FuNGI

A0A5N5NHZ6

Protein Details

Accession

A0A5N5NHZ6

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
390-409	KANNRGKKNGTERKEPPKPF	Basic
440-468	LIVTRGKGFTKEKNKKKKGSYHGGRIDTF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
343-355	KKEAKAAIKKQKK
394-407	RGKKNGTERKEPPK
446-458	KGFTKEKNKKKKG

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12, cyto 2.5, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MSAPPWLFSNNFPSTTNTSTTPSDPQTASSTMAKADKKASSKATAGSKDKKASKADKSTSSATAVPPPQLMDLVENFLSENSFSDAHKAFKKQRAEKGLPKSGGEKVHHSLVGVFQDWETSLNKPQGSKLKVDKVTAVRSSDSDSDDVDMKDVPEEPSSSDSSSSSSDSDSDSDSDDEQKTRQTAAKAEIAQAAAQVASQAKSTTQKRKAESDSESSSSSESESDSDSSSDSSSEDEKPQAKKQKVVSSSESSSESSSEEESSSSEEESCEEESSSEESSSDELSSDSESDSDSDSDSDVDSEVAAAIAAPLPDSDSDSSSDSDSSSSSDSSDSESDSAKQVKKEAKAAIKKQKKEAASGSDTSATVGKASPEVFPVSTFAPLPPDPTIKANNRGKKNGTERKEPPKPFSRIKEDVVVDPRLSSNAFAGHEWGQKAHEDLIVTRGKGFTKEKNKKKKGSYHGGRIDTFARGGIKFED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.4
3	0.4
4	0.34
5	0.34
6	0.34
7	0.36
8	0.37
9	0.34
10	0.36
11	0.33
12	0.33
13	0.34
14	0.33
15	0.33
16	0.29
17	0.27
18	0.25
19	0.31
20	0.3
21	0.29
22	0.33
23	0.36
24	0.38
25	0.43
26	0.45
27	0.44
28	0.45
29	0.48
30	0.5
31	0.52
32	0.56
33	0.58
34	0.6
35	0.63
36	0.67
37	0.67
38	0.67
39	0.68
40	0.69
41	0.71
42	0.71
43	0.7
44	0.69
45	0.66
46	0.6
47	0.54
48	0.47
49	0.38
50	0.39
51	0.33
52	0.3
53	0.27
54	0.25
55	0.23
56	0.21
57	0.2
58	0.15
59	0.14
60	0.16
61	0.15
62	0.14
63	0.14
64	0.13
65	0.13
66	0.1
67	0.1
68	0.09
69	0.1
70	0.1
71	0.15
72	0.17
73	0.21
74	0.26
75	0.32
76	0.38
77	0.45
78	0.55
79	0.59
80	0.66
81	0.71
82	0.74
83	0.76
84	0.77
85	0.79
86	0.7
87	0.63
88	0.58
89	0.53
90	0.52
91	0.46
92	0.42
93	0.36
94	0.37
95	0.36
96	0.33
97	0.28
98	0.24
99	0.24
100	0.19
101	0.16
102	0.12
103	0.12
104	0.12
105	0.13
106	0.12
107	0.12
108	0.15
109	0.19
110	0.21
111	0.21
112	0.27
113	0.34
114	0.35
115	0.39
116	0.42
117	0.47
118	0.49
119	0.5
120	0.51
121	0.47
122	0.5
123	0.47
124	0.42
125	0.33
126	0.3
127	0.33
128	0.29
129	0.25
130	0.2
131	0.17
132	0.16
133	0.18
134	0.17
135	0.14
136	0.12
137	0.1
138	0.1
139	0.11
140	0.11
141	0.1
142	0.1
143	0.11
144	0.14
145	0.15
146	0.15
147	0.14
148	0.13
149	0.14
150	0.15
151	0.15
152	0.12
153	0.11
154	0.11
155	0.11
156	0.12
157	0.11
158	0.11
159	0.11
160	0.11
161	0.11
162	0.14
163	0.14
164	0.14
165	0.14
166	0.16
167	0.15
168	0.16
169	0.19
170	0.17
171	0.19
172	0.22
173	0.27
174	0.25
175	0.25
176	0.25
177	0.22
178	0.2
179	0.17
180	0.13
181	0.08
182	0.07
183	0.06
184	0.05
185	0.05
