Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DGE9

Protein Details
Accession C5DGE9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-51IEYTLFLKSKKQRKTDWVNCFLAHydrophilic
111-135SSVSMRDEFKKRKVRKRIIVFTDNLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
120-126KKRKVRK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.333, cyto 7, cysk 7, cyto_mito 4.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006164  Ku70/Ku80_beta-barrel_dom  
IPR024193  Ku80  
IPR005161  Ku_N  
IPR016194  SPOC-like_C_dom_sf  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000781  C:chromosome, telomeric region  
GO:0043564  C:Ku70:Ku80 complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0042162  F:telomeric DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006303  P:double-strand break repair via nonhomologous end joining  
GO:0000723  P:telomere maintenance  
KEGG lth:KLTH0D04774g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02735  Ku  
PF03731  Ku_N  
CDD cd00873  KU80  
Amino Acid Sequences MGSEATTFIVDVSPSMVGLGYVEQATAYIEYTLFLKSKKQRKTDWVNCFLANCPYSRNNHETANVFELMPFTAPIGAHKVIEILKELKSLVTRSAPGKHNINSMVQCLLVSSVSMRDEFKKRKVRKRIIVFTDNLDGLDLTEEELATLEQELDCSIVLVTCGLKVEERKTSEIPIWEKCIQKISGSMEVSMTALLQEISTHRPAVVKPVRIFQGELRLGAPISDEDVTGPSYDSITVKVEGYPATKAVSSLNRRVVAKSEDGTFGPVKSVIEYEAIDDGEDSEGGVASVSKEYVTKAYRYGSDYVVLPQAIESERTYKTKPGLDLRGFVGNESIPRHFLSSESTFIIPATKDGTRADFVSFSALVDSMIKLRKFAIARYVQKLNGEVQMCLLCPILIPKKRKEPGDDETYTRALVLNRLPFAEDERCSDYPRLAQAAASSDAETAEIDALMGELIDTMDLGPGPDQTWCSTTLYRSFDPTVLEPTLPLPRPTEPRDSSVQDALCVPAIGIYRQQQILIEYMHQRIVQGSADFEVPGLPNDLQKKLFPSNELSKGTLLKLQELLAIEVNNSRASSATPNDEQQDEDEFQEIPSLESLLARGRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.07
4 0.06
5 0.07
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.07
12 0.08
13 0.08
14 0.08
15 0.07
16 0.07
17 0.08
18 0.09
19 0.11
20 0.12
21 0.13
22 0.21
23 0.3
24 0.39
25 0.48
26 0.55
27 0.61
28 0.7
29 0.81
30 0.82
31 0.83
32 0.83
33 0.77
34 0.71
35 0.64
36 0.56
37 0.51
38 0.42
39 0.32
40 0.29
41 0.31
42 0.35
43 0.4
44 0.43
45 0.39
46 0.42
47 0.46
48 0.43
49 0.43
50 0.41
51 0.36
52 0.3
53 0.27
54 0.24
55 0.2
56 0.17
57 0.13
58 0.09
59 0.1
60 0.1
61 0.11
62 0.16
63 0.16
64 0.16
65 0.16
66 0.18
67 0.17
68 0.18
69 0.2
70 0.17
71 0.17
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.19
76 0.19
77 0.2
78 0.21
79 0.24
80 0.26
81 0.34
82 0.37
83 0.39
84 0.45
85 0.43
86 0.45
87 0.44
88 0.46
89 0.4
90 0.37
91 0.32
92 0.26
93 0.23
94 0.17
95 0.16
96 0.1
97 0.08
98 0.07
99 0.08
100 0.09
101 0.11
102 0.13
103 0.18
104 0.27
105 0.34
106 0.43
107 0.51
108 0.6
109 0.69
110 0.79
111 0.83
112 0.85
113 0.89
114 0.89
115 0.87
116 0.85
117 0.76
118 0.68
119 0.61
120 0.51
121 0.4
122 0.3
123 0.21
124 0.14
125 0.13
126 0.09
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.08
151 0.11
152 0.15
153 0.21
154 0.24
155 0.27
156 0.28
157 0.3
158 0.31
159 0.35
160 0.35
161 0.31
162 0.35
163 0.36
164 0.37
165 0.35
166 0.37
167 0.32
168 0.29
169 0.3
170 0.28
171 0.3
172 0.28
173 0.27
174 0.22
175 0.22
176 0.21
177 0.17
178 0.12
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.06
185 0.09
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.13
190 0.13
