Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DME4

Protein Details
Accession C5DME4    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-37MPPKKKQQQPVKKKDNVDKTFGMKNKNRSTKVQKFIQHydrophilic
40-66QTQVDPKKEEMKRKKQEEKLLRERQEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-55KRKKQ
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032378  ZC3H15/TMA46_C  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0034641  P:cellular nitrogen compound metabolic process  
KEGG lth:KLTH0G08162g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16543  DFRP_C  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPPKKKQQQPVKKKDNVDKTFGMKNKNRSTKVQKFIQQVQTQVDPKKEEMKRKKQEEKLLRERQEAERRALFNPAMDQSVKSGVDPKTVLCAMFKIGNCNKGARCKFSHDPNVGRRVEKKDLYQDARAEKEADTMDQWDEEKLRSVILSKHGNLRTTTDKVCKFFIEAVENGKYGWFWVCPNGGDKCMYRHSLPEGFVLKTKEQKRLEKEALDSQPKITLEEFIETERDKLDKSKLTPITVANFAKWKQDHITQKINAEKRDEAKRKPTGREVVLKKFTEDKKFAEVDDMDATKGSAWDLSEFTRALKDAEANTGDGIKDYGDGSNPTFDLVNKTTTTASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.89
3 0.83
4 0.79
5 0.73
6 0.67
7 0.67
8 0.63
9 0.63
10 0.58
11 0.63
12 0.67
13 0.72
14 0.71
15 0.72
16 0.79
17 0.79
18 0.8
19 0.79
20 0.76
21 0.74
22 0.78
23 0.78
24 0.71
25 0.64
26 0.6
27 0.59
28 0.57
29 0.53
30 0.49
31 0.42
32 0.41
33 0.48
34 0.49
35 0.53
36 0.58
37 0.65
38 0.71
39 0.78
40 0.86
41 0.84
42 0.89
43 0.88
44 0.88
45 0.88
46 0.87
47 0.82
48 0.76
49 0.73
50 0.71
51 0.71
52 0.65
53 0.59
54 0.55
55 0.53
56 0.49
57 0.49
58 0.39
59 0.3
60 0.3
61 0.25
62 0.22
63 0.2
64 0.19
65 0.16
66 0.2
67 0.19
68 0.16
69 0.21
70 0.19
71 0.22
72 0.22
73 0.21
74 0.22
75 0.22
76 0.22
77 0.16
78 0.16
79 0.14
80 0.19
81 0.19
82 0.22
83 0.25
84 0.29
85 0.29
86 0.33
87 0.34
88 0.39
89 0.42
90 0.39
91 0.39
92 0.43
93 0.47
94 0.52
95 0.58
96 0.54
97 0.59
98 0.59
99 0.64
100 0.59
101 0.55
102 0.52
103 0.5
104 0.5
105 0.46
106 0.43
107 0.43
108 0.49
109 0.51
110 0.49
111 0.46
112 0.44
113 0.43
114 0.4
115 0.33
116 0.25
117 0.24
118 0.2
119 0.17
120 0.13
121 0.13
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.09
126 0.1
127 0.09
128 0.11
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.12
134 0.17
135 0.21
136 0.19
137 0.27
138 0.29
139 0.31
140 0.3
141 0.31
142 0.3
143 0.29
144 0.31
145 0.3
146 0.31
147 0.31
148 0.31
149 0.28
150 0.24
151 0.23
152 0.22
153 0.18
154 0.16
155 0.18
156 0.17
157 0.17
158 0.15
159 0.14
160 0.11
161 0.09
162 0.09
163 0.06
164 0.05
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.15
172 0.15
173 0.16
174 0.19
175 0.2
176 0.18
177 0.19
178 0.22
179 0.24
180 0.24
181 0.25
182 0.24
183 0.22
184 0.25
185 0.26
186 0.23
187 0.28
188 0.3
189 0.35
190 0.39
191 0.46
192 0.49
193 0.55
194 0.58
195 0.53
196 0.52
197 0.52
198 0.52
199 0.49
200 0.43
201 0.35
202 0.34
203 0.32
204 0.3
205 0.22
206 0.18
207 0.14
208 0.16
209 0.16
210 0.13
211 0.15
212 0.13
213 0.14
214 0.12
215 0.12
216 0.11
217 0.13
218 0.18
219 0.21
220 0.24
221 0.33
222 0.35
223 0.36
224 0.38
225 0.37
226 0.35
227 0.36
228 0.34
229 0.26
230 0.27
231 0.26
232 0.31
233 0.29
234 0.29
235 0.26
236 0.33
237 0.41
238 0.43
239 0.51
240 0.47
241 0.53
242 0.58
243 0.59
244 0.54
245 0.5
246 0.48
247 0.45
248 0.53
249 0.54
250 0.53
251 0.57
252 0.64
253 0.66
254 0.68
255 0.7
256 0.67
257 0.66
258 0.7
259 0.67
260 0.68
261 0.68
262 0.63
263 0.56
264 0.57
265 0.57
266 0.56
267 0.53
268 0.46
269 0.45
270 0.46
271 0.44
272 0.41
273 0.35
274 0.3
275 0.31
276 0.28
277 0.21
278 0.2
279 0.2
280 0.14
281 0.14
282 0.11
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.11
287 0.13
288 0.15
289 0.15
290 0.16
291 0.17
292 0.17
293 0.16
294 0.16
295 0.18
296 0.17
297 0.23
298 0.23
299 0.22
300 0.22
301 0.22
302 0.2
303 0.17
304 0.15
305 0.1
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.11
310 0.13
311 0.15
312 0.18
313 0.17
314 0.18
315 0.18
316 0.17
317 0.22
318 0.22
319 0.25
320 0.22
321 0.24