186	0.06
187	0.06
188	0.07
189	0.14
190	0.21
191	0.3
192	0.37
193	0.43
194	0.46
195	0.52
196	0.55
197	0.54
198	0.52
199	0.48
200	0.43
201	0.39
202	0.37
203	0.31
204	0.27
205	0.21
206	0.17
207	0.12
208	0.08
209	0.07
210	0.07
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.07
218	0.06
219	0.07
220	0.08
221	0.1
222	0.11
223	0.13
224	0.18
225	0.21
226	0.27
227	0.35
228	0.34
229	0.38
230	0.43
231	0.48
232	0.47
233	0.49
234	0.47
235	0.43
236	0.43
237	0.39
238	0.35
239	0.28
240	0.24
241	0.2
242	0.15
243	0.11
244	0.11
245	0.1
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.09
250	0.09
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.08
255	0.09
256	0.1
257	0.09
258	0.08
259	0.08
260	0.09
261	0.11
262	0.1
263	0.09
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.09
268	0.08
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.07
273	0.07
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.06
287	0.05
288	0.05
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.04
300	0.05
301	0.07
302	0.08
303	0.08
304	0.1
305	0.12
306	0.13
307	0.13
308	0.13
309	0.11
310	0.11
311	0.1
312	0.1
313	0.09
314	0.09
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.12
319	0.12
320	0.11
321	0.11
322	0.12
323	0.13
324	0.16
325	0.22
326	0.22
327	0.22
328	0.27
329	0.32
330	0.35
331	0.4
332	0.43
333	0.46
334	0.53
335	0.61
336	0.67
337	0.7
338	0.71
339	0.73
340	0.73
341	0.65
342	0.61
343	0.58
344	0.55
345	0.51
346	0.48
347	0.42
348	0.37
349	0.35
350	0.3
351	0.25
352	0.17
353	0.13
354	0.12
355	0.1
356	0.1
357	0.11
358	0.11
359	0.12
360	0.14
361	0.13
362	0.13
363	0.14
364	0.13
365	0.14
366	0.14
367	0.12
368	0.15
369	0.15
370	0.18
371	0.19
372	0.21
373	0.21
374	0.25
375	0.32
376	0.33
377	0.43
378	0.49
379	0.55
380	0.6
381	0.65
382	0.66
383	0.67
384	0.73
385	0.73
386	0.7
387	0.71
388	0.72
389	0.76
390	0.81
391	0.77
392	0.74
393	0.74
394	0.75
395	0.74
396	0.75
397	0.73
398	0.69
399	0.67
400	0.67
401	0.6
402	0.59
403	0.55
404	0.49
405	0.4
406	0.36
407	0.33
408	0.26
409	0.24
410	0.18
411	0.14
412	0.15
413	0.17
414	0.16
415	0.18
416	0.21
417	0.25
418	0.25
419	0.25
420	0.22
421	0.22
422	0.24
423	0.22
424	0.2
425	0.17
426	0.17
427	0.23
428	0.25
429	0.25
430	0.24
431	0.24
432	0.24
433	0.29
434	0.34
435	0.37
436	0.44
437	0.55
438	0.64
439	0.73
440	0.82
441	0.85
442	0.9
443	0.9
444	0.89
445	0.9
446	0.9
447	0.89
448	0.88
449	0.85
450	0.75
451	0.68
452	0.6
453	0.51
454	0.41
455	0.33
456	0.27
457	0.21

A0A5N5NHZ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer