FuNGI

C5DM49

Protein Details

Accession

C5DM49

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
157-176	EPTHQAKKRKVENGDARRLA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 16.5, cyto 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006397 P:mRNA processing
KEGG	lth:KLTH0G05984g -
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MNIYNEIFDATQVSHALLGHFTSEKTEQLIVAKTNILSVYTTEDGKLVLLHEFKLHGQITGMALVPQMEGPLDCLVVSTGKAKLSLVRFDPSMPMCLETLSLHYYEAEFTRKNLIELAKTSKLRLDPERRCVLLFNSDVLALLPLNINEEDEDDNQEPTHQAKKRKVENGDARRLAKQSSVLHVSDLSAELKNVVDIQFLNSFSQPTLAVLYQPRLAWSGNDKVAGKGSMRLMAITPHEKKNTTIYQVKELPHDVHTIIPLANSCVLVGVNEIVSVDNTGAIQSTIQLNSFSPKFTGSKQIDNSSLEVMFTEPIVWASAMVSKDREILILMDHKADMYSITLQSEGRLLIDFTLVRLPIVNDIFKDQNLPTCIVALSGGIRLKTCQFFIGFSSGDAVVVKSNNLRSAFESQYREAIELPNDEDEDYDALYGDDEDLARPVNDNKATVETAVPFEIELMDSLINVGPITSICTGRVSSINATIEGLPNPNRNELAIVSTSGHDSGTYLNVMEPSVRPLVQQALKFTSVTKIWNLKIRKKDKYLVTTDSGAEKSDVYEIGAKIASIKPKHFKRNVTTVEIAILGGGKRIVQVTTKAVYLFNLGFKKLMTISFDFEVVHVSILDPFILLTNSKGEIKIYELDSKHRKKLTKVPLPEVLEEMIITSGAILKSSICNQFMIGLENADKDQLLFTFVGADNQIIMFPKEHHDRVFQLNGVDMLSEMLYVSTYQLPEEIVPDPSIKQVMINKLGKDKKEEFLTILTFGGEIYMYRKTGNKFFKSMQSNDLQITGAPGNAYAKGVSAIERIAHYVKYYNGYSIILITGSTPYMIVKEDYSTPKIFKFANIPLVSLAPWGTDSVLCVDDIKNARIVTLDTTFSYGNRLPVKRVPIEDPLNYYGCLNNVAYHERSGMYIVSYTKEIEYEAISEEGEKTVGSDDSVPHARGFQSGVLLLNPKSWNIIDKADYEKNSLINDMKTMLIQTNSRTRRKREYLVVGNTFVRDEDIGTMGSFCLYDITEVVPEPGKPDTNYKLKQIFYEEFRGAVSSVCEISGRFLISQSQKVLVRDVQEDNSVVPVAFLDVPVFVTDSKSCGNLLIIGDAMQGFQFVGFDAEPYRMIPLGKSVSKFEVMSLEFLVNNGSIYFLVSDRSNILHILKYAPDEPNSLSGQKLVHCTSFNLHSTNTCMKLLLKNDEFPTLGEPPAFQAIGAQTDGSLFNVVPLSESSYRRLYMVQQQLIEKDVHLCGLNPKMERLQNDFYQLGHLMRPMLDFTVIKSFATLPLNKRKQIAAKAGRQADFEIWRDLINVEYSTRSLC

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.12
3	0.13
4	0.12
5	0.12
6	0.12
7	0.13
8	0.13
9	0.16
10	0.17
11	0.17
12	0.19
13	0.2
14	0.18
15	0.21
16	0.25
17	0.23
18	0.23
19	0.24
20	0.21
21	0.23
22	0.21
23	0.19
24	0.15
25	0.14
26	0.18
27	0.18
28	0.19
29	0.17
30	0.17
31	0.16
32	0.16
33	0.15
34	0.1
35	0.13
36	0.14
37	0.14
38	0.16
39	0.18
40	0.18
41	0.24
42	0.23
43	0.19
44	0.18
45	0.2
46	0.2
47	0.19
48	0.19
49	0.13
50	0.12
51	0.12
52	0.12
53	0.1
54	0.08
55	0.07
56	0.07
57	0.09
58	0.09
59	0.09
60	0.08
61	0.09
62	0.09
63	0.1
64	0.11
65	0.11
66	0.13
67	0.14
68	0.15
69	0.15
70	0.2
71	0.24
72	0.3
73	0.3
74	0.31
75	0.31
76	0.32
77	0.37
78	0.33
79	0.32
80	0.26
81	0.24
82	0.21
83	0.2
84	0.2
85	0.15
86	0.16
87	0.15
88	0.14
89	0.13
90	0.14
91	0.14
92	0.15
93	0.16
94	0.18
95	0.17
96	0.18
97	0.27
98	0.27
99	0.27
100	0.3
101	0.31
102	0.3
103	0.34
104	0.4
105	0.4
106	0.4
107	0.41
108	0.41
109	0.41
110	0.42
111	0.48
112	0.52
113	0.52
114	0.6
115	0.66
116	0.62
117	0.59
118	0.55
119	0.49
120	0.45
121	0.38
122	0.31
123	0.25
124	0.23
