Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DMZ3

Protein Details
Accession C5DMZ3    Localization Confidence Low Confidence Score 7.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-180NPTTCRFHVQRKKFNRETRQGEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 12.5, mito_nucl 12, nucl 10.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR034922  REX1-like_exo  
IPR047021  REXO1/3/4-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0004527  F:exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG lth:KLTH0G12870g  -  
CDD cd06145  REX1_like  
Amino Acid Sequences MAVLRPVDLKTQPAPYQSRYMVLQKVLKTLEKFHAASPELGKKAVEVEASVAKKSASSQSYRFNASVVLRDILKSKGKLDCLEPSSKKKGVIASAAKLTKSQAMETLQAVLVDQATLVANGYNTGAPEKTEQMSDTDVQGVYTTCIRCNTKFRKDQIMNPTTCRFHVQRKKFNRETRQGEYACCGETTNSSSFLALGCKTLFHHVFRPETFSEMERISPFRNTCKVQGKANVLALDCEMAFTSCGYELIRLTIVDFFTSKVLYDEIVRPFGEVIDLNSEFSGVHVIKEETSVSFDEMLEKILHESLINKNSILIGHGLENDLNVMRLIHDKIIDTAILYPRGHYKSSLKDLAFEVVSRRIQTGEHDSSEDAIATMSVLKSKLGIPLAQDVWE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.43
3 0.5
4 0.46
5 0.45
6 0.42
7 0.45
8 0.42
9 0.43
10 0.45
11 0.39
12 0.44
13 0.44
14 0.45
15 0.41
16 0.42
17 0.42
18 0.43
19 0.42
20 0.39
21 0.43
22 0.4
23 0.41
24 0.42
25 0.43
26 0.38
27 0.37
28 0.35
29 0.27
30 0.28
31 0.26
32 0.2
33 0.13
34 0.15
35 0.21
36 0.22
37 0.22
38 0.2
39 0.18
40 0.18
41 0.2
42 0.24
43 0.22
44 0.26
45 0.3
46 0.39
47 0.42
48 0.46
49 0.43
50 0.36
51 0.36
52 0.33
53 0.33
54 0.27
55 0.25
56 0.21
57 0.22
58 0.24
59 0.25
60 0.29
61 0.25
62 0.26
63 0.3
64 0.33
65 0.34
66 0.36
67 0.39
68 0.38
69 0.46
70 0.46
71 0.48
72 0.52
73 0.53
74 0.5
75 0.45
76 0.45
77 0.39
78 0.43
79 0.41
80 0.37
81 0.41
82 0.42
83 0.39
84 0.35
85 0.32
86 0.28
87 0.25
88 0.21
89 0.19
90 0.19
91 0.21
92 0.21
93 0.22
94 0.17
95 0.16
96 0.15
97 0.11
98 0.09
99 0.06
100 0.06
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.1
115 0.12
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.16
121 0.15
122 0.14
123 0.14
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.1
128 0.09
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.15
133 0.18
134 0.21
135 0.3
136 0.38
137 0.44
138 0.51
139 0.54
140 0.61
141 0.61
142 0.66
143 0.67
144 0.66
145 0.58
146 0.54
147 0.54
148 0.44
149 0.42
150 0.39
151 0.31
152 0.33
153 0.42
154 0.47
155 0.53
156 0.62
157 0.72
158 0.76
159 0.83
160 0.82
161 0.81
162 0.79
163 0.74
164 0.72
165 0.63
166 0.55
167 0.48
168 0.39
169 0.3
170 0.22
171 0.17
172 0.09
173 0.1
174 0.13
175 0.11
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.12
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.12
188 0.14
189 0.14
190 0.19
191 0.21
192 0.24
193 0.24
194 0.28
195 0.24
196 0.25
197 0.24
198 0.2
199 0.18
200 0.16
201 0.17
202 0.13
203 0.15
204 0.14
205 0.17
206 0.17
207 0.19
208 0.24
209 0.25
210 0.31
211 0.38
212 0.39
213 0.4
214 0.45
215 0.45
216 0.43
217 0.43
218 0.38
219 0.29
220 0.27
221 0.22
222 0.17
223 0.12
224 0.09
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.08
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.1
251 0.14
252 0.15
253 0.17
254 0.17
255 0.17
256 0.16
257 0.16
258 0.14
259 0.1
260 0.09
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.11
267 0.11
268 0.14
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.13
276 0.09
277 0.11
278 0.12
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.13
283 0.12
284 0.13
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.1
289 0.11
290 0.08
291 0.11
292 0.16
293 0.21
294 0.21
295 0.2
296 0.2
297 0.2
298 0.2
299 0.19
300 0.13
301 0.09
302 0.1
303 0.11
304 0.12
305 0.11
306 0.1
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.11
314 0.12
315 0.13
316 0.14
317 0.14
318 0.16
319 0.17
320 0.16
321 0.13
322 0.16
323 0.18
324 0.22
325 0.21
326 0.21
327 0.27
328 0.31
329 0.31
330 0.31
331 0.34
332 0.38
333 0.46
334 0.53
335 0.45
336 0.45
337 0.45
338 0.45
339 0.39
340 0.31
341 0.26
342 0.25
343 0.27
344 0.25
345 0.25
346 0.21
347 0.21
348 0.26
349 0.32
350 0.31
351 0.31
352 0.32
353 0.31
354 0.32
355 0.32
356 0.26
357 0.17
358 0.11
359 0.09
360 0.08
361 0.09
362 0.08
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.12
367 0.13
368 0.18
369 0.19
370 0.2
371 0.21
372 0.27