Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5NUH3

Protein Details
Accession A0A5N5NUH3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MPPAKKRKTTKSGKSKADEHVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-14KKRKTTKSGK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPAKKRKTTKSGKSKADEHVAPASQEQPEVVGASPSQQQEETQPQPETEPSLSAAPAEQPQLASSTEEKATAASPSTPAQPIPDPSAAAQDRLARFRALQDRAKKSSNANLKEATKESQRLAAATDPTQLTALGRKHAIASQKLLKAEVEDAGEDFERKRAWDWTVEESEAWDKRVRKKGAHRDNNAFQDYTRESQKVYKRQLRNMGGPDLERYTKQKLAAIERAAAAGTLEIVETEDGEMIAVDKDGSFFSTADSTSFAEHKADKDAVDRLVKDLQKAEEVSLKKRRDRMANKGDDGDVTYINEKNKQFNEKLSRFYNKYTAEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.83
3 0.8
4 0.77
5 0.68
6 0.61
7 0.57
8 0.49
9 0.43
10 0.38
11 0.34
12 0.26
13 0.25
14 0.2
15 0.15
16 0.14
17 0.14
18 0.12
19 0.1
20 0.09
21 0.12
22 0.16
23 0.16
24 0.17
25 0.17
26 0.17
27 0.22
28 0.3
29 0.33
30 0.33
31 0.34
32 0.32
33 0.34
34 0.34
35 0.33
36 0.25
37 0.22
38 0.18
39 0.18
40 0.18
41 0.16
42 0.15
43 0.13
44 0.14
45 0.14
46 0.13
47 0.12
48 0.12
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.15
57 0.14
58 0.14
59 0.12
60 0.12
61 0.1
62 0.11
63 0.12
64 0.15
65 0.15
66 0.15
67 0.17
68 0.19
69 0.2
70 0.23
71 0.23
72 0.21
73 0.2
74 0.29
75 0.26
76 0.24
77 0.23
78 0.24
79 0.25
80 0.27
81 0.28
82 0.2
83 0.2
84 0.26
85 0.32
86 0.32
87 0.38
88 0.44
89 0.5
90 0.54
91 0.57
92 0.52
93 0.47
94 0.5
95 0.52
96 0.47
97 0.43
98 0.43
99 0.42
100 0.43
101 0.42
102 0.37
103 0.31
104 0.3
105 0.27
106 0.27
107 0.26
108 0.22
109 0.22
110 0.22
111 0.19
112 0.17
113 0.19
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.13
118 0.1
119 0.14
120 0.14
121 0.13
122 0.14
123 0.13
124 0.14
125 0.17
126 0.21
127 0.17
128 0.21
129 0.25
130 0.27
131 0.27
132 0.27
133 0.24
134 0.21
135 0.2
136 0.17
137 0.11
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.09
148 0.11
149 0.12
150 0.16
151 0.19
152 0.22
153 0.23
154 0.23
155 0.22
156 0.2
157 0.22
158 0.18
159 0.17
160 0.16
161 0.18
162 0.26
163 0.35
164 0.37
165 0.4
166 0.5
167 0.6
168 0.67
169 0.73
170 0.71
171 0.7
172 0.73
173 0.72
174 0.63
175 0.52
176 0.41
177 0.36
178 0.32
179 0.27
180 0.24
181 0.19
182 0.18
183 0.25
184 0.33
185 0.37
186 0.44
187 0.51
188 0.53
189 0.6
190 0.69
191 0.66
192 0.65
193 0.6
194 0.54
195 0.46
196 0.41
197 0.35
198 0.28
199 0.25
200 0.2
201 0.2
202 0.21
203 0.23
204 0.23
205 0.24
206 0.26
207 0.31
208 0.35
209 0.34
210 0.3
211 0.28
212 0.27
213 0.24
214 0.19
215 0.13
216 0.07
217 0.05
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.12
247 0.12
248 0.13
249 0.15
250 0.15
251 0.18
252 0.19
253 0.18
254 0.2
255 0.22
256 0.24
257 0.27
258 0.26
259 0.24
260 0.3
261 0.31
262 0.3
263 0.31
264 0.28
265 0.28
266 0.29
267 0.27
268 0.27
269 0.29
270 0.35
271 0.4
272 0.45
273 0.47
274 0.53
275 0.58
276 0.62
277 0.68
278 0.71
279 0.73
280 0.75
281 0.73
282 0.69
283 0.62
284 0.52
285 0.46
286 0.37
287 0.27
288 0.2
289 0.19
290 0.2
291 0.21
292 0.27
293 0.27
294 0.32
295 0.38
296 0.44
297 0.44
298 0.51
299 0.6
300 0.57
301 0.62
302 0.62
303 0.65
304 0.61
305 0.63
306 0.62
307 0.54
308 0.55
309 0.53
310 0.51
311 0.49
312 0.48
313 0.47
314 0.44
315 0.44
316 0.39