125	0.23
126	0.2
127	0.18
128	0.1
129	0.09
130	0.08
131	0.07
132	0.1
133	0.1
134	0.11
135	0.1
136	0.12
137	0.14
138	0.14
139	0.2
140	0.18
141	0.19
142	0.18
143	0.19
144	0.18
145	0.18
146	0.26
147	0.26
148	0.34
149	0.42
150	0.52
151	0.61
152	0.68
153	0.71
154	0.73
155	0.78
156	0.8
157	0.81
158	0.78
159	0.71
160	0.66
161	0.62
162	0.53
163	0.45
164	0.41
165	0.35
166	0.35
167	0.37
168	0.33
169	0.33
170	0.32
171	0.29
172	0.23
173	0.21
174	0.16
175	0.12
176	0.12
177	0.11
178	0.11
179	0.11
180	0.11
181	0.1
182	0.09
183	0.09
184	0.13
185	0.15
186	0.16
187	0.18
188	0.17
189	0.17
190	0.16
191	0.17
192	0.14
193	0.11
194	0.13
195	0.11
196	0.14
197	0.16
198	0.18
199	0.2
200	0.2
201	0.2
202	0.19
203	0.19
204	0.18
205	0.21
206	0.25
207	0.25
208	0.29
209	0.29
210	0.28
211	0.3
212	0.29
213	0.25
214	0.22
215	0.22
216	0.22
217	0.21
218	0.2
219	0.18
220	0.19
221	0.23
222	0.27
223	0.3
224	0.33
225	0.36
226	0.37
227	0.38
228	0.43
229	0.45
230	0.44
231	0.46
232	0.42
233	0.47
234	0.51
235	0.51
236	0.47
237	0.44
238	0.39
239	0.34
240	0.33
241	0.26
242	0.21
243	0.2
244	0.18
245	0.15
246	0.14
247	0.12
248	0.12
249	0.12
250	0.11
251	0.1
252	0.09
253	0.08
254	0.08
255	0.08
256	0.07
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.05
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.06
271	0.08
272	0.09
273	0.09
274	0.1
275	0.1
276	0.15
277	0.16
278	0.15
279	0.13
280	0.16
281	0.17
282	0.19
283	0.28
284	0.27
285	0.35
286	0.38
287	0.41
288	0.42
289	0.41
290	0.41
291	0.33
292	0.29
293	0.21
294	0.17
295	0.14
296	0.1
297	0.09
298	0.08
299	0.06
300	0.06
301	0.07
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.1
306	0.1
307	0.11
308	0.12
309	0.12
310	0.14
311	0.14
312	0.14
313	0.1
314	0.1
315	0.12
316	0.16
317	0.16
318	0.15
319	0.14
320	0.14
321	0.13
322	0.13
323	0.1
324	0.08
325	0.09
326	0.09
327	0.1
328	0.11
329	0.11
330	0.11
331	0.12
332	0.1
333	0.08
334	0.08
335	0.08
336	0.07
337	0.09
338	0.08
339	0.08
340	0.1
341	0.1
342	0.09
343	0.1
344	0.1
345	0.13
346	0.15
347	0.15
348	0.13
349	0.16
350	0.18
351	0.17
352	0.2
353	0.15
354	0.19
355	0.2
356	0.21
357	0.18
358	0.17
359	0.17
360	0.14
361	0.14
362	0.09
363	0.08
364	0.09
365	0.1
366	0.1
367	0.1
368	0.11
369	0.15
370	0.16
371	0.16
372	0.15
373	0.14
374	0.15
375	0.17
376	0.19
377	0.15
378	0.14
379	0.15
380	0.13
381	0.12
382	0.12
383	0.1
384	0.08
385	0.08
386	0.09
387	0.1
388	0.11
389	0.15
390	0.16
391	0.17
392	0.19
393	0.25
394	0.27
395	0.31
396	0.33
397	0.29
398	0.32
399	0.31
400	0.28
401	0.23
402	0.22
403	0.18
404	0.15
405	0.16
406	0.13
407	0.13
408	0.12
409	0.12
410	0.11
411	0.09
412	0.08
413	0.07
414	0.06
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.04
419	0.04
420	0.04
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.07
