Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DHT5

Protein Details
Accession C5DHT5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-112ASNAKKKAVSKPKKIEAKKKRSAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-110AKKKAVSKPKKIEAKKKRS
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito_nucl 8.5, cyto 6, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR008676  MRG  
IPR038217  MRG_C_sf  
IPR026541  MRG_dom  
IPR025995  Tudor-knot  
Gene Ontology GO:0000123  C:histone acetyltransferase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG lth:KLTH0E06974g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05712  MRG  
PF11717  Tudor-knot  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51640  MRG  
Amino Acid Sequences MPLSVDDKCLAFHGPLLYAAKVLKVHDPSNGGDDDEEIPPHLKDQQCFYIHYRGWKSSWDEWVGHDRIREYTEENLELKKQLVQETKEASNAKKKAVSKPKKIEAKKKRSAATALQEEALPTGPRITIHISHTLKSILVDDWERITKDKKLIELPCKSTVAEVLNDYYEEASAKEISPVTQSQLKEYCDGIKLYFDCSLSAILLYRFERLQYANEAADGPASSIYGAIHLLRLLSSLPELVSLTAMDERGCDVVVQQTDKLLKWLTERKTLFEESNYINTSSQYEGMALGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.18
3 0.2
4 0.19
5 0.19
6 0.19
7 0.18
8 0.18
9 0.19
10 0.22
11 0.24
12 0.25
13 0.28
14 0.31
15 0.29
16 0.32
17 0.31
18 0.25
19 0.2
20 0.21
21 0.19
22 0.17
23 0.16
24 0.13
25 0.14
26 0.14
27 0.15
28 0.19
29 0.2
30 0.21
31 0.27
32 0.33
33 0.34
34 0.38
35 0.41
36 0.44
37 0.42
38 0.49
39 0.48
40 0.43
41 0.42
42 0.43
43 0.46
44 0.42
45 0.46
46 0.41
47 0.37
48 0.37
49 0.43
50 0.4
51 0.35
52 0.31
53 0.26
54 0.25
55 0.26
56 0.24
57 0.19
58 0.21
59 0.23
60 0.24
61 0.24
62 0.24
63 0.23
64 0.23
65 0.21
66 0.19
67 0.18
68 0.21
69 0.26
70 0.27
71 0.3
72 0.34
73 0.34
74 0.37
75 0.37
76 0.33
77 0.37
78 0.36
79 0.34
80 0.35
81 0.38
82 0.43
83 0.52
84 0.59
85 0.61
86 0.68
87 0.74
88 0.78
89 0.82
90 0.83
91 0.83
92 0.83
93 0.82
94 0.8
95 0.74
96 0.68
97 0.64
98 0.6
99 0.56
100 0.5
101 0.42
102 0.35
103 0.32
104 0.28
105 0.24
106 0.19
107 0.11
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.08
113 0.11
114 0.12
115 0.14
116 0.23
117 0.23
118 0.24
119 0.25
120 0.23
121 0.2
122 0.18
123 0.17
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.09
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.13
133 0.14
134 0.18
135 0.19
136 0.2
137 0.26
138 0.31
139 0.38
140 0.41
141 0.42
142 0.41
143 0.4
144 0.37
145 0.31
146 0.27
147 0.21
148 0.17
149 0.13
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.08
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.1
165 0.1
166 0.12
167 0.16
168 0.16
169 0.19
170 0.23
171 0.23
172 0.23
173 0.23
174 0.23
175 0.2
176 0.21
177 0.17
178 0.17
179 0.16
180 0.16
181 0.18
182 0.16
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.07
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.13
196 0.13
197 0.15
198 0.16
199 0.18
200 0.16
201 0.17
202 0.17
203 0.15
204 0.15
205 0.12
206 0.09
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.06
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.07
240 0.13
241 0.16
242 0.18
243 0.17
244 0.2
245 0.23
246 0.23
247 0.26
248 0.22
249 0.2
250 0.26
251 0.35
252 0.35
253 0.43
254 0.44
255 0.45
256 0.49
257 0.51
258 0.46
259 0.4
260 0.41
261 0.35
262 0.4
263 0.38
264 0.34
265 0.31
266 0.29
267 0.29
268 0.26
269 0.22
270 0.16
271 0.14