Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DHV2

Protein Details
Accession C5DHV2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
180-199AAAKKSRKSRSKKNSLPTGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
183-192KKSRKSRSKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020998  Med3  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG lth:KLTH0E07370g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11593  Med3  
Amino Acid Sequences MADKEGGEVSKGLKEFDFGNLHEKLESEDGYKDSVKQEIQSVQDSIQPMRLRFNELLNMLAIIDQETEVSNQEKFLSIRAKIVEFVSELQAFSSSYGRLQPLFDNIQQQPKGGKTSIKFTPLERLRHLSDASLGNQAKSASGGSPPAAAVASVPTTTKQPKSSTNTPTSNAATPSATFNAAAKKSRKSRSKKNSLPTGLGGHPVATAASPAAVAAAAAAVSTNPGVAMGSNPGIQQQFTPSTNPTQILSSMSPMNMMSSPMNIMSPANNVNMAYTGPTKPPVPSHRHMPSSSQQMNMNGITPANILNMSMMEQANQPHLTTAPAPQPPNQLDMNNLDLNNLDLSNLNMDFLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.23
4 0.25
5 0.21
6 0.27
7 0.27
8 0.27
9 0.26
10 0.25
11 0.22
12 0.21
13 0.21
14 0.17
15 0.19
16 0.19
17 0.22
18 0.23
19 0.22
20 0.2
21 0.24
22 0.23
23 0.22
24 0.26
25 0.27
26 0.3
27 0.3
28 0.3
29 0.26
30 0.28
31 0.29
32 0.25
33 0.27
34 0.27
35 0.24
36 0.3
37 0.3
38 0.33
39 0.33
40 0.35
41 0.34
42 0.32
43 0.32
44 0.25
45 0.24
46 0.17
47 0.16
48 0.12
49 0.07
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.1
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.13
61 0.12
62 0.17
63 0.21
64 0.2
65 0.24
66 0.26
67 0.26
68 0.25
69 0.25
70 0.21
71 0.17
72 0.17
73 0.17
74 0.15
75 0.14
76 0.13
77 0.13
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.09
82 0.09
83 0.12
84 0.13
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.18
89 0.21
90 0.22
91 0.26
92 0.27
93 0.34
94 0.33
95 0.33
96 0.31
97 0.29
98 0.31
99 0.26
100 0.29
101 0.22
102 0.28
103 0.31
104 0.33
105 0.32
106 0.29
107 0.38
108 0.39
109 0.42
110 0.4
111 0.4
112 0.37
113 0.39
114 0.38
115 0.28
116 0.26
117 0.23
118 0.22
119 0.24
120 0.22
121 0.19
122 0.2
123 0.2
124 0.16
125 0.14
126 0.13
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.09
143 0.13
144 0.15
145 0.18
146 0.21
147 0.28
148 0.35
149 0.43
150 0.46
151 0.5
152 0.5
153 0.48
154 0.49
155 0.43
156 0.37
157 0.3
158 0.24
159 0.17
160 0.15
161 0.15
162 0.13
163 0.11
164 0.09
165 0.1
166 0.13
167 0.15
168 0.19
169 0.2
170 0.26
171 0.34
172 0.42
173 0.51
174 0.54
175 0.63
176 0.7
177 0.78
178 0.79
179 0.8
180 0.81
181 0.74
182 0.69
183 0.6
184 0.53
185 0.42
186 0.36
187 0.27
188 0.18
189 0.14
190 0.12
191 0.1
192 0.06
193 0.05
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.02
207 0.02
208 0.03
209 0.02
210 0.02
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.04
215 0.05
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.12
224 0.15
225 0.16
226 0.18
227 0.18
228 0.21
229 0.23
230 0.24
231 0.21
232 0.18
233 0.18
234 0.19
235 0.17
236 0.16
237 0.15
238 0.14
239 0.14
240 0.13
241 0.13
242 0.1
243 0.12
244 0.1
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.11
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.11
260 0.11
261 0.12
262 0.13
263 0.14
264 0.16
265 0.17
266 0.18
267 0.26
268 0.32
269 0.37
270 0.4
271 0.48
272 0.54
273 0.58
274 0.58
275 0.56
276 0.55
277 0.57
278 0.56
279 0.49
280 0.45
281 0.42
282 0.43
283 0.37
284 0.32
285 0.22
286 0.19
287 0.16
288 0.14
289 0.12
290 0.1
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.12
297 0.11
298 0.11
299 0.13
300 0.14
301 0.19
302 0.19
303 0.18
304 0.16
305 0.16
306 0.18
307 0.17
308 0.21
309 0.24
310 0.29
311 0.31
312 0.34
313 0.42
314 0.41
315 0.44
316 0.42
317 0.35
318 0.33
319 0.35
320 0.36
321 0.32
322 0.3
323 0.26
324 0.23
325 0.24
326 0.22
327 0.18
328 0.12
329 0.09
330 0.1
331 0.14
332 0.14