426	0.08
427	0.13
428	0.14
429	0.14
430	0.15
431	0.18
432	0.18
433	0.18
434	0.17
435	0.13
436	0.13
437	0.12
438	0.11
439	0.08
440	0.08
441	0.07
442	0.06
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.04
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.07
455	0.07
456	0.08
457	0.08
458	0.1
459	0.1
460	0.11
461	0.13
462	0.12
463	0.12
464	0.16
465	0.16
466	0.15
467	0.16
468	0.15
469	0.14
470	0.13
471	0.14
472	0.13
473	0.17
474	0.18
475	0.18
476	0.18
477	0.17
478	0.18
479	0.15
480	0.16
481	0.12
482	0.11
483	0.11
484	0.11
485	0.11
486	0.1
487	0.09
488	0.07
489	0.06
490	0.06
491	0.07
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.07
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.09
500	0.1
501	0.1
502	0.09
503	0.1
504	0.16
505	0.19
506	0.2
507	0.2
508	0.22
509	0.22
510	0.23
511	0.22
512	0.19
513	0.16
514	0.17
515	0.18
516	0.2
517	0.21
518	0.28
519	0.34
520	0.38
521	0.47
522	0.54
523	0.57
524	0.57
525	0.63
526	0.62
527	0.64
528	0.62
529	0.56
530	0.51
531	0.45
532	0.4
533	0.35
534	0.29
535	0.22
536	0.17
537	0.12
538	0.1
539	0.09
540	0.09
541	0.07
542	0.1
543	0.09
544	0.1
545	0.1
546	0.09
547	0.1
548	0.12
549	0.17
550	0.15
551	0.19
552	0.27
553	0.34
554	0.44
555	0.48
556	0.53
557	0.53
558	0.61
559	0.62
560	0.58
561	0.53
562	0.43
563	0.38
564	0.32
565	0.26
566	0.15
567	0.12
568	0.06
569	0.05
570	0.05
571	0.04
572	0.04
573	0.05
574	0.06
575	0.06
576	0.08
577	0.11
578	0.12
579	0.12
580	0.12
581	0.12
582	0.12
583	0.13
584	0.12
585	0.13
586	0.13
587	0.13
588	0.13
589	0.12
590	0.13
591	0.12
592	0.12
593	0.11
594	0.11
595	0.13
596	0.13
597	0.14
598	0.13
599	0.12
600	0.12
601	0.09
602	0.08
603	0.06
604	0.06
605	0.06
606	0.06
607	0.05
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.05
615	0.07
616	0.07
617	0.07
618	0.07
619	0.07
620	0.09
621	0.11
622	0.12
623	0.16
624	0.16
625	0.22
626	0.31
627	0.35
628	0.38
629	0.41
630	0.42
631	0.41
632	0.51
633	0.55
634	0.55
635	0.55
636	0.54
637	0.56
638	0.56
639	0.51
640	0.42
641	0.32
642	0.23
643	0.18
644	0.14
645	0.07
646	0.05
647	0.04
648	0.03
649	0.04
650	0.04
651	0.04
652	0.04
653	0.05
654	0.06
655	0.09
656	0.12
657	0.11
658	0.11
659	0.11
660	0.13
661	0.13
662	0.14
663	0.11
664	0.09
665	0.09
666	0.09
667	0.09
668	0.07
669	0.07
670	0.05
671	0.05
672	0.04
673	0.06
674	0.05
675	0.05
676	0.08
677	0.08
678	0.08
679	0.08
680	0.08
681	0.06
682	0.06
683	0.07
684	0.05
685	0.05
686	0.05
687	0.06
688	0.11
689	0.15
690	0.16
691	0.17
692	0.19
693	0.21
694	0.25
695	0.26
696	0.22
697	0.18
698	0.17
699	0.16
700	0.14
701	0.11
702	0.07
703	0.05
704	0.04
705	0.04
706	0.03
707	0.03
708	0.03
709	0.03
710	0.04
711	0.05
712	0.05
713	0.05
714	0.06
715	0.06
716	0.06
717	0.08
718	0.08
719	0.08
720	0.08
