Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DGR8

Protein Details
Accession C5DGR8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-108EETSNKWKNRSKRSHEEEEDEAcidic
145-166VDERLCRKRTSKRQKISNAIAKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013927  TF_Opi1  
Gene Ontology GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
KEGG lth:KLTH0D07546g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08618  Opi1  
Amino Acid Sequences MGNVNAKTEYKEEGIPQDIALAVEALRDLRNSHGRGQRDTLLDKVRSNTLINNAVRVYEQSKNQYPKFRKGAEIVERKALIPMVKRLEETSNKWKNRSKRSHEEEEDEEEGSQSDEDYCEQDEYDEESDNFMDRATAVNDEVLLVDERLCRKRTSKRQKISNAIAKSKVNLKGYQLDMSIESKKRLVTCLHLLKLANYQLSNRVGFLQNLVFKEQQLRRGRLRGHDIDSDEEEEFYDASDSIDEQSNVVKMEIVRTVKKVYTLISKFTGNSLPEPARTQVRESLLKLPMNWTSTMNSENLARYTNSKGVSPNGKVLILAKESLGMVHNVMNVVDSTLGKAEEWVKQKQEIKELLKEQFLDSRLREKVKKQMSEEKEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.29
3 0.27
4 0.24
5 0.22
6 0.19
7 0.16
8 0.11
9 0.07
10 0.07
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.08
15 0.09
16 0.16
17 0.24
18 0.26
19 0.35
20 0.4
21 0.44
22 0.48
23 0.52
24 0.51
25 0.48
26 0.48
27 0.46
28 0.47
29 0.46
30 0.44
31 0.42
32 0.4
33 0.37
34 0.36
35 0.33
36 0.32
37 0.37
38 0.35
39 0.35
40 0.31
41 0.29
42 0.28
43 0.27
44 0.25
45 0.22
46 0.27
47 0.31
48 0.39
49 0.47
50 0.52
51 0.59
52 0.61
53 0.66
54 0.69
55 0.65
56 0.62
57 0.58
58 0.62
59 0.62
60 0.65
61 0.57
62 0.55
63 0.52
64 0.47
65 0.44
66 0.36
67 0.29
68 0.24
69 0.28
70 0.28
71 0.29
72 0.29
73 0.3
74 0.35
75 0.38
76 0.41
77 0.45
78 0.49
79 0.51
80 0.57
81 0.62
82 0.64
83 0.7
84 0.74
85 0.72
86 0.73
87 0.79
88 0.83
89 0.8
90 0.76
91 0.69
92 0.64
93 0.55
94 0.45
95 0.36
96 0.26
97 0.21
98 0.16
99 0.12
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.11
111 0.12
112 0.12
113 0.11
114 0.11
115 0.12
116 0.12
117 0.11
118 0.08
119 0.06
120 0.05
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.05
132 0.06
133 0.09
134 0.12
135 0.16
136 0.18
137 0.18
138 0.24
139 0.35
140 0.45
141 0.54
142 0.62
143 0.67
144 0.75
145 0.82
146 0.84
147 0.82
148 0.8
149 0.73
150 0.66
151 0.61
152 0.51
153 0.44
154 0.42
155 0.39
156 0.33
157 0.29
158 0.28
159 0.29
160 0.3
161 0.3
162 0.24
163 0.19
164 0.18
165 0.19
166 0.21
167 0.17
168 0.16
169 0.16
170 0.17
171 0.17
172 0.18
173 0.17
174 0.17
175 0.23
176 0.28
177 0.28
178 0.29
179 0.28
180 0.27
181 0.29
182 0.26
183 0.2
184 0.14
185 0.14
186 0.16
187 0.18
188 0.18
189 0.14
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.14
195 0.15
196 0.16
197 0.18
198 0.16
199 0.15
200 0.23
201 0.24
202 0.3
203 0.34
204 0.38
205 0.39
206 0.45
207 0.48
208 0.45
209 0.51
210 0.46
211 0.43
212 0.43
213 0.4
214 0.37
215 0.35
216 0.32
217 0.24
218 0.19
219 0.15
220 0.12
221 0.1
222 0.08
223 0.07
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.08
238 0.1
239 0.15
240 0.17
241 0.18
242 0.19
243 0.22
244 0.21
245 0.23
246 0.22
247 0.2
248 0.27
249 0.27
250 0.28
251 0.28
252 0.29
253 0.27
254 0.28
255 0.3
256 0.22
257 0.21
258 0.23
259 0.22
260 0.23
261 0.25
262 0.25
263 0.27
264 0.27
265 0.28
266 0.28
267 0.32
268 0.34
269 0.35
270 0.39
271 0.39
272 0.39
273 0.36
274 0.34
275 0.33
276 0.31
277 0.3
278 0.24
279 0.2
280 0.21
281 0.22
282 0.19
283 0.17
284 0.16
285 0.17
286 0.16
287 0.17
288 0.15
289 0.17
290 0.21
291 0.25
292 0.24
293 0.24
294 0.25
295 0.29
296 0.36
297 0.36
298 0.36
299 0.34
300 0.33
301 0.31
302 0.31
303 0.29
304 0.24
305 0.22
306 0.16
307 0.15
308 0.15
309 0.16
310 0.14
311 0.1
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.11
316 0.11
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.1
325 0.09
326 0.12
327 0.15
328 0.2
329 0.25
330 0.3
331 0.32
332 0.39
333 0.46
334 0.48
335 0.53
336 0.55
337 0.56
338 0.59
339 0.62
340 0.59
341 0.56
342 0.53
343 0.46
344 0.43
345 0.4
346 0.37
347 0.33
348 0.37
349 0.4
350 0.46
351 0.49
352 0.5
353 0.58
354 0.62
355 0.67
356 0.67
357 0.71