Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DHD8

Protein Details
Accession C5DHD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-113AQKPVQVLTKSQRKKNKKNKKSKQKPKPAADLSETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-106KSQRKKNKKNKKSKQKPKP
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006994  TCF25/Rqc1  
KEGG lth:KLTH0E03564g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04910  Tcf25  
Amino Acid Sequences MSSRALRRLEENDLEKTLAKLAPSTQKQEPSAKTSSVKAPKQINLFALMGQDEGDDSEDSEASNAEDRPIPASINDKPAQKPVQVLTKSQRKKNKKNKKSKQKPKPAADLSETENGNGESDEELDRMILQFQKKDLEQRRSVDPGLTASDESDYDTAFEDEDASHLKGPADVKTDPGFTNFTSFSEIIKIFGDIDMKNLNPDNEYKLLFGDLSPESLADVDSMTSTHVSPQVMKQIERLKHMVRNWGGRDHKTVPNGSTTRRLAFTKIREDWIPTPRGEYTITQLSQDEVVEWQSWLRSQDWMDEVRKTAHKWKDAGMNFYKFEPSNTETNRKAMTEFYMSVVLHPDHEALIHLISSKFPYHVPALLQVALILVRQGDKANSNGLVERALFVFDRALRSHISFNGLSCQLPYIYFFNRQFYFAIFRYVQILSQRGVVSTASEWCKVLWSLSPLEDPLGCRYFIDHYLLLNKEYSYMANLASSPLVNTYMQWYTLGLSLGFVLSFLKLDMVEKAKTELRKAFTYHAASLSTIFKEVALGDANLLNGLDFPEPCSEIELESKAYLIRMKAIWGGVEIKFLHDEILNILSEYKAGKIQLECTAPIETQNELFLGDIPINLLRFAVLSQESPLMACIPQEIWSERDVYEFDVLPPLPHDRESEDLVETVKTFVSESDLSMSQMEVMQDENMLNQIRQLSLEQFLQENPNADLGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.39
3 0.35
4 0.32
5 0.25
6 0.21
7 0.19
8 0.23
9 0.32
10 0.36
11 0.42
12 0.43
13 0.49
14 0.53
15 0.6
16 0.59
17 0.55
18 0.54
19 0.53
20 0.49
21 0.47
22 0.52
23 0.53
24 0.53
25 0.54
26 0.57
27 0.58
28 0.62
29 0.61
30 0.53
31 0.48
32 0.44
33 0.37
34 0.31
35 0.26
36 0.19
37 0.15
38 0.13
39 0.09
40 0.08
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.12
51 0.11
52 0.12
53 0.15
54 0.16
55 0.18
56 0.19
57 0.19
58 0.17
59 0.22
60 0.24
61 0.29
62 0.33
63 0.35
64 0.36
65 0.44
66 0.46
67 0.42
68 0.43
69 0.39
70 0.45
71 0.42
72 0.46
73 0.48
74 0.55
75 0.61
76 0.65
77 0.71
78 0.72
79 0.81
80 0.86
81 0.88
82 0.89
83 0.92
84 0.95
85 0.96
86 0.97
87 0.97
88 0.97
89 0.97
90 0.96
91 0.94
92 0.93
93 0.88
94 0.83
95 0.76
96 0.68
97 0.61
98 0.57
99 0.48
100 0.37
101 0.32
102 0.25
103 0.21
104 0.18
105 0.14
106 0.08
107 0.1
108 0.11
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.09
113 0.08
114 0.1
115 0.13
116 0.15
117 0.17
118 0.19
119 0.24
120 0.25
121 0.35
122 0.41
123 0.46
124 0.5
125 0.51
126 0.55
127 0.55
128 0.54
129 0.46
130 0.38
131 0.31
132 0.27
133 0.25
134 0.19
135 0.15
136 0.15
137 0.13
138 0.14
139 0.12
140 0.09
141 0.08
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.11
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.14
155 0.15
156 0.18
157 0.19
158 0.18
159 0.21
160 0.22
161 0.24
162 0.22
163 0.23
164 0.22
165 0.17
166 0.21
167 0.18
168 0.17
169 0.19
170 0.19
171 0.18
172 0.2
173 0.19
174 0.17
175 0.16
176 0.16
177 0.11
178 0.12
179 0.15
180 0.1
181 0.13
182 0.14
183 0.13
184 0.15
185 0.16
186 0.16
187 0.14
188 0.16
189 0.18
190 0.19
191 0.2
192 0.18
193 0.17
194 0.17
195 0.15
196 0.13
197 0.13
198 0.1
199 0.11
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.05
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.13
218 0.21
219 0.22
220 0.22
221 0.26
222 0.32
223 0.35
224 0.37
225 0.39
226 0.35
227 0.39
228 0.41
229 0.44
230 0.4
231 0.44
232 0.42
233 0.46
234 0.47
235 0.43
236 0.47
237 0.44
238 0.44
239 0.41
240 0.41
241 0.33
242 0.37
243 0.37
244 0.33
245 0.35
246 0.33
247 0.31
248 0.32
249 0.32
250 0.28
251 0.33
252 0.36
253 0.37
254 0.37
255 0.38
256 0.36
257 0.39
258 0.4
259 0.4
260 0.37
261 0.28
262 0.29
263 0.27
264 0.28
265 0.25
266 0.2
267 0.18
268 0.21
269 0.21
270 0.19
271 0.19
272 0.18
273 0.17
274 0.16
275 0.12
276 0.07