721	0.09
722	0.09
723	0.1
724	0.1
725	0.08
726	0.09
727	0.12
728	0.16
729	0.22
730	0.25
731	0.25
732	0.33
733	0.37
734	0.36
735	0.39
736	0.38
737	0.34
738	0.34
739	0.34
740	0.27
741	0.26
742	0.26
743	0.2
744	0.17
745	0.13
746	0.1
747	0.09
748	0.07
749	0.05
750	0.04
751	0.05
752	0.07
753	0.07
754	0.08
755	0.12
756	0.14
757	0.22
758	0.31
759	0.32
760	0.34
761	0.37
762	0.44
763	0.46
764	0.46
765	0.42
766	0.36
767	0.34
768	0.31
769	0.29
770	0.21
771	0.15
772	0.16
773	0.11
774	0.09
775	0.07
776	0.07
777	0.07
778	0.07
779	0.08
780	0.05
781	0.05
782	0.06
783	0.06
784	0.07
785	0.07
786	0.07
787	0.07
788	0.07
789	0.09
790	0.09
791	0.09
792	0.09
793	0.1
794	0.11
795	0.14
796	0.14
797	0.13
798	0.13
799	0.14
800	0.13
801	0.12
802	0.1
803	0.07
804	0.06
805	0.06
806	0.05
807	0.05
808	0.05
809	0.05
810	0.04
811	0.05
812	0.06
813	0.06
814	0.06
815	0.08
816	0.12
817	0.16
818	0.19
819	0.2
820	0.2
821	0.2
822	0.23
823	0.21
824	0.19
825	0.21
826	0.21
827	0.29
828	0.28
829	0.27
830	0.26
831	0.26
832	0.24
833	0.19
834	0.15
835	0.06
836	0.06
837	0.06
838	0.06
839	0.05
840	0.06
841	0.07
842	0.08
843	0.07
844	0.08
845	0.08
846	0.13
847	0.15
848	0.15
849	0.17
850	0.16
851	0.16
852	0.16
853	0.16
854	0.14
855	0.14
856	0.14
857	0.11
858	0.13
859	0.13
860	0.13
861	0.16
862	0.14
863	0.17
864	0.23
865	0.24
866	0.26
867	0.3
868	0.35
869	0.35
870	0.36
871	0.35
872	0.36
873	0.39
874	0.37
875	0.37
876	0.34
877	0.32
878	0.3
879	0.26
880	0.19
881	0.16
882	0.16
883	0.12
884	0.11
885	0.12
886	0.16
887	0.16
888	0.16
889	0.17
890	0.15
891	0.15
892	0.14
893	0.12
894	0.09
895	0.1
896	0.1
897	0.1
898	0.11
899	0.11
900	0.1
901	0.1
902	0.1
903	0.09
904	0.09
905	0.08
906	0.09
907	0.09
908	0.08
909	0.09
910	0.09
911	0.08
912	0.08
913	0.06
914	0.06
915	0.07
916	0.07
917	0.07
918	0.08
919	0.08
920	0.13
921	0.16
922	0.16
923	0.15
924	0.16
925	0.16
926	0.16
927	0.17
928	0.12
929	0.11
930	0.11
931	0.11
932	0.11
933	0.13
934	0.12
935	0.16
936	0.15
937	0.14
938	0.15
939	0.15
940	0.17
941	0.17
942	0.2
943	0.17
944	0.2
945	0.26
946	0.29
947	0.3
948	0.3
949	0.29
950	0.28
951	0.26
952	0.26
953	0.22
954	0.18
955	0.18
956	0.16
957	0.14
958	0.13
959	0.13
960	0.12
961	0.12
962	0.13
963	0.16
964	0.25
965	0.32
966	0.41
967	0.46
968	0.51
969	0.59
970	0.65
971	0.69
972	0.68
973	0.7
974	0.71
975	0.73
976	0.7
977	0.62
978	0.56
979	0.49
980	0.4
981	0.3
982	0.21
983	0.13
984	0.1
985	0.09
986	0.09
987	0.09
988	0.09
989	0.09
990	0.08
991	0.08
992	0.07
993	0.06
994	0.05
995	0.05
996	0.05
997	0.06
998	0.07
999	0.08
1000	0.08
1001	0.09
1002	0.09
1003	0.09
1004	0.11
1005	0.13
1006	0.14
1007	0.15
1008	0.21
1009	0.27
1010	0.35
1011	0.38
1012	0.43
1013	0.46
1014	0.45
1015	0.46
1016	0.47
1017	0.45
1018	0.4
1019	0.43
1020	0.37
1021	0.31
