FuNGI

A0A5N5Q2P1

Protein Details

Accession

A0A5N5Q2P1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
155-176	SNLGPLMRRKWKSRKVETACLE	Hydrophilic
698-720	HLVDHQKNLKQKQRKGPGNLATL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 15, cyto_nucl 12, nucl 7, plas 2, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR010997 HRDC-like_sf IPR006590 RNA_pol_Rpb4/RPC9_core IPR005574 Rpb4/RPC9 IPR038324 Rpb4/RPC9_sf IPR024660 UCS_central_dom
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0016020 C:membrane GO:0005634 C:nucleus GO:0000166 F:nucleotide binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF03874 RNA_pol_Rpb4 PF11701 UNC45-central

Amino Acid Sequences

MSSAAAMGPPDPATMSREDQTLILLARLMEGGQEDDETIRDLDALTKLFHDDLEAVKKGETSICTVIDGDCVDTLVCYLDMRQEEKLRGHATLTTSAYLKAAGEDGNQKLDQFFRERIRRGTYDDYIVAFCVAAVIFPIVPDLTSGLFLSEGFLSNLGPLMRRKWKSRKVETACLEMLNAACMNAACREAVQKYCADWLEEIVDQDPEEAVKEMRAGEVQEGSVSMRRHSVHVQNLAAVVLAKLRVVQPLTKQATETEPRIQAANTSLEDLTKMFTNMLIKNPDDSKQNSIEGLAYASLHAKIKEDIAKNSELLKKLVKTLEEAPPKSTLTYGALSIFVNLTRYQPTQSEEEKKMSQLKAYANAAGKLQPDPLNDDKHVSERCKRVFDSGITPVLVSHSKNGSVASLSLIISIIYSLSVTTSIRGQLAQQGAVRLLIGAWTALPTTEAVARRTAAQALARILISTNPSLVFGGTRPTPQSAAIRPLVSIIAPDPDTETRDLLPTFEALMALTNLASTDDDTRQTIIRTAWNDIEEALLSSNARVSKAAVELICNLVQSPEAVALYADYNNPQTKNRLHILLALADAQDEGTRSGAGGALASLTGYEGVIKGILARERGVNVILGLCQEESEDLRHRGAFVVYNMISAEGELGQQAREKIKDAGGVEVLMESAKKSRRSEMKILESQNAALSNYEVYQHLVDHQKNLKQKQRKGPGNLATLIKEVLAYLKTAPSPLAKQEETRHYDAEVVTRLLEGLSNANLNQDLAKGEVLMILNLRPSTIAVLSTVIEDMEDRFSDDEQAAILEVIAAVLGREESHADAGGEEAMESVEGGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.22
3	0.22
4	0.22
5	0.23
6	0.22
7	0.22
8	0.22
9	0.18
10	0.14
11	0.14
12	0.12
13	0.12
14	0.12
15	0.1
16	0.08
17	0.08
18	0.09
19	0.09
20	0.09
21	0.09
22	0.1
23	0.1
24	0.12
25	0.11
26	0.1
27	0.09
28	0.09
29	0.12
30	0.14
31	0.15
32	0.14
33	0.14
34	0.16
35	0.16
36	0.16
37	0.14
38	0.13
39	0.17
40	0.23
41	0.24
42	0.23
43	0.23
44	0.23
45	0.23
46	0.25
47	0.21
48	0.2
49	0.22
50	0.22
51	0.22
52	0.22
53	0.21
54	0.2
55	0.19
56	0.14
57	0.11
58	0.1
59	0.09
60	0.08
61	0.08
62	0.08
63	0.07
64	0.06
65	0.07
66	0.12
67	0.15
68	0.18
69	0.23
70	0.27
71	0.31
72	0.33
73	0.4
74	0.36
75	0.34
76	0.33
77	0.32
78	0.3
79	0.31
80	0.31
81	0.26
82	0.24
83	0.24
84	0.23
85	0.2
86	0.17
87	0.11
88	0.11
89	0.09
90	0.12
91	0.17
92	0.18
93	0.22
94	0.22
95	0.22
96	0.22
97	0.23
98	0.24
99	0.23
100	0.28
101	0.33
102	0.42
103	0.46
104	0.51
105	0.56
106	0.55
107	0.56
108	0.57
109	0.51
110	0.47
111	0.44
112	0.4
113	0.33
114	0.3
115	0.24
116	0.16
117	0.12
118	0.09
119	0.07
120	0.05
121	0.05
122	0.06
123	0.05
124	0.05
125	0.07
126	0.06
127	0.06
128	0.06
129	0.07
130	0.06
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.08
137	0.08
138	0.09
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.1
144	0.09
145	0.11
146	0.12
147	0.19
148	0.28
149	0.33
150	0.43
151	0.51
152	0.61
153	0.69
154	0.77
155	0.81
156	0.8
157	0.85
158	0.79
159	0.75
160	0.66
161	0.56
162	0.46
163	0.36
164	0.27
165	0.19
166	0.15
167	0.08
168	0.07