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.13
288 0.16
289 0.19
290 0.2
291 0.19
292 0.2
293 0.21
294 0.23
295 0.22
296 0.29
297 0.3
298 0.33
299 0.33
300 0.35
301 0.41
302 0.4
303 0.44
304 0.41
305 0.38
306 0.34
307 0.33
308 0.33
309 0.24
310 0.23
311 0.21
312 0.19
313 0.23
314 0.25
315 0.3
316 0.29
317 0.32
318 0.32
319 0.28
320 0.25
321 0.19
322 0.18
323 0.16
324 0.15
325 0.14
326 0.15
327 0.15
328 0.14
329 0.15
330 0.13
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.11
351 0.12
352 0.13
353 0.13
354 0.12
355 0.1
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.05
360 0.03
361 0.03
362 0.04
363 0.05
364 0.06
365 0.07
366 0.08
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.08
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.08
380 0.08
381 0.1
382 0.1
383 0.12
384 0.12
385 0.14
386 0.15
387 0.14
388 0.17
389 0.15
390 0.15
391 0.17
392 0.17
393 0.15
394 0.13
395 0.13
396 0.1
397 0.1
398 0.11
399 0.1
400 0.12
401 0.18
402 0.19
403 0.23
404 0.23
405 0.25
406 0.23
407 0.22
408 0.25
409 0.19
410 0.23
411 0.18
412 0.18
413 0.2
414 0.19
415 0.19
416 0.16
417 0.18
418 0.13
419 0.16
420 0.16
421 0.13
422 0.14
423 0.12
424 0.11
425 0.1
426 0.14
427 0.13
428 0.14
429 0.14
430 0.13
431 0.14
432 0.13
433 0.13
434 0.11
435 0.12
436 0.13
437 0.14
438 0.14
439 0.13
440 0.14
441 0.14
442 0.13
443 0.15
444 0.15
445 0.13
446 0.13
447 0.14
448 0.15
449 0.16
450 0.19
451 0.15
452 0.14
453 0.19
454 0.2
455 0.2
456 0.18
457 0.16
458 0.14
459 0.14
460 0.13
461 0.1
462 0.1
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.08
469 0.07
470 0.07
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.11
475 0.11
476 0.12
477 0.12
478 0.11
479 0.1
480 0.12
481 0.12
482 0.08
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.06
488 0.05
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.09
496 0.12
497 0.12
498 0.13
499 0.16
500 0.2
501 0.21
502 0.25
503 0.28
504 0.29
505 0.32
506 0.34
507 0.35
508 0.37
509 0.4
510 0.36
511 0.33
512 0.29
513 0.26
514 0.26
515 0.24
516 0.18
517 0.15
518 0.13
519 0.11
520 0.11
521 0.1
522 0.1
523 0.09
524 0.08
525 0.08
526 0.09
527 0.09
528 0.09
529 0.08
530 0.06
531 0.05
532 0.07
533 0.07
534 0.06
535 0.08
536 0.1
537 0.12
538 0.12
539 0.14
540 0.13
541 0.13
542 0.16
543 0.16
544 0.15
545 0.14
546 0.14
547 0.12
548 0.13
549 0.14
550 0.12
551 0.14
552 0.13
553 0.14
554 0.16
555 0.16
556 0.15
557 0.15
558 0.18
559 0.15
560 0.18
561 0.17
562 0.16
563 0.16
564 0.16
565 0.16
566 0.12
567 0.12
568 0.11
569 0.13
570 0.11
571 0.1
572 0.11
573 0.09
574 0.1
575 0.1
576 0.09
577 0.1
578 0.1
579 0.14
580 0.15
581 0.18
582 0.23
583 0.25
584 0.24
585 0.24
586 0.26
587 0.22
588 0.24
589 0.22
590 0.17
591 0.16
592 0.16
593 0.13
594 0.12
595 0.12
596 0.1
597 0.1
598 0.09
599 0.08
600 0.09
601 0.1
602 0.11
603 0.1
604 0.09
605 0.08
606 0.08
607 0.08
608 0.1
609 0.1
610 0.1
611 0.12
612 0.14
613 0.13
614 0.13
615 0.14
616 0.11
617 0.1
618 0.1
619 0.09
620 0.09
621 0.13
622 0.16
623 0.18
624 0.18
625 0.19
626 0.21
627 0.2
628 0.21
629 0.18
630 0.17
631 0.18
632 0.17
633 0.17
634 0.2
635 0.2
636 0.18
637 0.2
638 0.22
639 0.21
640 0.22
641 0.23
642 0.22
643 0.26
644 0.29
645 0.29
646 0.25
647 0.24
648 0.23
649 0.22
650 0.19
651 0.16
652 0.13
653 0.11
654 0.1
655 0.09
656 0.14
657 0.13
658 0.14
659 0.18
660 0.18
661 0.19
662 0.19
663 0.18
664 0.14
665 0.15
666 0.14
667 0.1
668 0.1
669 0.1
670 0.1
671 0.1
672 0.1
673 0.12
674 0.14
675 0.13
676 0.14
677 0.16
678 0.15
679 0.17
680 0.19
681 0.18
682 0.2
683 0.22
684 0.21
685 0.21
686 0.22
687 0.26
688 0.25
689 0.25
690 0.23