Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DHD2

Protein Details
Accession C5DHD2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-47FAEVKDQKNKERHKMRKQRAKEERENPELKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-50QKNKERHKMRKQRAKEERENPELKEKR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG lth:KLTH0E03410g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MAPDELRIRNKMKRQELFAEVKDQKNKERHKMRKQRAKEERENPELKEKRLKENVTNTIDSLRVYDETIHQEVEGDEADFAQFFNNGTEPPKILLTTNVNAKKKAYEFANVLIEILPNVTFVKRKFGYKLKEIVEFCSNRNYTDLVIINEDKKKVTGLTFIHLPEGPSFYFKISSYVDVQKIVGHGRATSHIPELILNNFQTRLGNTVGRLFQSIFPKNPDFEGRQVITLHNQRDYIFFRRHRYVFRNEEKVGLQELGPQFTMKLLRLQHGIKEETEWEHTADMDKEKKKFYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.69
3 0.71
4 0.7
5 0.64
6 0.64
7 0.59
8 0.59
9 0.6
10 0.57
11 0.57
12 0.6
13 0.66
14 0.67
15 0.72
16 0.76
17 0.8
18 0.87
19 0.9
20 0.92
21 0.92
22 0.93
23 0.92
24 0.92
25 0.91
26 0.89
27 0.87
28 0.86
29 0.8
30 0.71
31 0.72
32 0.66
33 0.6
34 0.61
35 0.55
36 0.55
37 0.61
38 0.62
39 0.6
40 0.64
41 0.69
42 0.65
43 0.62
44 0.53
45 0.46
46 0.42
47 0.34
48 0.25
49 0.18
50 0.13
51 0.12
52 0.13
53 0.14
54 0.19
55 0.2
56 0.19
57 0.17
58 0.17
59 0.16
60 0.16
61 0.13
62 0.08
63 0.07
64 0.06
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.1
75 0.11
76 0.12
77 0.12
78 0.13
79 0.12
80 0.12
81 0.16
82 0.18
83 0.2
84 0.28
85 0.34
86 0.35
87 0.35
88 0.36
89 0.36
90 0.32
91 0.34
92 0.27
93 0.24
94 0.24
95 0.26
96 0.28
97 0.24
98 0.23
99 0.18
100 0.16
101 0.12
102 0.1
103 0.07
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.08
108 0.09
109 0.17
110 0.18
111 0.2
112 0.25
113 0.32
114 0.37
115 0.39
116 0.46
117 0.4
118 0.45
119 0.44
120 0.41
121 0.4
122 0.36
123 0.32
124 0.32
125 0.3
126 0.24
127 0.25
128 0.22
129 0.16
130 0.18
131 0.19
132 0.12
133 0.14
134 0.14
135 0.16
136 0.17
137 0.17
138 0.14
139 0.13
140 0.12
141 0.11
142 0.11
143 0.14
144 0.13
145 0.15
146 0.18
147 0.17
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.13
152 0.14
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.11
158 0.11
159 0.13
160 0.12
161 0.14
162 0.17
163 0.2
164 0.21
165 0.2
166 0.2
167 0.17
168 0.17
169 0.16
170 0.15
171 0.11
172 0.1
173 0.11
174 0.13
175 0.14
176 0.14
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.14
182 0.13
183 0.14
184 0.13
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.13
189 0.11
190 0.12
191 0.13
192 0.14
193 0.13
194 0.17
195 0.18
196 0.18
197 0.19
198 0.17
199 0.19
200 0.26
201 0.29
202 0.27
203 0.32
204 0.33
205 0.33
206 0.34
207 0.34
208 0.3
209 0.29
210 0.34
211 0.29
212 0.29
213 0.3
214 0.28
215 0.31
216 0.34
217 0.33
218 0.29
219 0.29
220 0.27
221 0.31
222 0.34
223 0.33
224 0.36
225 0.39
226 0.44
227 0.51
228 0.54
229 0.58
230 0.59
231 0.62
232 0.64
233 0.67
234 0.68
235 0.61
236 0.61
237 0.55
238 0.5
239 0.43
240 0.34
241 0.25
242 0.23
243 0.24
244 0.22
245 0.21
246 0.19
247 0.17
248 0.18
249 0.21
250 0.15
251 0.2
252 0.2
253 0.23
254 0.29
255 0.3
256 0.33
257 0.36
258 0.38
259 0.32
260 0.33
261 0.32
262 0.3
263 0.33
264 0.29
265 0.24
266 0.22
267 0.22
268 0.23
269 0.23
270 0.27
271 0.31
272 0.36
273 0.39