169	0.07
170	0.08
171	0.08
172	0.09
173	0.07
174	0.08
175	0.11
176	0.14
177	0.16
178	0.17
179	0.17
180	0.18
181	0.22
182	0.22
183	0.2
184	0.18
185	0.17
186	0.17
187	0.17
188	0.16
189	0.13
190	0.12
191	0.11
192	0.11
193	0.09
194	0.07
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.08
200	0.08
201	0.09
202	0.09
203	0.09
204	0.1
205	0.1
206	0.1
207	0.09
208	0.09
209	0.1
210	0.13
211	0.13
212	0.12
213	0.16
214	0.17
215	0.19
216	0.24
217	0.3
218	0.33
219	0.37
220	0.37
221	0.34
222	0.33
223	0.3
224	0.25
225	0.18
226	0.11
227	0.07
228	0.06
229	0.05
230	0.06
231	0.07
232	0.09
233	0.11
234	0.13
235	0.16
236	0.25
237	0.29
238	0.28
239	0.28
240	0.27
241	0.32
242	0.34
243	0.33
244	0.29
245	0.27
246	0.27
247	0.28
248	0.26
249	0.21
250	0.2
251	0.2
252	0.15
253	0.15
254	0.14
255	0.13
256	0.14
257	0.13
258	0.11
259	0.09
260	0.09
261	0.07
262	0.08
263	0.12
264	0.13
265	0.18
266	0.2
267	0.19
268	0.22
269	0.24
270	0.25
271	0.25
272	0.26
273	0.26
274	0.25
275	0.26
276	0.23
277	0.22
278	0.2
279	0.16
280	0.14
281	0.1
282	0.07
283	0.06
284	0.07
285	0.08
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.1
290	0.13
291	0.19
292	0.21
293	0.22
294	0.25
295	0.26
296	0.25
297	0.3
298	0.3
299	0.25
300	0.25
301	0.25
302	0.23
303	0.26
304	0.27
305	0.22
306	0.22
307	0.25
308	0.31
309	0.35
310	0.35
311	0.33
312	0.33
313	0.33
314	0.3
315	0.26
316	0.19
317	0.14
318	0.14
319	0.13
320	0.11
321	0.11
322	0.11
323	0.11
324	0.1
325	0.07
326	0.08
327	0.08
328	0.09
329	0.1
330	0.11
331	0.12
332	0.14
333	0.16
334	0.2
335	0.24
336	0.3
337	0.3
338	0.33
339	0.32
340	0.33
341	0.37
342	0.32
343	0.29
344	0.26
345	0.26
346	0.26
347	0.27
348	0.28
349	0.23
350	0.23
351	0.22
352	0.2
353	0.19
354	0.14
355	0.16
356	0.15
357	0.14
358	0.19
359	0.22
360	0.23
361	0.23
362	0.24
363	0.22
364	0.25
365	0.28
366	0.26
367	0.29
368	0.33
369	0.35
370	0.37
371	0.37
372	0.36
373	0.35
374	0.34
375	0.32
376	0.28
377	0.26
378	0.22
379	0.21
380	0.18
381	0.16
382	0.16
383	0.11
384	0.1
385	0.1
386	0.1
387	0.11
388	0.11
389	0.09
390	0.09
391	0.08
392	0.07
393	0.07
394	0.07
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.05
399	0.05
400	0.04
401	0.03
402	0.03
403	0.02
404	0.02
405	0.03
406	0.04
407	0.04
408	0.05
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.07
413	0.1
414	0.11
415	0.12
416	0.12
417	0.12
418	0.12
419	0.11
420	0.11
421	0.06
422	0.06
423	0.04
424	0.03
425	0.03
426	0.03
427	0.03
428	0.03
429	0.03
430	0.03
431	0.03
432	0.04
433	0.08
434	0.09
435	0.1
436	0.11
437	0.12
438	0.12
439	0.13
440	0.13
441	0.11
442	0.1
443	0.11
444	0.11
445	0.12
446	0.11
447	0.1
448	0.09
449	0.09
450	0.09
451	0.08
452	0.08
453	0.07
454	0.07
455	0.08
456	0.07
457	0.07
458	0.06
459	0.08
460	0.08
461	0.09
462	0.1
463	0.11
464	0.12
465	0.13
466	0.17
467	0.16
468	0.2
469	0.21
470	0.2
471	0.19
472	0.19
473	0.17
474	0.13
475	0.11
476	0.07
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.09
481	0.1
482	0.12
483	0.12
484	0.13
485	0.11
486	0.13
487	0.13
488	0.11
489	0.1
490	0.09
