Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5NYU8

Protein Details
Accession A0A5N5NYU8    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MSSSTSKHKRKRKNSAHLPPETINHydrophilic
110-131AETRLRGVKRERRERERNIGVLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-13KHKRKRK
105-125KKRRAAETRLRGVKRERRERE
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007224  TIF_Rrn11  
Gene Ontology GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04090  RNA_pol_I_TF  
Amino Acid Sequences MSSSTSKHKRKRKNSAHLPPETINPHSHLPNLLKQFRAAGLPESERLPSVPDFPHRPLPRNYTIANPNYDSSAHSSEVDDDDDETGPDATTDADSTDGELDPEAKKRRAAETRLRGVKRERRERERNIGVLVGILRRCVEEGDMPRARRAFGLLIRAKVDGRAVDLRAEGFWGLGAEILMRSGDGQGGHGGEEGRQDGETAKEKKRRWGSVQNMVLVRRFFEDLIQLYPYNRLHPDSVSALDFYPVLFSCEMYNVHVELEMALEKLDQDREEEEEDNSEMQADDDEARERRTKAARDELRIAALEVMRGVASRMDELMMVVPYSKSLEMLRLRGMIALFMGDLEVPAPPRGAYEEDEGHTKRETERERAVGLFKKVLAAGGELEPWIRRLVAEHDGEDDEESEDEEMAFILPKFSSLPIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.94
2 0.95
3 0.95
4 0.9
5 0.86
6 0.76
7 0.72
8 0.65
9 0.57
10 0.49
11 0.42
12 0.4
13 0.35
14 0.35
15 0.34
16 0.34
17 0.39
18 0.46
19 0.46
20 0.43
21 0.42
22 0.42
23 0.38
24 0.36
25 0.3
26 0.24
27 0.25
28 0.27
29 0.28
30 0.27
31 0.26
32 0.23
33 0.22
34 0.21
35 0.18
36 0.2
37 0.22
38 0.27
39 0.32
40 0.36
41 0.46
42 0.47
43 0.52
44 0.55
45 0.59
46 0.59
47 0.58
48 0.55
49 0.52
50 0.56
51 0.55
52 0.52
53 0.46
54 0.4
55 0.36
56 0.36
57 0.3
58 0.27
59 0.26
60 0.22
61 0.21
62 0.21
63 0.21
64 0.22
65 0.21
66 0.16
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.12
71 0.11
72 0.1
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.1
88 0.11
89 0.18
90 0.23
91 0.23
92 0.26
93 0.29
94 0.37
95 0.44
96 0.5
97 0.54
98 0.58
99 0.66
100 0.72
101 0.71
102 0.67
103 0.68
104 0.68
105 0.68
106 0.69
107 0.69
108 0.7
109 0.79
110 0.82
111 0.83
112 0.81
113 0.72
114 0.63
115 0.54
116 0.43
117 0.35
118 0.28
119 0.21
120 0.14
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.12
128 0.16
129 0.24
130 0.29
131 0.29
132 0.32
133 0.32
134 0.31
135 0.25
136 0.24
137 0.2
138 0.17
139 0.26
140 0.26
141 0.27
142 0.28
143 0.28
144 0.26
145 0.23
146 0.22
147 0.12
148 0.13
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.14
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.09
157 0.06
158 0.05
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.05
171 0.04
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.09
186 0.15
187 0.19
188 0.26
189 0.33
190 0.34
191 0.42
192 0.49
193 0.52
194 0.53
195 0.58
196 0.58
197 0.61
198 0.62
199 0.58
200 0.52
201 0.47
202 0.42
203 0.32
204 0.25
205 0.17
206 0.15
207 0.11
208 0.1
209 0.11
210 0.1
211 0.12
212 0.13
213 0.11
214 0.11
215 0.15
216 0.15
217 0.15
218 0.15
219 0.16
220 0.15
221 0.15
222 0.17
223 0.15
224 0.16
225 0.14
226 0.14
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.08
231 0.08
232 0.06
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.09
257 0.11
258 0.14
259 0.14
260 0.13
261 0.14
262 0.14
263 0.13
264 0.12
265 0.1
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.1
273 0.11
274 0.14
275 0.17
276 0.18
277 0.23
278 0.29
279 0.33
280 0.37
281 0.47
282 0.5
283 0.52
284 0.56
285 0.51
286 0.46
287 0.41
288 0.35
289 0.27
290 0.21
291 0.16
292 0.1
293 0.09
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.09
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.09
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.16
315 0.19
316 0.21
317 0.23
318 0.22
319 0.23
320 0.23
321 0.22
322 0.15
323 0.12
324 0.1
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.06
333 0.07
334 0.08
335 0.07
336 0.08
337 0.11
338 0.14
339 0.15
340 0.19
341 0.22
342 0.23
343 0.29
344 0.29
345 0.29
346 0.27
347 0.26
348 0.24
349 0.3
350 0.34
351 0.35
352 0.41
353 0.43
354 0.44
355 0.45
356 0.49
357 0.46
358 0.44
359 0.4
360 0.33
361 0.31
362 0.29
363 0.28
364 0.22
365 0.17
366 0.16
367 0.14
368 0.14
369 0.12
370 0.14
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.1
375 0.09
376 0.12
377 0.17
378 0.23
379 0.25
380 0.25
381 0.27
382 0.28
383 0.29
384 0.27
385 0.22
386 0.16
387 0.13
388 0.13
389 0.1
390 0.1
391 0.09
392 0.08
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.1
400 0.11