Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DM89

Protein Details
Accession C5DM89    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-66AGSTPVSTPSKKKKRAKKPATSVKVQEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-59SKKKKRAKKPAT
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 4, pero 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
KEGG lth:KLTH0G06886g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MAKSTPVKKRGGSKSTTPVSTPPVKTKKESRSGTPASTAGSTPVSTPSKKKKRAKKPATSVKVQEAAKPKEPETVVPKDRINKAVQELSKFTSKKQEDSTQLLDDDDELDKQVELIAVNTGSFTGNRKVFKPKQFKIEHSIFKPWKKASETSVKDFKTLLILRDQDAVKVSEDEIYDQLRDSGITIDTVIPGADLKTKYKSFEKRRAFIQDFSLILADDSVVTTLPKLLGGKAYEKVSTTPVPIRTNKKGVFSLTILSNSIKKVFEHSLPAKMPRGTTLSVHLGNLNWFTADELTQNILTVVEQLVKEFQVRSVFLKSNKSPVLPLYYNQAVLDDLAKQTKEDSKDTATRKVTIDGTELELSAFEAALMEIANPDELDKVFAGRINRAKKRAAESEEESAPDSKKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.71
3 0.68
4 0.59
5 0.53
6 0.52
7 0.55
8 0.52
9 0.52
10 0.55
11 0.57
12 0.62
13 0.68
14 0.71
15 0.72
16 0.73
17 0.7
18 0.7
19 0.71
20 0.68
21 0.62
22 0.53
23 0.45
24 0.41
25 0.34
26 0.25
27 0.22
28 0.19
29 0.16
30 0.22
31 0.24
32 0.26
33 0.35
34 0.44
35 0.53
36 0.63
37 0.72
38 0.75
39 0.82
40 0.9
41 0.93
42 0.92
43 0.93
44 0.94
45 0.92
46 0.89
47 0.82
48 0.78
49 0.74
50 0.63
51 0.59
52 0.57
53 0.55
54 0.55
55 0.54
56 0.48
57 0.47
58 0.48
59 0.47
60 0.45
61 0.48
62 0.44
63 0.45
64 0.48
65 0.49
66 0.52
67 0.51
68 0.47
69 0.42
70 0.43
71 0.46
72 0.45
73 0.41
74 0.4
75 0.38
76 0.43
77 0.39
78 0.36
79 0.38
80 0.38
81 0.39
82 0.43
83 0.47
84 0.45
85 0.51
86 0.53
87 0.45
88 0.43
89 0.38
90 0.31
91 0.23
92 0.2
93 0.14
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.07
110 0.09
111 0.14
112 0.19
113 0.21
114 0.23
115 0.33
116 0.41
117 0.5
118 0.58
119 0.57
120 0.63
121 0.66
122 0.68
123 0.66
124 0.66
125 0.63
126 0.56
127 0.61
128 0.57
129 0.56
130 0.58
131 0.52
132 0.49
133 0.47
134 0.46
135 0.42
136 0.47
137 0.47
138 0.47
139 0.53
140 0.47
141 0.44
142 0.41
143 0.35
144 0.32
145 0.29
146 0.24
147 0.21
148 0.22
149 0.22
150 0.27
151 0.27
152 0.2
153 0.2
154 0.19
155 0.15
156 0.14
157 0.14
158 0.11
159 0.11
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.08
181 0.08
182 0.1
183 0.14
184 0.16
185 0.18
186 0.26
187 0.35
188 0.4
189 0.5
190 0.55
191 0.54
192 0.57
193 0.63
194 0.59
195 0.51
196 0.46
197 0.38
198 0.32
199 0.29
200 0.25
201 0.16
202 0.13
203 0.11
204 0.07
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.08
217 0.1
218 0.12
219 0.14
220 0.16
221 0.15
222 0.16
223 0.16
224 0.17
225 0.17
226 0.17
227 0.19
228 0.23
229 0.27
230 0.32
231 0.38
232 0.4
233 0.47
234 0.47
235 0.47
236 0.44
237 0.41
238 0.38
239 0.32
240 0.29
241 0.22
242 0.21
243 0.18
244 0.17
245 0.17
246 0.14
247 0.16
248 0.14
249 0.13
250 0.17
251 0.19
252 0.2
253 0.26
254 0.27
255 0.32
256 0.33
257 0.36
258 0.35
259 0.33
260 0.32
261 0.27
262 0.28
263 0.23
264 0.22
265 0.23
266 0.24
267 0.23
268 0.23
269 0.21
270 0.18
271 0.18
272 0.18
273 0.14
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.08
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.11
294 0.12
295 0.11
296 0.14
297 0.14
298 0.16
299 0.18
300 0.23
301 0.27
302 0.3
303 0.38
304 0.37
305 0.41
306 0.43
307 0.41
308 0.37
309 0.35
310 0.39
311 0.32
312 0.31
313 0.3
314 0.29
315 0.29
316 0.27
317 0.25
318 0.17
319 0.16
320 0.16
321 0.11
322 0.11
323 0.13
324 0.14
325 0.13
326 0.16
327 0.22
328 0.25
329 0.26
330 0.28
331 0.32
332 0.4
333 0.44
334 0.5
335 0.47
336 0.46
337 0.45
338 0.45
339 0.41
340 0.35
341 0.34
342 0.27
343 0.28
344 0.25
345 0.24
346 0.19
347 0.16
348 0.15
349 0.12
350 0.1
351 0.05
352 0.05
353 0.04
354 0.05
355 0.05
356 0.04
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.08
363 0.08
364 0.1
365 0.1
366 0.11
367 0.12
368 0.15
369 0.17
370 0.24
371 0.32
372 0.4
373 0.48
374 0.52
375 0.57
376 0.61
377 0.67
378 0.68
379 0.66
380 0.63
381 0.6
382 0.62
383 0.57
384 0.52
385 0.46
386 0.4
387 0.35
388 0.33