Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DJP2

Protein Details
Accession C5DJP2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
219-240LSKPGDKGKVTKKRKNVFKSPRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
223-240GDKGKVTKKRKNVFKSPR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019447  DNA/RNA-bd_Kin17_WH-like_dom  
IPR037321  KIN17-like  
IPR038254  KIN17_WH-like_sf  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG lth:KLTH0F18018g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10357  Kin17_mid  
PF12874  zf-met  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MGGAEFGTAKYLSKKLKAKGLQKLRFYCQVCEKQCRDENGFKSHNKSPSHERRIAQLKPQDVDMYTEHFEKDFLRLLRISHGEKKIEANKFYNEFIQDRDHIHMNATRFHSLTKFILHLGKTGKVRLHGLDAGMINDLEVDEGKILISYIDDSYENMMRQDKLRELEKSESSEQDLKIKILKKQMEEGKKEADMLDSEDEGDRQKTTNMLPVGKISLTLSKPGDKGKVTKKRKNVFKSPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.44
3 0.54
4 0.61
5 0.66
6 0.7
7 0.76
8 0.76
9 0.78
10 0.78
11 0.74
12 0.74
13 0.68
14 0.63
15 0.62
16 0.64
17 0.61
18 0.65
19 0.62
20 0.62
21 0.65
22 0.66
23 0.63
24 0.62
25 0.61
26 0.6
27 0.63
28 0.57
29 0.58
30 0.58
31 0.58
32 0.52
33 0.52
34 0.54
35 0.59
36 0.65
37 0.66
38 0.6
39 0.61
40 0.66
41 0.64
42 0.61
43 0.56
44 0.52
45 0.45
46 0.46
47 0.39
48 0.31
49 0.3
50 0.23
51 0.22
52 0.19
53 0.19
54 0.17
55 0.16
56 0.16
57 0.13
58 0.15
59 0.16
60 0.15
61 0.17
62 0.18
63 0.18
64 0.23
65 0.26
66 0.28
67 0.29
68 0.33
69 0.31
70 0.32
71 0.37
72 0.4
73 0.41
74 0.4
75 0.35
76 0.35
77 0.36
78 0.36
79 0.32
80 0.27
81 0.23
82 0.22
83 0.22
84 0.19
85 0.19
86 0.2
87 0.2
88 0.17
89 0.18
90 0.19
91 0.17
92 0.2
93 0.21
94 0.2
95 0.18
96 0.19
97 0.18
98 0.18
99 0.17
100 0.14
101 0.12
102 0.12
103 0.15
104 0.15
105 0.16
106 0.16
107 0.19
108 0.18
109 0.2
110 0.19
111 0.18
112 0.19
113 0.17
114 0.18
115 0.15
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.12
120 0.11
121 0.1
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.04
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.09
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.13
145 0.13
146 0.15
147 0.17
148 0.19
149 0.21
150 0.25
151 0.26
152 0.28
153 0.33
154 0.33
155 0.36
156 0.34
157 0.32
158 0.32
159 0.34
160 0.3
161 0.3
162 0.29
163 0.24
164 0.27
165 0.3
166 0.3
167 0.34
168 0.38
169 0.35
170 0.43
171 0.5
172 0.54
173 0.55
174 0.55
175 0.51
176 0.47
177 0.45
178 0.37
179 0.3
180 0.22
181 0.2
182 0.18
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.15
189 0.12
190 0.11
191 0.12
192 0.14
193 0.15
194 0.22
195 0.24
196 0.25
197 0.25
198 0.26
199 0.28
200 0.25
201 0.25
202 0.19
203 0.22
204 0.21
205 0.25
206 0.26
207 0.28
208 0.3
209 0.34
210 0.38
211 0.35
212 0.43
213 0.49
214 0.57
215 0.63
216 0.69
217 0.75
218 0.8
219 0.87
220 0.88