FuNGI

C5DDW2

Protein Details

Accession

C5DDW2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-43	DETSTEKKPRAEPKKYREYTTV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008669 LSM_interact IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR034397 Prp24_RRM1 IPR034540 Prp24_RRM3 IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR031766 RRM_occluded
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	lth:KLTH0C04268g -
Pfam	View protein in Pfam PF05391 Lsm_interact PF00076 RRM_1 PF16842 RRM_occluded
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12296 RRM1_Prp24 cd12298 RRM3_Prp24 cd12299 RRM4_Prp24

Amino Acid Sequences

MSADELTEPQLKRRLSDASNTDETSTEKKPRAEPKKYREYTTVIVRNLPQSYNFHKVRKLFNSCGKVGHVDVHTSTDGQCKVARIEFENYSDVLSALTKSGKVLGGNEIEVEELSKSTLWATNFPPTYDQGKLMQLFGQFGGTVLSVRLPSLRFDSRRRFAYIDMASKQEASLALEKLDGVEIENYKMIVKLSQPSNAAARTDKAVIERRQVLVRNLNYNTNEAALSAIFAKFGHVEQINLPRTRENKHGEIDTKGETKERLNEGFAFITFSDASCARSSLSLNGTEIDNRILDVTLADRRPYLERQKVKHIMASKNQDGSVLGIYPLSDKIPTPQIRCFIVEQAKVKKEDIKKIYLVPDHEGALVVARSGPIAAKISLSIHGSLFNKRTIMCCSPKELQRQVHARYGRSSTKQRTHEDSKDIEITRSAPPLEGEKKMNNEDFRKLFLGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.36
3	0.45
4	0.44
5	0.45
6	0.49
7	0.48
8	0.45
9	0.39
10	0.39
11	0.35
12	0.36
13	0.36
14	0.37
15	0.41
16	0.48
17	0.58
18	0.65
19	0.71
20	0.75
21	0.78
22	0.84
23	0.83
24	0.8
25	0.75
26	0.7
27	0.65
28	0.65
29	0.63
30	0.53
31	0.52
32	0.49
33	0.49
34	0.46
35	0.41
36	0.34
37	0.32
38	0.37
39	0.43
40	0.46
41	0.45
42	0.49
43	0.53
44	0.59
45	0.62
46	0.64
47	0.63
48	0.66
49	0.69
50	0.64
51	0.61
52	0.54
53	0.47
54	0.4
55	0.37
56	0.29
57	0.25
58	0.24
59	0.25
60	0.23
61	0.21
62	0.21
63	0.21
64	0.21
65	0.2
66	0.21
67	0.19
68	0.22
69	0.24
70	0.25
71	0.23
72	0.28
73	0.28
74	0.29
75	0.29
76	0.26
77	0.24
78	0.21
79	0.17
80	0.13
81	0.11
82	0.09
83	0.08
84	0.09
85	0.09
86	0.09
87	0.11
88	0.12
89	0.12
90	0.13
91	0.16
92	0.17
93	0.17
94	0.17
95	0.15
96	0.13
97	0.12
98	0.11
99	0.07
100	0.05
101	0.06
102	0.06
103	0.06
104	0.07
105	0.1
106	0.11
107	0.14
108	0.17
109	0.24
110	0.25
111	0.25
112	0.26
113	0.26
114	0.28
115	0.26
116	0.26
117	0.21
118	0.25
119	0.25
120	0.23
121	0.23
122	0.19
123	0.19
124	0.17
125	0.15
126	0.1
127	0.09
128	0.09
129	0.07
130	0.06
131	0.05
132	0.06
133	0.06
134	0.06
135	0.08
136	0.08
137	0.1
138	0.15
139	0.21
140	0.25
141	0.33
142	0.42
143	0.45
144	0.48
145	0.5
146	0.46
147	0.41
148	0.45
149	0.42
150	0.39
151	0.35
152	0.33
153	0.29
154	0.28
155	0.26
156	0.19
157	0.14
158	0.11
159	0.13
