Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5N7D7

Protein Details
Accession A0A5N5N7D7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
157-186DNPGGSSRTHRRRYQRKKRKANKRTQMLAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
158-180NPGGSSRTHRRRYQRKKRKANKR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 5, cyto 3.5, cyto_pero 2.5, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR013970  Rfa2  
Gene Ontology GO:0031981  C:nuclear lumen  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF08661  Rep_fac-A_3  
CDD cd04479  RPA3  
Amino Acid Sequences MEATATPRVTSQYLDNYVGRNVMVVGKVVQLRGDTAVVDADGNVTAHLNRMGSGAQLIGKVNSDLSIKVLSSTTVESPAGVDRTTHRNLIEISASSDYDLYRTVVELSQLPSVKNLFVKDDSGELSVNDSTDRRTGDLDLDISSSDSDHPPGEAKRDNPGGSSRTHRRRYQRKKRKANKRTQMLAVPEQQRSPGLAADTFSNKDWARQERGKEKGSDIGRDAELMMAIWNLAGLHLGTSINVQMCMDEAGRWRVGWGQLVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.34
3 0.32
4 0.32
5 0.31
6 0.26
7 0.18
8 0.15
9 0.14
10 0.13
11 0.12
12 0.11
13 0.15
14 0.16
15 0.16
16 0.16
17 0.14
18 0.15
19 0.16
20 0.15
21 0.11
22 0.1
23 0.1
24 0.09
25 0.09
26 0.07
27 0.06
28 0.07
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.08
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.1
50 0.1
51 0.09
52 0.1
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.11
57 0.09
58 0.1
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.1
64 0.11
65 0.13
66 0.13
67 0.11
68 0.11
69 0.12
70 0.18
71 0.2
72 0.21
73 0.19
74 0.2
75 0.21
76 0.22
77 0.21
78 0.15
79 0.15
80 0.14
81 0.14
82 0.12
83 0.12
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.09
94 0.1
95 0.13
96 0.14
97 0.13
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.15
102 0.14
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.12
110 0.11
111 0.09
112 0.1
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.11
125 0.11
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.09
138 0.1
139 0.14
140 0.16
141 0.17
142 0.21
143 0.25
144 0.25
145 0.24
146 0.27
147 0.24
148 0.24
149 0.3
150 0.34
151 0.4
152 0.47
153 0.52
154 0.59
155 0.69
156 0.78
157 0.82
158 0.84
159 0.86
160 0.9
161 0.94
162 0.95
163 0.95
164 0.94
165 0.93
166 0.92
167 0.86
168 0.79
169 0.75
170 0.68
171 0.63
172 0.59
173 0.53
174 0.44
175 0.39
176 0.35
177 0.3
178 0.26
179 0.22
180 0.15
181 0.13
182 0.12
183 0.12
184 0.14
185 0.16
186 0.17
187 0.16
188 0.2
189 0.18
190 0.22
191 0.28
192 0.31
193 0.36
194 0.4
195 0.48
196 0.52
197 0.58
198 0.59
199 0.55
200 0.52
201 0.51
202 0.49
203 0.45
204 0.39
205 0.36
206 0.31
207 0.29
208 0.27
209 0.19
210 0.16
211 0.12
212 0.1
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.14
236 0.18
237 0.2
238 0.2
239 0.2
240 0.22
241 0.24