Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DHZ4

Protein Details
Accession C5DHZ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
317-360IEKREIEKERNLRRLKRESAKVEDRSSRRSRKRRVDDLETTLRLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
323-350EKERNLRRLKRESAKVEDRSSRRSRKRR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11.5, cyto 6, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017393  Sfh1/SNF5  
IPR006939  SNF5  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
KEGG lth:KLTH0E08426g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MSQQLLPQAFLTNFHNRIRNENVPFFITAQPSRGHKRAKVVNYAEFETDLLEEFVEDDAKDLNGKEEENGKPMVSAEDLANENALPDLDSQDDPTNILKYPRIRETFLQSRIATPYKVSIAPQDVAQPMPIIIPIRLNVEHNGHKIIDFFTWNLNDHSLTPEQFAAIYCQDLDFPVTSVVHSQISSSISEQLQEYSTLASVTVPDLHVIINLTCNLDSKMYEDNFEWDLNDQNLTPEQFANSVVQDLGLTREFAPAIAHALHESLLRVKKDWLEGHISPDQVANGAAFGYLSGIRLDVDALGVSWCPKVEVLSQWEIEKREIEKERNLRRLKRESAKVEDRSSRRSRKRRVDDLETTLRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.43
3 0.4
4 0.47
5 0.52
6 0.56
7 0.55
8 0.55
9 0.53
10 0.48
11 0.48
12 0.44
13 0.4
14 0.36
15 0.3
16 0.28
17 0.3
18 0.33
19 0.39
20 0.44
21 0.47
22 0.46
23 0.54
24 0.61
25 0.63
26 0.67
27 0.65
28 0.65
29 0.62
30 0.6
31 0.52
32 0.43
33 0.36
34 0.27
35 0.21
36 0.15
37 0.11
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.09
48 0.08
49 0.11
50 0.12
51 0.12
52 0.14
53 0.2
54 0.21
55 0.23
56 0.24
57 0.21
58 0.2
59 0.2
60 0.19
61 0.13
62 0.13
63 0.1
64 0.12
65 0.14
66 0.13
67 0.13
68 0.11
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.06
73 0.05
74 0.07
75 0.09
76 0.09
77 0.12
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.15
82 0.16
83 0.14
84 0.16
85 0.18
86 0.22
87 0.27
88 0.34
89 0.36
90 0.37
91 0.39
92 0.46
93 0.5
94 0.49
95 0.49
96 0.41
97 0.4
98 0.41
99 0.41
100 0.32
101 0.24
102 0.23
103 0.19
104 0.2
105 0.18
106 0.17
107 0.19
108 0.19
109 0.19
110 0.19
111 0.18
112 0.17
113 0.17
114 0.13
115 0.1
116 0.09
117 0.1
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.11
123 0.12
124 0.13
125 0.14
126 0.18
127 0.21
128 0.21
129 0.22
130 0.19
131 0.19
132 0.18
133 0.17
134 0.14
135 0.11
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.13
142 0.13
143 0.12
144 0.15
145 0.14
146 0.13
147 0.12
148 0.12
149 0.11
150 0.11
151 0.1
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.07
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.11
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.06
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.15
207 0.14
208 0.15
209 0.15
210 0.17
211 0.18
212 0.18
213 0.16
214 0.11
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.1
219 0.09
220 0.11
221 0.12
222 0.12
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.08
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.08
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.08
250 0.09
251 0.13
252 0.17
253 0.18
254 0.19
255 0.21
256 0.24
257 0.3
258 0.31
259 0.29
260 0.31
261 0.31
262 0.36
263 0.36
264 0.34
265 0.28
266 0.26
267 0.23
268 0.16
269 0.15
270 0.09
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.1
296 0.12
297 0.18
298 0.23
299 0.27
300 0.29
301 0.3
302 0.34
303 0.34
304 0.33
305 0.31
306 0.27
307 0.32
308 0.38
309 0.4
310 0.46
311 0.54
312 0.63
313 0.68
314 0.75
315 0.75
316 0.77
317 0.81
318 0.82
319 0.82
320 0.82
321 0.8
322 0.8
323 0.82
324 0.79
325 0.77
326 0.76
327 0.71
328 0.71
329 0.73
330 0.74
331 0.76
332 0.79
333 0.83
334 0.84
335 0.9
336 0.92
337 0.91
338 0.89
339 0.87
340 0.85