Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DMJ4

Protein Details
Accession C5DMJ4    Localization Confidence Low Confidence Score 6.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
179-202KTVYSQEKYLKRKKQKFAKFFTVEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 10.666, cyto_mito 10.166, mito_nucl 8.166, nucl 8, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
KEGG lth:KLTH0G09438g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MDPLKHITYYNHVLVRLPSNNLKVCELKPNSDVSLGKFGAFKVNDIIGYPFGTTFEIHYDNAIEASAPDAGPSGDAAQEGTSSKGARNKFKIPVGRLSVIESRLTANAAATGLGSEEEGTPQRELQLVGNSDSNKNLINIGSSIQKLSSEEIEQLKQQSVSSNEIISKMIEAHGSFHQKTVYSQEKYLKRKKQKFAKFFTVEYMSSSGLLQYLIDKGDVLRAMDLSEESMGMILNLANIRSNGTYLCVDETGGLLVYALLERMFGGENDSAAQGKIVVVHENEHPNLDLLKFSNYTEEFIQQHVKTVSILDYFEPPVTEEVKEAFTPLTDEQLKSLKSNKKGAYYRRLKWYNTQLEIIEWATKQQYDGLVVASTLHLPTFVPKLGERVHGSRPIVCYSQFKETVLELSHTLYNDLRYLAPTIVETRCRPFQTIRGRLHPVMTMRGGGGYMMWCHKVIPVGAADAALQPRPEEAPQGAEAESKKQKTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.43
3 0.39
4 0.38
5 0.37
6 0.41
7 0.46
8 0.46
9 0.47
10 0.44
11 0.43
12 0.48
13 0.46
14 0.44
15 0.41
16 0.43
17 0.4
18 0.41
19 0.4
20 0.34
21 0.38
22 0.34
23 0.32
24 0.29
25 0.28
26 0.31
27 0.3
28 0.27
29 0.22
30 0.23
31 0.22
32 0.22
33 0.23
34 0.16
35 0.17
36 0.16
37 0.12
38 0.12
39 0.13
40 0.12
41 0.11
42 0.14
43 0.16
44 0.16
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.15
49 0.14
50 0.09
51 0.07
52 0.08
53 0.09
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.09
67 0.1
68 0.11
69 0.11
70 0.15
71 0.2
72 0.26
73 0.34
74 0.39
75 0.45
76 0.49
77 0.56
78 0.61
79 0.6
80 0.63
81 0.6
82 0.57
83 0.5
84 0.48
85 0.45
86 0.38
87 0.34
88 0.26
89 0.21
90 0.19
91 0.19
92 0.15
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.08
97 0.07
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.07
105 0.09
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.12
110 0.13
111 0.14
112 0.14
113 0.19
114 0.18
115 0.19
116 0.23
117 0.23
118 0.23
119 0.23
120 0.21
121 0.16
122 0.15
123 0.14
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.11
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.13
136 0.11
137 0.15
138 0.17
139 0.18
140 0.19
141 0.2
142 0.19
143 0.18
144 0.17
145 0.17
146 0.17
147 0.2
148 0.2
149 0.2
150 0.19
151 0.19
152 0.19
153 0.16
154 0.13
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.1
160 0.14
161 0.2
162 0.19
163 0.2
164 0.2
165 0.2
166 0.2
167 0.25
168 0.29
169 0.25
170 0.29
171 0.36
172 0.43
173 0.52
174 0.6
175 0.63
176 0.65
177 0.73
178 0.79
179 0.82
180 0.84
181 0.85
182 0.83
183 0.84
184 0.76
185 0.67
186 0.62
187 0.55
188 0.44
189 0.36
190 0.3
191 0.19
192 0.16
193 0.15
194 0.11
195 0.08
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.07
205 0.08
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.02
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.04
251 0.04
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.05
261 0.04
262 0.06
263 0.06
264 0.08
265 0.08
266 0.1
267 0.13
268 0.15
269 0.16
270 0.14
271 0.14
272 0.13
273 0.13
274 0.12
275 0.1
276 0.08
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.14
281 0.14
282 0.16
283 0.16
284 0.18
285 0.16
286 0.17
287 0.23
288 0.19
289 0.22
290 0.2
291 0.2
292 0.16
293 0.16
294 0.16
295 0.12
296 0.12
297 0.1
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.1
303 0.11
304 0.12
305 0.11
306 0.1
307 0.11
308 0.12
309 0.12
310 0.12
311 0.1
312 0.09
313 0.11
314 0.11
315 0.15
316 0.15
317 0.15
318 0.16
319 0.21
320 0.22
321 0.21
322 0.29
323 0.31
324 0.35
325 0.43
326 0.45
327 0.5
328 0.56
329 0.63
330 0.65
331 0.67
332 0.68
333 0.7
334 0.72
335 0.65
336 0.66
337 0.68
338 0.66
339 0.6
340 0.56
341 0.46
342 0.41
343 0.4
344 0.33
345 0.25
346 0.16
347 0.15
348 0.13
349 0.13
350 0.13
351 0.13
352 0.13
353 0.12
354 0.13
355 0.12
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.09
360 0.09
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.08
366 0.11
367 0.11
368 0.13
369 0.13
370 0.18
371 0.21
372 0.26
373 0.28
374 0.3
375 0.34
376 0.38
377 0.39
378 0.38
379 0.38
380 0.36
381 0.34
382 0.32
383 0.33
384 0.3
385 0.36
386 0.34
387 0.32
388 0.31
389 0.29
390 0.31
391 0.26
392 0.25
393 0.17
394 0.18
395 0.2
396 0.18
397 0.19
398 0.16
399 0.16
400 0.16
401 0.16
402 0.14
403 0.14
404 0.16
405 0.14
406 0.14
407 0.14
408 0.17
409 0.19
410 0.24
411 0.25
412 0.29
413 0.35
414 0.37
415 0.4
416 0.39
417 0.44
418 0.5
419 0.57
420 0.59
421 0.6
422 0.64
423 0.62
424 0.6
425 0.56
426 0.48
427 0.44
428 0.38
429 0.31
430 0.24
431 0.23
432 0.21
433 0.16
434 0.14
435 0.1
436 0.11
437 0.13
438 0.15
439 0.14
440 0.15
441 0.16
442 0.19
443 0.18
444 0.18
445 0.16
446 0.17
447 0.17
448 0.16
449 0.16
450 0.16
451 0.17
452 0.16
453 0.15
454 0.13
455 0.15
456 0.17
457 0.18
458 0.19
459 0.18
460 0.21
461 0.22
462 0.24
463 0.23
464 0.24
465 0.25
466 0.29
467 0.36