1022	0.3
1023	0.29
1024	0.22
1025	0.18
1026	0.14
1027	0.09
1028	0.09
1029	0.09
1030	0.09
1031	0.08
1032	0.1
1033	0.12
1034	0.12
1035	0.1
1036	0.11
1037	0.17
1038	0.21
1039	0.25
1040	0.24
1041	0.27
1042	0.29
1043	0.3
1044	0.33
1045	0.29
1046	0.28
1047	0.28
1048	0.3
1049	0.27
1050	0.26
1051	0.25
1052	0.22
1053	0.21
1054	0.18
1055	0.13
1056	0.1
1057	0.08
1058	0.08
1059	0.08
1060	0.08
1061	0.07
1062	0.06
1063	0.07
1064	0.08
1065	0.08
1066	0.07
1067	0.09
1068	0.09
1069	0.12
1070	0.12
1071	0.13
1072	0.13
1073	0.13
1074	0.13
1075	0.13
1076	0.13
1077	0.12
1078	0.11
1079	0.1
1080	0.1
1081	0.1
1082	0.09
1083	0.06
1084	0.06
1085	0.05
1086	0.04
1087	0.04
1088	0.04
1089	0.06
1090	0.06
1091	0.07
1092	0.08
1093	0.09
1094	0.09
1095	0.1
1096	0.11
1097	0.11
1098	0.11
1099	0.11
1100	0.15
1101	0.21
1102	0.24
1103	0.25
1104	0.27
1105	0.29
1106	0.31
1107	0.31
1108	0.26
1109	0.26
1110	0.23
1111	0.23
1112	0.21
1113	0.19
1114	0.16
1115	0.16
1116	0.16
1117	0.1
1118	0.1
1119	0.08
1120	0.07
1121	0.06
1122	0.07
1123	0.08
1124	0.07
1125	0.09
1126	0.09
1127	0.1
1128	0.11
1129	0.12
1130	0.13
1131	0.13
1132	0.15
1133	0.15
1134	0.16
1135	0.18
1136	0.18
1137	0.2
1138	0.23
1139	0.24
1140	0.24
1141	0.24
1142	0.25
1143	0.27
1144	0.28
1145	0.26
1146	0.22
1147	0.21
1148	0.22
1149	0.22
1150	0.26
1151	0.24
1152	0.24
1153	0.24
1154	0.26
1155	0.28
1156	0.32
1157	0.32
1158	0.28
1159	0.27
1160	0.26
1161	0.31
1162	0.35
1163	0.34
1164	0.28
1165	0.27
1166	0.27
1167	0.33
1168	0.37
1169	0.4
1170	0.37
1171	0.39
1172	0.41
1173	0.43
1174	0.41
1175	0.35
1176	0.34
1177	0.27
1178	0.25
1179	0.19
1180	0.18
1181	0.17
1182	0.2
1183	0.19
1184	0.14
1185	0.14
1186	0.15
1187	0.17
1188	0.17
1189	0.14
1190	0.11
1191	0.12
1192	0.13
1193	0.11
1194	0.1
1195	0.08
1196	0.09
1197	0.1
1198	0.1
1199	0.1
1200	0.11
1201	0.16
1202	0.21
1203	0.23
1204	0.26
1205	0.29
1206	0.3
1207	0.29
1208	0.3
1209	0.29
1210	0.34
1211	0.42
1212	0.42
1213	0.42
1214	0.43
1215	0.44
1216	0.44
1217	0.39
1218	0.3
1219	0.23
1220	0.19
1221	0.18
1222	0.16
1223	0.16
1224	0.19
1225	0.25
1226	0.3
1227	0.28
1228	0.31
1229	0.36
1230	0.4
1231	0.43
1232	0.45
1233	0.45
1234	0.43
1235	0.48
1236	0.45
1237	0.38
1238	0.37
1239	0.35
1240	0.28
1241	0.23
1242	0.21
1243	0.17
1244	0.17
1245	0.18
1246	0.16
1247	0.15
1248	0.17
1249	0.15
1250	0.17
1251	0.24
1252	0.24
1253	0.22
1254	0.22
1255	0.22
1256	0.24
1257	0.3
1258	0.33
1259	0.32
1260	0.43
1261	0.51
1262	0.53
1263	0.55
1264	0.57
1265	0.59
1266	0.62
1267	0.65
1268	0.64
1269	0.65
1270	0.71
1271	0.76
1272	0.71
1273	0.64
1274	0.57
1275	0.52
1276	0.48
1277	0.42
1278	0.37
1279	0.3
1280	0.28
1281	0.28
1282	0.26
1283	0.22
1284	0.19
1285	0.18
1286	0.15
1287	0.16

C5DM49

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer