Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DHJ1

Protein Details
Accession C5DHJ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-126VPYSPRARAERRKEKRKVPAPQAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-120RARAERRKEKRKV
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10, mito 9, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034244  Rrt5_RRM1  
IPR034247  Rrt5_RRM2  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG lth:KLTH0E04730g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12409  RRM1_RRT5  
cd12410  RRM2_RRT5  
Amino Acid Sequences MSPTQPNPAAALSGSAEPQTKRIYISNLDFSTTEEELEQFLQEFRVVSVLIPSQTVRGFRNSTVRPLGIGYADFASAADALQAVENLNGKQLRERTLKIKMYVPYSPRARAERRKEKRKVPAPQAEENPDAAPQDAQQPQPPAPAEEPTSKDTVYCAYLPSKVTDVELREFFADYQPQDIYVYRTNGSRRKVYFHRRFTAALVTLGGEAELANAIETLGTRRLMGKKITLRPARLSKVEEVQHAAARKLELEQIQQQTRQIAEHAMAMEEHRQQEAEIPAAETPDDVAATA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.17
4 0.16
5 0.2
6 0.22
7 0.21
8 0.22
9 0.25
10 0.29
11 0.32
12 0.37
13 0.42
14 0.39
15 0.4
16 0.37
17 0.36
18 0.36
19 0.29
20 0.24
21 0.16
22 0.15
23 0.15
24 0.15
25 0.14
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.1
36 0.12
37 0.11
38 0.12
39 0.12
40 0.13
41 0.15
42 0.18
43 0.17
44 0.21
45 0.23
46 0.25
47 0.34
48 0.33
49 0.37
50 0.39
51 0.37
52 0.32
53 0.3
54 0.29
55 0.2
56 0.18
57 0.14
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.05
70 0.04
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.11
75 0.12
76 0.12
77 0.17
78 0.19
79 0.25
80 0.28
81 0.31
82 0.33
83 0.41
84 0.45
85 0.42
86 0.45
87 0.41
88 0.41
89 0.43
90 0.4
91 0.39
92 0.38
93 0.39
94 0.38
95 0.41
96 0.45
97 0.49
98 0.58
99 0.61
100 0.68
101 0.76
102 0.79
103 0.82
104 0.84
105 0.84
106 0.83
107 0.81
108 0.8
109 0.75
110 0.73
111 0.68
112 0.62
113 0.53
114 0.45
115 0.35
116 0.27
117 0.21
118 0.15
119 0.12
120 0.08
121 0.12
122 0.14
123 0.14
124 0.16
125 0.18
126 0.18
127 0.21
128 0.21
129 0.17
130 0.15
131 0.16
132 0.17
133 0.18
134 0.2
135 0.19
136 0.2
137 0.18
138 0.17
139 0.16
140 0.15
141 0.13
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.12
146 0.13
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.14
152 0.15
153 0.16
154 0.15
155 0.15
156 0.14
157 0.15
158 0.14
159 0.13
160 0.13
161 0.1
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.12
167 0.14
168 0.15
169 0.17
170 0.16
171 0.19
172 0.25
173 0.29
174 0.33
175 0.36
176 0.34
177 0.39
178 0.47
179 0.55
180 0.6
181 0.62
182 0.64
183 0.6
184 0.6
185 0.55
186 0.51
187 0.42
188 0.32
189 0.24
190 0.19
191 0.16
192 0.14
193 0.12
194 0.06
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.06
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.13
209 0.17
210 0.21
211 0.24
212 0.3
213 0.36
214 0.43
215 0.53
216 0.54
217 0.55
218 0.59
219 0.65
220 0.63
221 0.58
222 0.54
223 0.48
224 0.5
225 0.49
226 0.43
227 0.4
228 0.36
229 0.36
230 0.34
231 0.31
232 0.25
233 0.22
234 0.21
235 0.18
236 0.2
237 0.18
238 0.21
239 0.28
240 0.34
241 0.37
242 0.38
243 0.38
244 0.37
245 0.35
246 0.31
247 0.25
248 0.2
249 0.17
250 0.18
251 0.16
252 0.14
253 0.14
254 0.14
255 0.17
256 0.2
257 0.2
258 0.18
259 0.18
260 0.17
261 0.23
262 0.24
263 0.23
264 0.2
265 0.2
266 0.19
267 0.2
268 0.2
269 0.14
270 0.12
271 0.1