Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DNC7

Protein Details
Accession C5DNC7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-34TQKVHKPSKGKVSKTTKRKDVIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-32KPSKGKVSKTTKRKD
40-49NNKKGPKGKK
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito_nucl 10.5, mito 9.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR037431  REX4_DEDDh_dom  
IPR047021  REXO1/3/4-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0008408  F:3'-5' exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG lth:KLTH0G15906g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
CDD cd06144  REX4_like  
Amino Acid Sequences MVLSSNWLKLQETQKVHKPSKGKVSKTTKRKDVISNSTANNKKGPKGKKNIMGMVHSMNHEIEKIKERKLQVNQTEKSKPLAAELEETLEADAAARSINRASEIGKYVAIDCEFVGVGPEGKDSALARATVVNYFGHVVLDVFVKPQEKVTDWRTWVSGVRPQDMKEAVPFSVAQAKVAKTLENRILVGHSVAHDLQSLFLSHPRSAIRDTSRHLPFRKQYAGGKTPSLKKLAKEILGIDIQGAEHSPIEDARATMLIYKSDRKEFERLHQIKFGTKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.63
3 0.66
4 0.65
5 0.64
6 0.62
7 0.67
8 0.69
9 0.66
10 0.67
11 0.74
12 0.78
13 0.82
14 0.84
15 0.82
16 0.78
17 0.78
18 0.77
19 0.76
20 0.76
21 0.71
22 0.67
23 0.61
24 0.65
25 0.64
26 0.56
27 0.53
28 0.47
29 0.48
30 0.5
31 0.58
32 0.58
33 0.63
34 0.7
35 0.72
36 0.75
37 0.75
38 0.7
39 0.63
40 0.56
41 0.49
42 0.43
43 0.35
44 0.29
45 0.23
46 0.2
47 0.18
48 0.16
49 0.15
50 0.22
51 0.25
52 0.29
53 0.33
54 0.37
55 0.44
56 0.51
57 0.58
58 0.57
59 0.64
60 0.63
61 0.65
62 0.65
63 0.58
64 0.53
65 0.46
66 0.37
67 0.3
68 0.29
69 0.23
70 0.21
71 0.2
72 0.19
73 0.16
74 0.16
75 0.13
76 0.1
77 0.09
78 0.06
79 0.06
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.08
89 0.11
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.13
97 0.11
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.05
104 0.06
105 0.05
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.09
119 0.08
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.15
137 0.19
138 0.23
139 0.24
140 0.25
141 0.24
142 0.24
143 0.24
144 0.22
145 0.22
146 0.19
147 0.21
148 0.21
149 0.21
150 0.24
151 0.23
152 0.22
153 0.19
154 0.19
155 0.15
156 0.15
157 0.14
158 0.11
159 0.16
160 0.16
161 0.15
162 0.16
163 0.16
164 0.19
165 0.19
166 0.2
167 0.15
168 0.2
169 0.23
170 0.23
171 0.22
172 0.2
173 0.2
174 0.18
175 0.17
176 0.13
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.1
184 0.09
185 0.1
186 0.08
187 0.12
188 0.14
189 0.13
190 0.16
191 0.17
192 0.18
193 0.2
194 0.26
195 0.28
196 0.3
197 0.33
198 0.4
199 0.45
200 0.5
201 0.5
202 0.53
203 0.53
204 0.56
205 0.58
206 0.54
207 0.54
208 0.56
209 0.59
210 0.53
211 0.53
212 0.52
213 0.54
214 0.53
215 0.53
216 0.47
217 0.43
218 0.49
219 0.5
220 0.46
221 0.4
222 0.38
223 0.35
224 0.33
225 0.32
226 0.22
227 0.16
228 0.14
229 0.12
230 0.11
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.07
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.14
243 0.15
244 0.17
245 0.2
246 0.28
247 0.31
248 0.37
249 0.41
250 0.42
251 0.5
252 0.5
253 0.56
254 0.6
255 0.6
256 0.58
257 0.6
258 0.57