Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DM33

Protein Details
Accession C5DM33    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
191-216PKIYLVKREQKKIRRNRRKLLQEEHEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
196-210VKREQKKIRRNRRKL
Subcellular Location(s) mito 14, mito_nucl 13.333, nucl 11.5, cyto_mito 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013881  Pre-mRNA_splic_Prp3_dom  
IPR027104  Prp3  
IPR010541  Prp3_C  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG lth:KLTH0G05610g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06544  DUF1115  
PF08572  PRP3  
Amino Acid Sequences MRARKEKGNSSSRDGNSARFGAGLDIDIHPALLSENLNLIKHRDNPYLSRERFDTVASKVSKRYSRGLKFRTPGVLAKELDEKRAWLAKERELQKEQDNLRKAKVRAGELPDESIGEQNYLITDVPQIEWWDAIYVQSPEDWTIKTKYSKSYGTMDEDSDDEQDSESESPSVRYVQHPVPVQAAEHAPSKPKIYLVKREQKKIRRNRRKLLQEEHEQKIKLGLEPKPAPKVKLSNMMSVYQNNENITDPTSWEQTVKAQAEERHQKHVETNIRRHYEAKEQKKEKAQEAPPAQAELHCRVFRFSSLRNPKIRFKLAKNSRQLGLRGVCLRVGDGAGIIVVIGSEKNCRFYSKLVLQRIDWTQSYVDKDSQQFVDCSGDEAELLWEGVVKDTRFRGWFMKECRDESELQAVLSQFDADWLLRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.54
3 0.49
4 0.45
5 0.38
6 0.28
7 0.27
8 0.2
9 0.19
10 0.16
11 0.13
12 0.12
13 0.13
14 0.13
15 0.12
16 0.1
17 0.1
18 0.09
19 0.09
20 0.09
21 0.08
22 0.13
23 0.15
24 0.16
25 0.17
26 0.2
27 0.23
28 0.3
29 0.36
30 0.38
31 0.4
32 0.44
33 0.52
34 0.59
35 0.55
36 0.52
37 0.48
38 0.44
39 0.41
40 0.39
41 0.33
42 0.26
43 0.32
44 0.32
45 0.33
46 0.34
47 0.41
48 0.44
49 0.44
50 0.5
51 0.52
52 0.58
53 0.66
54 0.69
55 0.71
56 0.68
57 0.69
58 0.65
59 0.58
60 0.53
61 0.49
62 0.48
63 0.4
64 0.39
65 0.43
66 0.38
67 0.38
68 0.34
69 0.29
70 0.26
71 0.31
72 0.3
73 0.29
74 0.33
75 0.37
76 0.45
77 0.49
78 0.53
79 0.51
80 0.54
81 0.5
82 0.54
83 0.53
84 0.53
85 0.55
86 0.49
87 0.52
88 0.56
89 0.52
90 0.49
91 0.49
92 0.45
93 0.44
94 0.48
95 0.48
96 0.41
97 0.42
98 0.36
99 0.31
100 0.27
101 0.22
102 0.16
103 0.11
104 0.1
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.09
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.14
131 0.19
132 0.23
133 0.26
134 0.29
135 0.32
136 0.35
137 0.35
138 0.37
139 0.36
140 0.37
141 0.36
142 0.31
143 0.27
144 0.25
145 0.22
146 0.18
147 0.15
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.15
162 0.17
163 0.22
164 0.22
165 0.23
166 0.23
167 0.22
168 0.2
169 0.17
170 0.16
171 0.13
172 0.13
173 0.13
174 0.14
175 0.14
176 0.16
177 0.15
178 0.17
179 0.23
180 0.26
181 0.35
182 0.42
183 0.52
184 0.55
185 0.63
186 0.69
187 0.71
188 0.76
189 0.77
190 0.79
191 0.8
192 0.85
193 0.85
194 0.87
195 0.87
196 0.84
197 0.82
198 0.77
199 0.76
200 0.73
201 0.67
202 0.61
203 0.51
204 0.44
205 0.38
206 0.32
207 0.24
208 0.23
209 0.22
210 0.25
211 0.29
212 0.32
213 0.36
214 0.37
215 0.36
216 0.34
217 0.37
218 0.32
219 0.38
220 0.38
221 0.36
222 0.36
223 0.37
224 0.35
225 0.31
226 0.31
227 0.23
228 0.22
229 0.17
230 0.16
231 0.15
232 0.14
233 0.15
234 0.13
235 0.12
236 0.12
237 0.14
238 0.13
239 0.12
240 0.12
241 0.13
242 0.19
243 0.18
244 0.18
245 0.2
246 0.22
247 0.3
248 0.4
249 0.4
250 0.42
251 0.41
252 0.41
253 0.4
254 0.46
255 0.47
256 0.45
257 0.51
258 0.51
259 0.54
260 0.54
261 0.54
262 0.48
263 0.5
264 0.52
265 0.54
266 0.56
267 0.57
268 0.62
269 0.68
270 0.69
271 0.63
272 0.63
273 0.57
274 0.56
275 0.55
276 0.53
277 0.46
278 0.43
279 0.38
280 0.3
281 0.3
282 0.25
283 0.28
284 0.25
285 0.25
286 0.25
287 0.26
288 0.27
289 0.28
290 0.27
291 0.32
292 0.41
293 0.48
294 0.54
295 0.58
296 0.63
297 0.66
298 0.71
299 0.67
300 0.64
301 0.68
302 0.7
303 0.74
304 0.75
305 0.71
306 0.65
307 0.63
308 0.57
309 0.53
310 0.45
311 0.42
312 0.36
313 0.33
314 0.3
315 0.26
316 0.25
317 0.18
318 0.16
319 0.1
320 0.07
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.04
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.04
330 0.1
331 0.11
332 0.15
333 0.17
334 0.2
335 0.22
336 0.25
337 0.34
338 0.38
339 0.46
340 0.49
341 0.51
342 0.49
343 0.53
344 0.54
345 0.49
346 0.4
347 0.33
348 0.28
349 0.29
350 0.33
351 0.3
352 0.3
353 0.3
354 0.32
355 0.34
356 0.34
357 0.32
358 0.28
359 0.26
360 0.27
361 0.22
362 0.22
363 0.19
364 0.17
365 0.14
366 0.14
367 0.14
368 0.1
369 0.1
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.11
374 0.15
375 0.14
376 0.18
377 0.2
378 0.26
379 0.26
380 0.29
381 0.33
382 0.36
383 0.45
384 0.49
385 0.57
386 0.57
387 0.58
388 0.6
389 0.57
390 0.51
391 0.47
392 0.47
393 0.38
394 0.32
395 0.33
396 0.28
397 0.25
398 0.23
399 0.19
400 0.1
401 0.1
402 0.12