491	0.09
492	0.08
493	0.07
494	0.05
495	0.06
496	0.06
497	0.05
498	0.05
499	0.04
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.05
504	0.07
505	0.08
506	0.1
507	0.1
508	0.11
509	0.12
510	0.12
511	0.14
512	0.12
513	0.16
514	0.17
515	0.19
516	0.2
517	0.19
518	0.19
519	0.17
520	0.16
521	0.11
522	0.1
523	0.08
524	0.06
525	0.06
526	0.05
527	0.08
528	0.08
529	0.08
530	0.08
531	0.09
532	0.1
533	0.11
534	0.14
535	0.12
536	0.12
537	0.13
538	0.15
539	0.14
540	0.12
541	0.11
542	0.09
543	0.09
544	0.08
545	0.07
546	0.06
547	0.05
548	0.06
549	0.05
550	0.06
551	0.07
552	0.07
553	0.07
554	0.07
555	0.11
556	0.14
557	0.15
558	0.16
559	0.21
560	0.23
561	0.28
562	0.3
563	0.29
564	0.27
565	0.29
566	0.29
567	0.25
568	0.23
569	0.18
570	0.14
571	0.12
572	0.11
573	0.08
574	0.06
575	0.06
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.05
584	0.05
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.04
589	0.03
590	0.03
591	0.03
592	0.03
593	0.03
594	0.04
595	0.04
596	0.04
597	0.05
598	0.07
599	0.09
600	0.1
601	0.11
602	0.12
603	0.13
604	0.14
605	0.14
606	0.11
607	0.1
608	0.1
609	0.09
610	0.08
611	0.08
612	0.07
613	0.06
614	0.06
615	0.07
616	0.07
617	0.11
618	0.15
619	0.16
620	0.18
621	0.18
622	0.19
623	0.19
624	0.19
625	0.18
626	0.14
627	0.19
628	0.18
629	0.18
630	0.17
631	0.16
632	0.15
633	0.12
634	0.12
635	0.05
636	0.06
637	0.06
638	0.06
639	0.06
640	0.09
641	0.11
642	0.14
643	0.15
644	0.17
645	0.19
646	0.21
647	0.24
648	0.23
649	0.23
650	0.2
651	0.19
652	0.17
653	0.14
654	0.13
655	0.08
656	0.08
657	0.06
658	0.1
659	0.16
660	0.22
661	0.24
662	0.33
663	0.42
664	0.5
665	0.59
666	0.63
667	0.66
668	0.68
669	0.69
670	0.64
671	0.55
672	0.48
673	0.41
674	0.33
675	0.24
676	0.17
677	0.14
678	0.12
679	0.11
680	0.12
681	0.1
682	0.11
683	0.11
684	0.11
685	0.15
686	0.22
687	0.23
688	0.29
689	0.35
690	0.39
691	0.46
692	0.55
693	0.6
694	0.62
695	0.7
696	0.74
697	0.78
698	0.82
699	0.82
700	0.83
701	0.81
702	0.77
703	0.72
704	0.64
705	0.55
706	0.46
707	0.38
708	0.28
709	0.2
710	0.14
711	0.12
712	0.1
713	0.1
714	0.1
715	0.13
716	0.13
717	0.14
718	0.15
719	0.17
720	0.19
721	0.24
722	0.3
723	0.29
724	0.34
725	0.41
726	0.49
727	0.51
728	0.52
729	0.47
730	0.41
731	0.42
732	0.38
733	0.35
734	0.29
735	0.23
736	0.2
737	0.18
738	0.18
739	0.14
740	0.14
741	0.1
742	0.09
743	0.1
744	0.11
745	0.11
746	0.13
747	0.13
748	0.13
749	0.12
750	0.11
751	0.1
752	0.1
753	0.11
754	0.09
755	0.09
756	0.12
757	0.11
758	0.11
759	0.11
760	0.1
761	0.13
762	0.13
763	0.13
764	0.1
765	0.1
766	0.12
767	0.12
768	0.12
769	0.1
770	0.12
771	0.12
772	0.12
773	0.12
774	0.09
775	0.08
776	0.08
777	0.09
778	0.11
779	0.11
780	0.11
781	0.12
782	0.13
783	0.16
784	0.15
785	0.14
786	0.11
787	0.11
788	0.1
789	0.09
790	0.08
791	0.05
792	0.05
793	0.05
794	0.04
795	0.04
796	0.03
797	0.03
798	0.04
799	0.04
800	0.05
801	0.07
802	0.09
803	0.1
804	0.11
805	0.11
806	0.11
807	0.12
808	0.11
809	0.1
810	0.08
811	0.07
812	0.06
813	0.06

A0A5N5Q2P1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer