Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DG60

Protein Details
Accession C5DG60    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-114EEAPAQPKKLSKRQKRKALDADNENLHydrophilic
363-391NGTGRKLRVTRCKNMKKTQPSSQKHPKALHydrophilic
425-456ATKGASTPILKKKKQRSKSGRVTKRSTAFKKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
91-105APAQPKKLSKRQKRK
432-456PILKKKKQRSKSGRVTKRSTAFKKA
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13.166, mito_nucl 9.499, cyto 8.5, cyto_mito 5.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG lth:KLTH0D02640g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGSIDKLFGPAASKVESGLSKLFGSSAGPVDVAKVKSKIRTVLPGVEPEAKPETKEASAEASTEQGSQGEGESGSEEGAKPAKRGLEAEEAPAQPKKLSKRQKRKALDADNENLESEYYSKLLEKEQGEAEETSAAEPESKDGEAEASVQATAASASRKDLKEEELQKAERTVFVGNVPVDVVTSKPLKKQFKKLFAVAKKHSGGDDSDEDKATGPDTFAVESIRFRSISFEEALPRKVAFVQQKLHKSRDSANAYVVYAEKAAVKAACQTLNGTVFYDHHLRVDSVAHPAQHDNKRSVFVGNLDFEEAEENLWKHFEKSGEIEYVRVVRDSKTNMGKGFAYVQFRDFQDINKALLLNDQKLNGTGRKLRVTRCKNMKKTQPSSQKHPKALTDDQRTKLGRAKKVLGKADRSTVGKDVTIEGLRATKGASTPILKKKKQRSKSGRVTKRSTAFKKANASNSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.21
3 0.21
4 0.21
5 0.21
6 0.2
7 0.18
8 0.18
9 0.18
10 0.14
11 0.14
12 0.14
13 0.14
14 0.12
15 0.12
16 0.12
17 0.15
18 0.2
19 0.21
20 0.23
21 0.25
22 0.29
23 0.34
24 0.39
25 0.42
26 0.41
27 0.47
28 0.48
29 0.52
30 0.51
31 0.49
32 0.49
33 0.5
34 0.46
35 0.41
36 0.43
37 0.35
38 0.32
39 0.31
40 0.31
41 0.25
42 0.26
43 0.23
44 0.22
45 0.22
46 0.22
47 0.2
48 0.17
49 0.16
50 0.16
51 0.15
52 0.1
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.09
65 0.14
66 0.15
67 0.15
68 0.17
69 0.2
70 0.2
71 0.22
72 0.25
73 0.29
74 0.28
75 0.32
76 0.34
77 0.32
78 0.34
79 0.34
80 0.3
81 0.23
82 0.27
83 0.32
84 0.36
85 0.47
86 0.55
87 0.65
88 0.75
89 0.84
90 0.86
91 0.88
92 0.89
93 0.88
94 0.85
95 0.8
96 0.75
97 0.68
98 0.6
99 0.5
100 0.39
101 0.29
102 0.21
103 0.15
104 0.11
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.1
109 0.12
110 0.17
111 0.17
112 0.19
113 0.21
114 0.21
115 0.22
116 0.22
117 0.2
118 0.15
119 0.14
120 0.11
121 0.1
122 0.09
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.08
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.09
144 0.15
145 0.16
146 0.18
147 0.2
148 0.22
149 0.3
150 0.35
151 0.38
152 0.37
153 0.38
154 0.36
155 0.37
156 0.33
157 0.25
158 0.22
159 0.17
160 0.12
161 0.11
162 0.14
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.11
172 0.12
173 0.17
174 0.25
175 0.35
176 0.4
177 0.51
178 0.57
179 0.64
180 0.67
181 0.68
182 0.7
183 0.67
184 0.7
185 0.62
186 0.6
187 0.51
188 0.47
189 0.42
190 0.33
191 0.26
192 0.22
193 0.22
194 0.17
195 0.17
196 0.17
197 0.17
198 0.16
199 0.15
200 0.12
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.12
215 0.12
216 0.14
217 0.14
218 0.13
219 0.16
220 0.17
221 0.18
222 0.16
223 0.15
224 0.13
225 0.13
226 0.17
227 0.18
228 0.21
229 0.26
230 0.32
231 0.41
232 0.45
233 0.47
234 0.43
235 0.41
236 0.42
237 0.45
238 0.44
239 0.36
240 0.35
241 0.33
242 0.31
243 0.29
244 0.24
245 0.15
246 0.09
247 0.09
248 0.07
249 0.06
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.09
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.13
259 0.15
260 0.15
261 0.12
262 0.11
263 0.11
264 0.13
265 0.16
266 0.14
267 0.13
268 0.14
269 0.13
270 0.13
271 0.15
272 0.13
273 0.15
274 0.16
275 0.15
276 0.16
277 0.18
278 0.25
279 0.29
280 0.32
281 0.3
282 0.3
283 0.32
284 0.32
285 0.31
286 0.23
287 0.2
288 0.2
289 0.18
290 0.17
291 0.16
292 0.14
293 0.14
294 0.14
295 0.11
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.09
303 0.12
304 0.13
305 0.13
306 0.17
307 0.19
308 0.23
309 0.23
310 0.22
311 0.21
312 0.22
313 0.2
314 0.18
315 0.16
316 0.12
317 0.17
318 0.2
319 0.26
320 0.3
321 0.33
322 0.32
323 0.34
324 0.33
325 0.29
326 0.31
327 0.28
328 0.26
329 0.23
330 0.24
331 0.26
332 0.26
333 0.29
334 0.24
335 0.22
336 0.26
337 0.27
338 0.26
339 0.24
340 0.24
341 0.2
342 0.25
343 0.26
344 0.22
345 0.22
346 0.22
347 0.21
348 0.22
349 0.26
350 0.23
351 0.25
352 0.28
353 0.31
354 0.38
355 0.42
356 0.48
357 0.56
358 0.61
359 0.66
360 0.71
361 0.77
362 0.78
363 0.84
364 0.86
365 0.86
366 0.86
367 0.86
368 0.86
369 0.82
370 0.83
371 0.84
372 0.83
373 0.79
374 0.76
375 0.71
376 0.68
377 0.7
378 0.7
379 0.7
380 0.69
381 0.65
382 0.68
383 0.64
384 0.59
385 0.57
386 0.55
387 0.52
388 0.51
389 0.56
390 0.55
391 0.62
392 0.68
393 0.69
394 0.68
395 0.64
396 0.63
397 0.6
398 0.56
399 0.5
400 0.45
401 0.4
402 0.33
403 0.31
404 0.26
405 0.25
406 0.24
407 0.21
408 0.18
409 0.19
410 0.18
411 0.17
412 0.16
413 0.13
414 0.13
415 0.16
416 0.19
417 0.22
418 0.3
419 0.41
420 0.51
421 0.55
422 0.64
423 0.72
424 0.78
425 0.83
426 0.85
427 0.86
428 0.87
429 0.92
430 0.93
431 0.93
432 0.91
433 0.89
434 0.87
435 0.85
436 0.85
437 0.8
438 0.79
439 0.76
440 0.74
441 0.77
442 0.75