19
499 0.13
500 0.08
501 0.08
502 0.07
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.1
508 0.13
509 0.14
510 0.15
511 0.13
512 0.13
513 0.14
514 0.12
515 0.11
516 0.08
517 0.08
518 0.07
519 0.06
520 0.06
521 0.05
522 0.06
523 0.07
524 0.07
525 0.08
526 0.13
527 0.23
528 0.25
529 0.33
530 0.42
531 0.52
532 0.6
533 0.69
534 0.75
535 0.77
536 0.87
537 0.89
538 0.9
539 0.9
540 0.88
541 0.87
542 0.78
543 0.75
544 0.67
545 0.58
546 0.49
547 0.39
548 0.32
549 0.24
550 0.21
551 0.13
552 0.1
553 0.08
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.1
559 0.11
560 0.11
561 0.13
562 0.17
563 0.21
564 0.29
565 0.39
566 0.46
567 0.52
568 0.63
569 0.71
570 0.77
571 0.84
572 0.88
573 0.89
574 0.89
575 0.93
576 0.93
577 0.91
578 0.9
579 0.9
580 0.88
581 0.86
582 0.82
583 0.77
584 0.68
585 0.6
586 0.51
587 0.43
588 0.36
589 0.28
590 0.23
591 0.16
592 0.15
593 0.16
594 0.15
595 0.13
596 0.09
597 0.09
598 0.11
599 0.11
600 0.1
601 0.1
602 0.1
603 0.11
604 0.12
605 0.12
606 0.11
607 0.15