160	0.11
161	0.11
162	0.11
163	0.11
164	0.1
165	0.1
166	0.07
167	0.05
168	0.07
169	0.07
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.09
175	0.08
176	0.07
177	0.08
178	0.13
179	0.15
180	0.18
181	0.19
182	0.19
183	0.22
184	0.21
185	0.21
186	0.16
187	0.15
188	0.14
189	0.14
190	0.13
191	0.15
192	0.21
193	0.22
194	0.26
195	0.27
196	0.27
197	0.29
198	0.31
199	0.3
200	0.3
201	0.3
202	0.31
203	0.3
204	0.32
205	0.3
206	0.29
207	0.26
208	0.2
209	0.17
210	0.12
211	0.11
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.08
222	0.08
223	0.09
224	0.11
225	0.19
226	0.23
227	0.24
228	0.25
229	0.25
230	0.27
231	0.3
232	0.35
233	0.32
234	0.31
235	0.33
236	0.36
237	0.34
238	0.34
239	0.33
240	0.28
241	0.25
242	0.21
243	0.2
244	0.18
245	0.17
246	0.21
247	0.22
248	0.21
249	0.21
250	0.21
251	0.22
252	0.21
253	0.19
254	0.15
255	0.11
256	0.12
257	0.1
258	0.09
259	0.09
260	0.09
261	0.11
262	0.1
263	0.1
264	0.09
265	0.1
266	0.11
267	0.12
268	0.14
269	0.13
270	0.13
271	0.14
272	0.14
273	0.13
274	0.13
275	0.11
276	0.09
277	0.08
278	0.08
279	0.07
280	0.07
281	0.06
282	0.08
283	0.12
284	0.13
285	0.13
286	0.13
287	0.15
288	0.18
289	0.24
290	0.31
291	0.36
292	0.43
293	0.46
294	0.56
295	0.62
296	0.59
297	0.58
298	0.56
299	0.53
300	0.54
301	0.58
302	0.52
303	0.47
304	0.46
305	0.42
306	0.35
307	0.29
308	0.22
309	0.14
310	0.11
311	0.08
312	0.08
313	0.09
314	0.09
315	0.08
316	0.08
317	0.07
318	0.1
319	0.2
320	0.25
321	0.27
322	0.31
323	0.34
324	0.36
325	0.38
326	0.37
327	0.35
328	0.37
329	0.38
330	0.4
331	0.44
332	0.47
333	0.47
334	0.46
335	0.47
336	0.47
337	0.52
338	0.51
339	0.49
340	0.47
341	0.49
342	0.55
343	0.51
344	0.47
345	0.4
346	0.37
347	0.32
348	0.29
349	0.25
350	0.18
351	0.16
352	0.13
353	0.09
354	0.08
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.1
361	0.1
362	0.1
363	0.11
364	0.12
365	0.15
366	0.16
367	0.15
368	0.13
369	0.18
370	0.2
371	0.24
372	0.26
373	0.25
374	0.25
375	0.25
376	0.27
377	0.29
378	0.35
379	0.37
380	0.37
381	0.42
382	0.47
383	0.53
384	0.59
385	0.61
386	0.6
387	0.62
388	0.68
389	0.66
390	0.67
391	0.65
392	0.59
393	0.56
394	0.56
395	0.55
396	0.55
397	0.6
398	0.61
399	0.66
400	0.71
401	0.72
402	0.74
403	0.75
404	0.75
405	0.72
406	0.65
407	0.62
408	0.61
409	0.56
410	0.48
411	0.41
412	0.36
413	0.33
414	0.33
415	0.28
416	0.21
417	0.22
418	0.29
419	0.32
420	0.34
421	0.36
422	0.38
423	0.44
424	0.5
425	0.55
426	0.55
427	0.55
428	0.59
429	0.56
430	0.55

C5DDW2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer