Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DN10

Protein Details
Accession C5DN10    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-217NDPIKRKQWKHVVLEKKRRNABasic
248-276SPDENVPRKKLKPDRTPNKRIPKHVLLNYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
255-268RKKLKPDRTPNKRI
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
KEGG lth:KLTH0G13266g  -  
CDD cd11388  bHLH_ScINO2_like  
Amino Acid Sequences MDTDRLLDIFDFDLEIDFETAYEMINNEDQNSKHTAGRPLVENEVDRWSMSDASLVKREIDPLRAHLDGSHKDIEVEHLRRKSEAHRAGLLSEFESAAIEQFLDSLVAGDGKPLKDPFSPAWDELPRGLHQDPCEKPSVHNQEFVHKPESTPGLHIGGEQKRSKERTSIVPADYAPAVIKSPDITVSDSEVPVDLQNDPIKRKQWKHVVLEKKRRNAIKVNFDDLIKLIRFPRMSVMASQEAQLKERSPDENVPRKKLKPDRTPNKRIPKHVLLNYIIEDMELLSQANKSLEALLEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.09
4 0.07
5 0.07
6 0.08
7 0.08
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.09
12 0.12
13 0.12
14 0.13
15 0.17
16 0.18
17 0.2
18 0.25
19 0.25
20 0.26
21 0.3
22 0.35
23 0.35
24 0.39
25 0.4
26 0.39
27 0.4
28 0.39
29 0.35
30 0.3
31 0.3
32 0.27
33 0.22
34 0.2
35 0.18
36 0.16
37 0.15
38 0.17
39 0.15
40 0.18
41 0.22
42 0.21
43 0.21
44 0.21
45 0.27
46 0.25
47 0.28
48 0.26
49 0.26
50 0.3
51 0.28
52 0.28
53 0.25
54 0.29
55 0.27
56 0.29
57 0.28
58 0.23
59 0.23
60 0.23
61 0.27
62 0.28
63 0.31
64 0.33
65 0.34
66 0.35
67 0.35
68 0.37
69 0.37
70 0.39
71 0.42
72 0.39
73 0.39
74 0.39
75 0.39
76 0.39
77 0.34
78 0.24
79 0.18
80 0.14
81 0.1
82 0.1
83 0.08
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.06
97 0.08
98 0.08
99 0.1
100 0.1
101 0.13
102 0.13
103 0.16
104 0.16
105 0.2
106 0.22
107 0.21
108 0.25
109 0.24
110 0.24
111 0.22
112 0.23
113 0.18
114 0.19
115 0.19
116 0.17
117 0.18
118 0.25
119 0.25
120 0.25
121 0.29
122 0.25
123 0.26
124 0.33
125 0.41
126 0.34
127 0.39
128 0.37
129 0.4
130 0.42
131 0.44
132 0.38
133 0.28
134 0.26
135 0.23
136 0.25
137 0.18
138 0.17
139 0.15
140 0.13
141 0.13
142 0.14
143 0.18
144 0.18
145 0.23
146 0.23
147 0.24
148 0.28
149 0.31
150 0.31
151 0.29
152 0.29
153 0.31
154 0.37
155 0.4
156 0.36
157 0.34
158 0.33
159 0.3
160 0.27
161 0.2
162 0.12
163 0.08
164 0.08
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.13
174 0.14
175 0.14
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.07
182 0.09
183 0.13
184 0.16
185 0.18
186 0.22
187 0.28
188 0.35
189 0.4
190 0.46
191 0.53
192 0.59
193 0.64
194 0.7
195 0.74
196 0.77
197 0.83
198 0.82
199 0.8
200 0.78
201 0.73
202 0.69
203 0.68
204 0.66
205 0.65
206 0.62
207 0.59
208 0.54
209 0.5
210 0.46
211 0.37
212 0.32
213 0.22
214 0.19
215 0.15
216 0.19
217 0.19
218 0.19
219 0.23
220 0.23
221 0.24
222 0.24
223 0.28
224 0.27
225 0.27
226 0.27
227 0.28
228 0.25
229 0.25
230 0.25
231 0.22
232 0.2
233 0.23
234 0.25
235 0.24
236 0.32
237 0.4
238 0.49
239 0.53
240 0.59
241 0.63
242 0.65
243 0.7
244 0.72
245 0.73
246 0.74
247 0.79
248 0.82
249 0.85
250 0.91
251 0.91
252 0.92
253 0.89
254 0.87
255 0.84
256 0.83
257 0.82
258 0.78
259 0.76
260 0.67
261 0.63
262 0.56
263 0.48
264 0.38
265 0.28
266 0.22
267 0.15
268 0.12
269 0.09
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.11