Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DL89

Protein Details
Accession C5DL89    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-95GAISKSAIRRRKRKLRDQLKPKMEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-87SAIRRRKRKLRD
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG lth:KLTH0F10934g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MVAKKRSQLRAKAALRLGRSKDEDDSEPTSIDLPEDPKAFLHLPRESKKDKMMSKSQSFLSKLHENTSINGAISKSAIRRRKRKLRDQLKPKMEDLLVSLEKDGVTEALEIPGSEEEGSTRDSTERKTTRITRPPPTPSTGSVIMRKNQPSIRNQRGAKQLAQKESDRFQSVLQNKQFQQDPFAALKEVIKMQKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.62
3 0.62
4 0.57
5 0.53
6 0.53
7 0.48
8 0.45
9 0.44
10 0.42
11 0.39
12 0.4
13 0.34
14 0.3
15 0.27
16 0.25
17 0.2
18 0.18
19 0.14
20 0.13
21 0.15
22 0.16
23 0.16
24 0.15
25 0.19
26 0.2
27 0.21
28 0.24
29 0.27
30 0.34
31 0.39
32 0.45
33 0.45
34 0.47
35 0.51
36 0.53
37 0.53
38 0.52
39 0.56
40 0.58
41 0.59
42 0.58
43 0.55
44 0.53
45 0.49
46 0.43
47 0.4
48 0.37
49 0.34
50 0.33
51 0.35
52 0.3
53 0.29
54 0.31
55 0.25
56 0.18
57 0.19
58 0.16
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.12
63 0.2
64 0.28
65 0.35
66 0.44
67 0.54
68 0.64
69 0.72
70 0.79
71 0.82
72 0.85
73 0.87
74 0.88
75 0.88
76 0.86
77 0.79
78 0.69
79 0.61
80 0.5
81 0.4
82 0.3
83 0.25
84 0.18
85 0.15
86 0.14
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.04
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.09
109 0.1
110 0.13
111 0.22
112 0.24
113 0.24
114 0.31
115 0.38
116 0.46
117 0.55
118 0.59
119 0.58
120 0.63
121 0.68
122 0.64
123 0.62
124 0.55
125 0.47
126 0.46
127 0.42
128 0.38
129 0.37
130 0.38
131 0.37
132 0.4
133 0.4
134 0.41
135 0.41
136 0.43
137 0.47
138 0.53
139 0.58
140 0.61
141 0.6
142 0.62
143 0.66
144 0.64
145 0.61
146 0.6
147 0.58
148 0.55
149 0.58
150 0.55
151 0.51
152 0.51
153 0.51
154 0.44
155 0.39
156 0.34
157 0.39
158 0.41
159 0.46
160 0.47
161 0.49
162 0.47
163 0.52
164 0.55
165 0.46
166 0.46
167 0.39
168 0.38
169 0.33
170 0.33
171 0.29
172 0.24
173 0.25
174 0.24
175 0.27