191 0.23
192 0.27
193 0.31
194 0.31
195 0.35
196 0.37
197 0.37
198 0.38
199 0.29
200 0.33
201 0.27
202 0.26
203 0.22
204 0.2
205 0.19
206 0.17
207 0.16
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.11
235 0.18
236 0.21
237 0.26
238 0.31
239 0.33
240 0.34
241 0.34
242 0.34
243 0.3
244 0.28
245 0.24
246 0.2
247 0.19
248 0.18
249 0.2
250 0.17
251 0.14
252 0.12
253 0.11
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.09
281 0.1
282 0.11
283 0.13
284 0.14
285 0.16
286 0.18
287 0.2
288 0.16
289 0.16
290 0.16
291 0.15
292 0.15
293 0.13
294 0.1
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.1
301 0.12
302 0.14
303 0.16
304 0.17
305 0.2
306 0.22
307 0.25
308 0.28
309 0.34
310 0.33
311 0.34
312 0.32
313 0.34
314 0.31
315 0.27
316 0.22
317 0.14
318 0.15
319 0.15
320 0.14
321 0.1
322 0.11
323 0.12
324 0.11
325 0.11
326 0.14
327 0.15
328 0.16
329 0.16
330 0.16
331 0.15
332 0.15
333 0.16
334 0.11
335 0.09
336 0.1
337 0.09
338 0.1
339 0.11
340 0.13
341 0.13
342 0.14
343 0.14
344 0.12
345 0.12
346 0.13
347 0.12
348 0.1
349 0.09
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.08
355 0.13
356 0.13
357 0.13
358 0.13
359 0.18
360 0.18
361 0.19
362 0.25
363 0.29
364 0.33
365 0.38
366 0.41
367 0.37
368 0.37
369 0.37
370 0.31
371 0.27
372 0.23
373 0.19
374 0.17
375 0.16
376 0.15
377 0.15
378 0.13
379 0.07
380 0.06
381 0.11
382 0.18
383 0.24
384 0.29
385 0.33
386 0.44
387 0.49
388 0.53
389 0.54
390 0.53
391 0.54
392 0.58
393 0.55
394 0.48
395 0.46
396 0.43
397 0.37
398 0.29
399 0.25
400 0.16
401 0.17
402 0.18
403 0.18
404 0.19
405 0.19
406 0.2
407 0.18
408 0.22
409 0.23
410 0.2
411 0.2
412 0.26
413 0.27
414 0.29
415 0.29
416 0.26
417 0.25
418 0.26
419 0.25
420 0.18
421 0.18
422 0.16
423 0.19
424 0.19
425 0.17
426 0.14
427 0.12
428 0.12
429 0.12
430 0.11
431 0.08
432 0.06
433 0.05
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.02
441 0.03
442 0.02
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.04
448 0.04
449 0.05
450 0.06
451 0.07
452 0.08
453 0.09
454 0.11
455 0.12
456 0.16
457 0.17
458 0.19
459 0.25
460 0.29
461 0.29
462 0.32
463 0.32
464 0.3
465 0.31
466 0.3
467 0.28
468 0.24
469 0.23
470 0.19
471 0.2
472 0.26
473 0.24
474 0.24
475 0.22
476 0.26
477 0.33
478 0.37
479 0.44
480 0.4
481 0.42
482 0.47
483 0.48
484 0.47
485 0.45
486 0.41
487 0.32
488 0.3
489 0.27
490 0.22
491 0.17
492 0.13
493 0.11
494 0.12
495 0.11
496 0.15
497 0.17
498 0.21
499 0.21
500 0.22
501 0.2
502 0.2
503 0.22
504 0.19
505 0.2
506 0.2
507 0.21
508 0.23
509 0.22
510 0.21
511 0.19
512 0.2
513 0.18
514 0.15
515 0.15
516 0.14
517 0.14
518 0.14
519 0.13
520 0.12
521 0.1
522 0.1
523 0.13
524 0.12
525 0.16
526 0.2
527 0.24
528 0.25
529 0.26
530 0.31
531 0.35
532 0.37
533 0.35
534 0.39
535 0.44
536 0.5
537 0.52
538 0.47
539 0.43
540 0.42
541 0.41
542 0.37
543 0.29
544 0.24
545 0.22
546 0.21
547 0.21
548 0.2
549 0.21
550 0.19
551 0.19
552 0.16
553 0.17
554 0.18
555 0.16
556 0.15
557 0.13
558 0.11
559 0.14
560 0.19
561 0.21
562 0.26
563 0.28
564 0.32
565 0.35
566 0.35
567 0.34
568 0.3
569 0.32
570 0.27
571 0.25
572 0.22
573 0.19
574 0.18
575 0.21
576 0.19
577 0.14
578 0.13
579 0.13
580 0.12
581 0.12
582 0.13