Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DDW7

Protein Details
Accession C5DDW7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
441-463VNILPIKRKSSPRDKNPSEQITSHydrophilic
481-501PSDSHDETKPTKRRVKPTLLLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024977  Apc4-like_WD40_dom  
IPR045145  PTHR15271  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006335  P:DNA replication-dependent chromatin assembly  
KEGG lth:KLTH0C04378g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12894  ANAPC4_WD40  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MEASNLQIYWHESQPIYSLCFQSTGPPKARRLVTAGGDNKIRVWQLNFEERNAFRVDSIDFLSSLTQHEQAVNVVRFNSTDDILATAGDDGQLLLWKKNDSMAKEFGVDEEEFADFKESWHVWKRLRPATTGGASEIYDLCWSPDDNYIVTGSMDNSVRVFDVNEGSCVASAVDHNHYVQGVAWDPQNEFILSQSADRSVHLHKLVRDAGGAISGLKFSSKITKGDLPCRKAPNSTELELDNVKSAFLFHNETLPSFFRRLAISPCGNLVCVPAGIFKNCDSQSESGNGNDELANAVYLFTRAYLEKHNNRPSLVIPFLKKPALVISFNPHLYQLSKQDHPCVKLPYKLLFAVATSDEVLIYDTETAKPVCIVGNLHYTPITDLSWSKDGAMLMISSTDGFCSYISFKNEMLGNLYDNEVQKGIQTNEAISTAPIKKPSIVNILPIKRKSSPRDKNPSEQITSAQVESKVQVQQVSNISKPSDSHDETKPTKRRVKPTLLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.28
4 0.28
5 0.27
6 0.24
7 0.25
8 0.25
9 0.29
10 0.35
11 0.39
12 0.44
13 0.49
14 0.52
15 0.58
16 0.61
17 0.56
18 0.52
19 0.51
20 0.48
21 0.5
22 0.51
23 0.47
24 0.47
25 0.44
26 0.39
27 0.36
28 0.32
29 0.26
30 0.24
31 0.27
32 0.31
33 0.41
34 0.42
35 0.41
36 0.47
37 0.44
38 0.44
39 0.4
40 0.34
41 0.23
42 0.24
43 0.22
44 0.17
45 0.19
46 0.17
47 0.14
48 0.14
49 0.15
50 0.13
51 0.15
52 0.15
53 0.14
54 0.14
55 0.14
56 0.14
57 0.16
58 0.24
59 0.22
60 0.21
61 0.2
62 0.2
63 0.2
64 0.22
65 0.22
66 0.14
67 0.13
68 0.12
69 0.13
70 0.13
71 0.12
72 0.1
73 0.08
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.04
78 0.04
79 0.09
80 0.1
81 0.11
82 0.14
83 0.14
84 0.15
85 0.21
86 0.25
87 0.25
88 0.29
89 0.31
90 0.3
91 0.31
92 0.31
93 0.26
94 0.25
95 0.21
96 0.15
97 0.13
98 0.12
99 0.1
100 0.11
101 0.13
102 0.09
103 0.09
104 0.15
105 0.14
106 0.19
107 0.28
108 0.33
109 0.35
110 0.4
111 0.49
112 0.5
113 0.52
114 0.49
115 0.45
116 0.46
117 0.45
118 0.4
119 0.32
120 0.27
121 0.24
122 0.23
123 0.18
124 0.13
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.13
132 0.14
133 0.14
134 0.15
135 0.15
136 0.14
137 0.14
138 0.12
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.07
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.09
157 0.06
158 0.06
159 0.08
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.1
179 0.09
180 0.1
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.12
186 0.12
187 0.16
188 0.18
189 0.21
190 0.2
191 0.25
192 0.26
193 0.24
194 0.22
195 0.18
196 0.15
197 0.13
198 0.12
199 0.07
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.12
207 0.14
208 0.15
209 0.18
210 0.24
211 0.27
212 0.37
213 0.43
214 0.41
215 0.45
216 0.48
217 0.46
218 0.43
219 0.42
220 0.39
221 0.36
222 0.33
223 0.29
224 0.24
225 0.25
226 0.23
227 0.21
228 0.15
229 0.11
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.1
236 0.09
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.14
241 0.15
242 0.15
243 0.14
244 0.14
245 0.12
246 0.13
247 0.14
248 0.16
249 0.2
250 0.19
251 0.18
252 0.19
253 0.18
254 0.17
255 0.15
256 0.13
257 0.08
258 0.07
259 0.06
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.1
265 0.16
266 0.16
267 0.18
268 0.18
269 0.18
270 0.19
271 0.21
272 0.21
273 0.15
274 0.16
275 0.15
276 0.13
277 0.12
278 0.1
279 0.08
280 0.07
281 0.07
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.05
289 0.06
290 0.08
291 0.14
292 0.22
293 0.3
294 0.39
295 0.47
296 0.47
297 0.47
298 0.47
299 0.43
300 0.4
301 0.36
302 0.31
303 0.25
304 0.27
305 0.29
306 0.28
307 0.26
308 0.21
309 0.22
310 0.22
311 0.21
312 0.19
313 0.22
314 0.25
315 0.26
316 0.26
317 0.21
318 0.19
319 0.19
320 0.2
321 0.22
322 0.23
323 0.28
324 0.29
325 0.37
326 0.4
327 0.42
328 0.44
329 0.43
330 0.42
331 0.42
332 0.44
333 0.39
334 0.39
335 0.36
336 0.32
337 0.25
338 0.22
339 0.19
340 0.16
341 0.13
342 0.1
343 0.1
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.11
361 0.19
362 0.19
363 0.2
364 0.2
365 0.19
366 0.19
367 0.19
368 0.17
369 0.1
370 0.11
371 0.15
372 0.17
373 0.17
374 0.16
375 0.17
376 0.16
377 0.15
378 0.15
379 0.1
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.08
390 0.11
391 0.16
392 0.19
393 0.21
394 0.21
395 0.24
396 0.26
397 0.25
398 0.25
399 0.21
400 0.19
401 0.18
402 0.19
403 0.19
404 0.18
405 0.18
406 0.15
407 0.14
408 0.14
409 0.19
410 0.18
411 0.19
412 0.19
413 0.19
414 0.2
415 0.21
416 0.19
417 0.14
418 0.19
419 0.19
420 0.21
421 0.24
422 0.24
423 0.27
424 0.29
425 0.34
426 0.37
427 0.34
428 0.39
429 0.45
430 0.52
431 0.56
432 0.56
433 0.56
434 0.54
435 0.62
436 0.63
437 0.65
438 0.68
439 0.71
440 0.8
441 0.81
442 0.84
443 0.85
444 0.84
445 0.77
446 0.67
447 0.59
448 0.54
449 0.5
450 0.41
451 0.35
452 0.28
453 0.25
454 0.25
455 0.26
456 0.23
457 0.22
458 0.25
459 0.23
460 0.28
461 0.34
462 0.39
463 0.37
464 0.36
465 0.36
466 0.34
467 0.33
468 0.34
469 0.36
470 0.35
471 0.38
472 0.41
473 0.49
474 0.54
475 0.64
476 0.66
477 0.67
478 0.72
479 0.77
480 0.8
481 0.81