Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DEN5

Protein Details
Accession C5DEN5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-32QENLRAKRPKKEEQEQIFDEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG lth:KLTH0C10714g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MARSPKRQDPNAQENLRAKRPKKEEQEQIFDEEEPAFEIGGGNTNESASPENTDFSTNMPTPFDNIVEDPVGGASLPESASPTTNLAQTTNSNSQSVKDVDDKKRGRPSGSQTQNTKVNSTGPKKSVMTQSSASAHHPNTQQAQSQNQQAASSKMQTDPDKLSDALFSAGVDIREEEALLNSSMNITKSSAQAGSQAVNNQIPPQPPLLHPTHVASFMKKVGSEQNFNQDFSKAHDVLSLMSTACEVFMTDIITNSLVISRHRRRSIKLNSGRRSEVSRALRDLAIHQKEQEERRVKRRIAMGLEKETAEAKMETEETLHRASNATANMMIAGGKKKYSWLNAGAKANNNSVKVLGKVSSDVAARGEMGIRYREAREEPGIVMRDLLNALENRRVGVNTVVAKGYARIRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.73
3 0.72
4 0.72
5 0.66
6 0.65
7 0.71
8 0.74
9 0.76
10 0.78
11 0.79
12 0.79
13 0.84
14 0.76
15 0.73
16 0.64
17 0.54
18 0.45
19 0.35
20 0.26
21 0.18
22 0.16
23 0.11
24 0.09
25 0.09
26 0.08
27 0.14
28 0.14
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.17
35 0.12
36 0.15
37 0.15
38 0.17
39 0.17
40 0.19
41 0.18
42 0.17
43 0.23
44 0.2
45 0.21
46 0.22
47 0.21
48 0.22
49 0.24
50 0.23
51 0.18
52 0.17
53 0.18
54 0.17
55 0.16
56 0.13
57 0.11
58 0.1
59 0.08
60 0.07
61 0.04
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.07
66 0.08
67 0.09
68 0.11
69 0.13
70 0.14
71 0.16
72 0.16
73 0.15
74 0.17
75 0.18
76 0.24
77 0.27
78 0.28
79 0.27
80 0.26
81 0.27
82 0.29
83 0.28
84 0.24
85 0.26
86 0.33
87 0.39
88 0.49
89 0.51
90 0.53
91 0.61
92 0.61
93 0.57
94 0.55
95 0.57
96 0.58
97 0.64
98 0.64
99 0.59
100 0.62
101 0.64
102 0.58
103 0.51
104 0.41
105 0.39
106 0.4
107 0.42
108 0.43
109 0.38
110 0.42
111 0.41
112 0.45
113 0.46
114 0.4
115 0.38
116 0.33
117 0.35
118 0.33
119 0.33
120 0.31
121 0.27
122 0.26
123 0.27
124 0.28
125 0.27
126 0.29
127 0.3
128 0.31
129 0.29
130 0.34
131 0.32
132 0.34
133 0.33
134 0.29
135 0.28
136 0.25
137 0.26
138 0.22
139 0.21
140 0.18
141 0.17
142 0.21
143 0.22
144 0.24
145 0.23
146 0.24
147 0.24
148 0.23
149 0.21
150 0.17
151 0.16
152 0.13
153 0.1
154 0.08
155 0.07
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.09
175 0.09
176 0.11
177 0.11
178 0.1
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.13
189 0.13
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.19
195 0.2
196 0.19
197 0.19
198 0.19
199 0.18
200 0.2
201 0.2
202 0.16
203 0.15
204 0.15
205 0.15
206 0.13
207 0.13
208 0.18
209 0.21
210 0.23
211 0.23
212 0.31
213 0.32
214 0.33
215 0.32
216 0.26
217 0.23
218 0.24
219 0.29
220 0.19
221 0.18
222 0.19
223 0.18
224 0.18
225 0.18
226 0.14
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.08
244 0.07
245 0.1
246 0.19
247 0.26
248 0.34
249 0.42
250 0.45
251 0.47
252 0.57
253 0.65
254 0.66
255 0.69
256 0.71
257 0.7
258 0.72
259 0.71
260 0.62
261 0.57
262 0.5
263 0.48
264 0.44
265 0.4
266 0.38
267 0.37
268 0.36
269 0.31
270 0.33
271 0.33
272 0.31
273 0.28
274 0.27
275 0.29
276 0.34
277 0.37
278 0.42
279 0.42
280 0.44
281 0.52
282 0.6
283 0.58
284 0.57
285 0.6
286 0.57
287 0.55
288 0.58
289 0.56
290 0.52
291 0.52
292 0.47
293 0.41
294 0.35
295 0.28
296 0.21
297 0.15
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.1
302 0.11
303 0.12
304 0.13
305 0.15
306 0.15
307 0.14
308 0.14
309 0.15
310 0.18
311 0.17
312 0.16
313 0.14
314 0.14
315 0.13
316 0.12
317 0.12
318 0.1
319 0.13
320 0.13
321 0.13
322 0.13
323 0.17
324 0.22
325 0.26
326 0.29
327 0.35
328 0.42
329 0.48
330 0.54
331 0.54
332 0.55
333 0.54
334 0.55
335 0.5
336 0.43
337 0.37
338 0.32
339 0.3
340 0.26
341 0.25
342 0.21
343 0.18
344 0.18
345 0.19
346 0.2
347 0.18
348 0.17
349 0.16
350 0.15
351 0.14
352 0.13
353 0.14
354 0.12
355 0.14
356 0.16
357 0.17
358 0.19
359 0.2
360 0.24
361 0.25
362 0.29
363 0.3
364 0.3
365 0.29
366 0.33
367 0.34
368 0.29
369 0.28
370 0.23
371 0.21
372 0.19
373 0.18
374 0.16
375 0.16
376 0.18
377 0.22
378 0.22
379 0.22
380 0.23
381 0.23
382 0.21
383 0.22
384 0.26
385 0.24
386 0.26
387 0.26
388 0.24
389 0.24
390 0.26